FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0134.ptfa, 1167 aa vs ./tmplib.26680 library 1767850 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9166+/-0.00515; mu= 20.8429+/- 0.347 mean_var=136.3102+/-31.505, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1099 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 1209 204 1.2e-52 mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224) 858 148 6.5e-36 mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417) 624 111 1e-24 mKIAA0577 ( 1048 res) mbg07362a (1048) 558 101 1.2e-21 mKIAA0890 ( 1057 res) mbg06494 (1057) 503 92 5.2e-19 mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 ( 937) 492 90 1.6e-18 mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 371 71 6.3e-13 >>mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264 aa) initn: 1238 init1: 437 opt: 1209 Z-score: 1037.6 bits: 204.1 E(): 1.2e-52 Smith-Waterman score: 1322; 37.175% identity (39.619% ungapped) in 616 aa overlap (137-738:558-1149) 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 PGMPKHGIAALADLPLTYDPRYRINLSILSPDTRGRHGP----GRGLPPERVSEFRRALL ::..::. : :. :. . :... mKIAA4 KERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK--- 530 540 550 560 570 580 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 HYLDFQQKQAFGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVP : . .: ..:. .... ..: .::: . ....:.....:...: :.:: ::.::. mKIAA4 HAFG-GNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQIT 590 600 610 620 630 640 230 240 250 260 270 mKIAA0 QYLLAAGFS---HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIV ::: ::.. ...::::::.: .:.::::. : :..::: ::::. : : : mKIAA4 QYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIK 650 660 670 680 690 700 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 FLTVGLLLRQIQREPSLPQYQVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPQRPDLKVILMSAT ..: :.:::. .:.: :: ....::.::: .:.: :.:.:.. . .: :.:.:. ::: mKIAA4 YMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSAT 710 720 730 740 750 760 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 INISLFSSYFSHAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEADQTASKSEKLDPRPFLRVLEAIDNKY .. ::.:: .::. .::: .:. ..: . ... :: .. :.. : mKIAA4 LDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEP------ETDYLDAS-LITVMQ-IHLTE 770 780 790 800 810 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 PPEERGDLLVFLSGMAEITTVLDAA-QAYASL---TQRWVVLPLHSALSVSDQDKVFDVA :: ::.::::.:. :: :. . . . :: . . ..::..::: : ..:: : mKIAA4 PP---GDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPA 820 830 840 850 860 870 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 PAGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRK : : :: ...:::::::.::::: .::: : ::. :. .. ...: ::::.:.:: mKIAA4 PPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRA 880 890 900 910 920 930 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 GRAGRTGPGVCYRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDALVLQMKSMSVGDPRTFPFIEP ::::::::: :::::.: : : . ::::.:. : . ::..:.:...: .: :.. mKIAA4 GRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDA 940 950 960 970 980 990 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 PPPASVETAILYLQEQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLAEPVLTI :: .. ::. : ::::. :: .: .:..:.. .. ::::.. .. .: .::: mKIAA4 PPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTI 1000 1010 1020 1030 1040 1050 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 AAALSVQSPFTRSAQSNLDCATARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSGNSRKWCR .. ::::. : : ... . ... .:: .::. :.:.: :... .: :: mKIAA4 VSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSW---KNNKFSNP--WCY 1060 1070 1080 1090 1100 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 RRGVEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLSGAQVVAPGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQH . .. . : . ..:.:. ... : : .::. : : :.:. mKIAA4 ENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKL----DVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKD 1110 1120 1130 1140 1150 1160 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 EEGGGRRRKVLRLQEDGCSSDEEDRKGSTSQRADSVDIQDVKFKLRHNLEQLQAAASSAQ mKIAA4 PQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPA 1170 1180 1190 1200 1210 1220 >>mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224 aa) initn: 1206 init1: 427 opt: 858 Z-score: 737.1 bits: 148.4 E(): 6.5e-36 Smith-Waterman score: 1145; 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