FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0080.ptfa, 353 aa vs ./tmplib.26680 library 1768664 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3140+/-0.00485; mu= 11.2317+/- 0.324 mean_var=105.8682+/-23.747, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1247 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1342 ( 499 res) mid23032 ( 499) 1245 234 1.2e-62 mKIAA4194 ( 320 res) mbg12940 ( 320) 788 152 5e-38 mKIAA1427 ( 443 res) mbg18863 ( 443) 408 84 2.3e-17 mKIAA0985 ( 684 res) mbp05185 ( 684) 283 61 1.8e-10 mFLJ00227 ( 590 res) mtk02576 ( 590) 269 59 9.3e-10 mKIAA0538 ( 826 res) msh37311 ( 826) 256 57 5.8e-09 mKIAA1597 ( 407 res) mnh09216 ( 407) 248 55 9.9e-09 mKIAA0439 ( 442 res) mbg08890 ( 442) 194 45 8.8e-06 mKIAA0093 ( 904 res) mbg10506 ( 904) 187 44 3.4e-05 mFLJ00067 ( 891 res) msh44296 ( 891) 184 44 4.9e-05 mKIAA0734 ( 1159 res) mbg10039 (1159) 179 43 0.00011 mKIAA0751 ( 1297 res) mpg01166 (1297) 178 43 0.00013 mKIAA0340 ( 983 res) mbg15521 ( 983) 171 41 0.00026 mKIAA4186 ( 899 res) mfj00029 ( 899) 151 38 0.003 >>mKIAA1342 ( 499 res) mid23032 (499 aa) initn: 921 init1: 811 opt: 1245 Z-score: 1217.0 bits: 234.2 E(): 1.2e-62 Smith-Waterman score: 1245; 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