FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1389.ptfa, 1185 aa vs ./tmplib.26680 library 1767832 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5871+/-0.00602; mu= 5.9923+/- 0.400 mean_var=200.5884+/-47.176, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0906 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510) 2798 379 2.9e-105 mKIAA4074 ( 1099 res) mfj12253 (1099) 1312 185 6.5e-47 mKIAA0545 ( 886 res) mpm03375 ( 886) 774 114 8.1e-26 mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 ( 726) 665 100 1.4e-21 mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 ( 467) 234 44 9e-05 mKIAA1039 ( 336 res) mbg02540 ( 336) 218 41 0.0003 >>mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510 aa) initn: 3563 init1: 2071 opt: 2798 Z-score: 1982.1 bits: 379.1 E(): 2.9e-105 Smith-Waterman score: 3745; 52.269% identity (58.392% ungapped) in 1278 aa overlap (1-1182:269-1508) 10 20 30 mKIAA1 TSELTTLRGAILEDAVPSTARHGTARGLPL :::: ::::..::::.::::.:.::::::: mKIAA0 LGPVAVSIRREKPEDMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPL 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 KEVLEYVIPELSIQCLRQAANSPKVPEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCRAGQSTEEEMYN :::::.:::::..:::: : :.::: :::.:::::::..:.:.::.::.::::::::::: mKIAA0 KEVLEHVIPELNVQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYN 300 310 320 330 340 350 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 NETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDFELMFHVSTLL ::.:::::::::.:::.::::::: :::::::.::::::::::::::::.:.::::::.: mKIAA0 NESAGPAFEEFLQLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTML 360 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 PYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVC :: :::.::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::..::::::.:: mKIAA0 PYTPNNKQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRAHNPCTESVC 420 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 YSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQ :::.:.::.::: :::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA0 YSVAVTRSRDVPSFGPPIPKGVTFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQ 480 490 500 510 520 530 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 EYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSIGAIMWHVVARDFGQ ::::::::. ::.. .: :.:: ::.:..::::. :: :.: :.:::.: : :.:... mKIAA0 EYLKDLAEKNVTNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAKDYNK 540 550 560 570 580 590 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 SADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAFYERGECLLLSSVD . ...::::::.:::.:::...:.:.:::::::::::::. .:.: :::::::. . : mKIAA0 AMEFDCLLGISSEFIVLIEQETKSVAFNCSCRDVIGWTSSDTSLKIFYERGECVSVESFI 600 610 620 630 640 650 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 NRSEDIREIVQRLLIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLR . .:::.:::.:: .:..:::.::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.:::: mKIAA0 S-GEDIKEIVRRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAGLR 660 670 680 690 700 710 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 QGSRLVEICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHEDGSPRRGCSELCRIPMVEYK ::::::::::::::::.::::::::::::::::::: ::.: .:::.::: :.:..::. mKIAA0 QGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVMEYQ 720 730 740 750 760 770 520 530 540 550 mKIAA1 LDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHR----------VPTPALQPV-SRASPVPGTPDRLQCQPL .. :: :.: ::: :. :.: ::. .:. :: . : : . : mKIAA0 MN-EGISYEFKFPFRNNNKWQRNASKGAHSPQVPSQLQSPMTSRLNA--GKGDGKMPPP- 780 790 800 810 820 830 560 570 580 590 mKIAA1 LQQAQAAIPRSTSFD-----RKLPDGT----------------RSSPSNQSSSSDPGPGG . : :::: : : :.: :. :.:::: ::::. : :: mKIAA0 --ERAANIPRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVSSMALARSQCRNSPSNLSSSSETGSGG 840 850 860 870 880 890 600 610 620 630 640 mKIAA1 SGPWRPQVGYDGCP----SPLLLEHQGPGSVECDGTGEQ-------EDLLEGGRLPETKW : .: . .: :: ...:. : . .:.:.. :: : : mKIAA0 -GTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQS-DISGSGKSTPSWQRSEDSLADQMEPTC-- 900 910 920 930 940 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 HGPP-SKVLSSYKE----RVLQKDGSCKESPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSNTSSNSD : : :::: ...: :....: . :::: .: .:. ::::::::::::.:: . mKIAA0 HLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQDPVVHLSPNKQGH-SDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHS 950 960 970 980 990 1000 710 720 730 740 750 mKIAA1 DKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTT---PCMPATILGPVHLTGSRSL--MHSR :... .:: . .: . .:..:.:.::::::. : .: . .. :: .. mKIAA0 DEKWYDGDRTESDLNSYNYLQGTSADSGIDTASYGPSHGSTASLGASTSSPRSGPGKEKV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 760 770 780 790 800 mKIAA1 AEQWADAADV-SVAD----------DDPAKM---YALHGYASAISSSAA-DGSMGDLSEV : : ....: :.:: : :. .:. ... :: . ..: ..... mKIAA0 APLWHSSSEVLSLADRTLETEGHGMDRKAESSLSLDIHSKSQGGSSPLSRENSTFSINDA 1070 1080 1090 1100 1110 1120 810 820 830 840 850 mKIAA1 SSHSS--GSQHSGSPSAHCSKSTSSLD------SSKVYIVTHGGGQQAPGAVTKPYHRQG .::.: .:.::.:: . : .: . ::.. ...... : : : ::: mKIAA0 ASHTSTMSSRHSASPVVFSSARSSPKEELHPTASSQLAPSFSSSSSSSSGPRTF-YPRQG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 AANKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPRIYGEMDIMSTATQHPAV-VGDSVSETQHVLSK :..::.::::: ::. :. . .: : . . . : . :.. . mKIAA0 ATSKYLIGWKKPEGTINSVGFMDTRKRHQSDGNEIAHTRLRASTRDLQASPKPTSKSTIE 1190 1200 1210 1220 1230 1240 920 930 940 950 960 mKIAA1 DDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNVSP----------RRSLYRTLSDESVCSNRRGSS .:. ::. .:: . :....:.:.. :: ::.:.:::::::. :..: mKIAA0 EDLKKLIDLESP-TPESQKNFKFHALSSPQSPFPTTPTSRRALHRTLSDESIYSSQR-EH 1250 1260 1270 1280 1290 1300 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 FASSRSSILEQALPNDILFSTT-PPYHSTLPPRTHPAPSMG--SLRNEFWFSDGSLSD-- : .::.:.:.::::::.:::.: : ..:: : .:. ..: ::..:: ::.::.: mKIAA0 FFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLR-RPSYTLGMKSLHGEFSASDSSLTDIQ 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 ---KSKCADPGLMPLPDTAAGLDWSHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHASYLDQRVASF .. :::::::::.:. ::::.:::::.:.: :: ::: mKIAA0 ETRRQPIPDPGLMPLPDAASDLDWSNLVDAAKAYEV------------------QR-ASF 1370 1380 1390 1400 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 CTLTDLQHGQELEGAPELSLCVDPTSGKEFMDTPGEQSPS-TLTGKVNQLELILRQLQTD . .: .: . : .: . . . . . : . . ..:: ::..::.::: .:..:. : mKIAA0 FAASDENH-RPLSAASNSDQLEEQALVQ--MKSYSSKDPSPTLASKVDQLEGMLKMLRED 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA1 LRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFSTIDKKA :.:::.::: :::::.:::.::.:::::::.:. .:.::::: :.::: mKIAA0 LKKEKEDKAQLQAEVEHLREDNLRLQEESQNASDKLKKFTEWVFNTIDMS 1470 1480 1490 1500 1510 >>mKIAA4074 ( 1099 res) mfj12253 (1099 aa) initn: 1883 init1: 1004 opt: 1312 Z-score: 934.6 bits: 184.8 E(): 6.5e-47 Smith-Waterman score: 1774; 46.761% identity (49.333% ungapped) in 633 aa overlap (1-613:324-943) 10 20 30 mKIAA1 TSELTTLRGAILEDAVPSTARHGTARGLPL :..: ::::.: :::.: : ::: mKIAA4 ALGPVAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSP 300 310 320 330 340 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 KEVLEYVIPELSIQCLRQAANSPKVPEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCRAGQSTEEEMYN ...::.: :.:: ::: .. :::::. :: :::: ::::.:.:::::::::..:::::: mKIAA4 RKLLEHVAPRLSPTCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYN 350 360 370 380 390 400 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 NETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDFELMFHVSTLL :. :: :: .:: :::. :::::: .::::::.::::::::::::::.: :.::::::.: mKIAA4 NQEAGAAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTML 410 420 430 440 450 460 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 PYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVC :: :::.::::::::::::::::::::::. :: : .:::::::::..:..: ::: .. mKIAA4 PYTPNNQQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHAPCTPHTS 470 480 490 500 510 520 220 230 240 250 260 mKIAA1 YSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGV-TFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTR : :.:::..:.: ::: .:.: : .: :: :::::..:.:.:: ....:.::::::: mKIAA4 YRVAVSRTQDTPAFGPALPEGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTR 530 540 550 560 570 580 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 QEYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLGAKKKERVKPRKD-AHLFSIGAIMWHVVARDF :.::.::: : :::...:....:.. .::... :. ::. :.: . ::.:: : : mKIAA4 QQYLQDLATNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRR--RATPRSPGAELQAAGALMWGVRAAPG 590 600 610 620 630 640 330 340 350 360 370 mKIAA1 GQ-----------SADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAF .. .:.. :::::: : ..:. . :::::.::::..:: . .. . mKIAA4 ARVAAGAETSGPDDAEVPCLLGISAETLVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEHQLDLY 650 660 670 680 690 700 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 YERGECLLLSSVDNRSEDIREIVQRLLIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVAD . ::: . : .. . :.: :: .:.::::: :..: :.: :.:::.:. ::... mKIAA4 HGRGEAITLRLDGAPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFITH 710 720 730 740 750 760 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 VEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHEDGSPRRG :: : :: .::: :.::...: .. : : ..::.. : :... : :.: :::. mKIAA4 VERFTFAETTGLRPGARLLRVCGQTLPKLGPETAAQMLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRS 770 780 790 800 810 820 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 CSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQPV-----SRASPVPGTPD ::: . . : . .: : : . .: . :. : . . .:: :: : mKIAA4 FSELYMLSLKEPS--RRGGP----EPVQDETGKLVILPPTKQLLHFCLKDSSSP-PGPGD 830 840 850 860 870 880 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 RLQCQPLLQQAQAAIPRSTSFDRKLPDGTRSSPSNQ-SSSSDPG-PGGSGPWRPQVGYDG . . . ... .. ..:.. . : ..:. ....:. :: . :. .: mKIAA4 LTEERTEFLRSHNSLSSGSSLSDEAPVLPNTTPDLLLVTTANPSAPGTDRETPPSQDQSG 890 900 910 920 930 940 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 CPSPLLLEHQGPGSVECDGTGEQEDLLEGGRLPETKWHGPPSKVLSSYKERVLQKDGSCK :: mKIAA4 SPSSHEDTSDSGPELRASILPRTLSLRNSISKIMSEAGSETLEDEWQSISEIASTCNTIL 950 960 970 980 990 1000 >>mKIAA0545 ( 886 res) mpm03375 (886 aa) initn: 1449 init1: 661 opt: 774 Z-score: 555.9 bits: 114.4 E(): 8.1e-26 Smith-Waterman score: 1480; 38.702% identity (45.526% ungapped) in 894 aa overlap (367-1177:37-879) 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 LLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAFYERGECLLLSSVDNRSEDI :: .:: :: ::. ..:..... ::: mKIAA0 RIQHGWEDVSTTHSPWPAASALSAPLSHRIWTPDSSTIKIFYGRGDHIFLQAAEGSVEDI 10 20 30 40 50 60 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 REIVQRLLIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLV :.::::: ..: : :::.:::::::::::::::...: ::.:: .::::.:::::::::: mKIAA0 RDIVQRLKVMTNGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVKYDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLV 70 80 90 100 110 120 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 EICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHEDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGT :::::::.::.:.::::::::::::::::: : :::.:::: : . : : .:: : mKIAA0 EICKVAVVTLSHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPFEDGTPRRGWPETYDMNASEPKTESETT 130 140 150 160 170 180 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 PCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQPVSRASPVPGTPDRLQCQPLLQQAQAAIPRSTSFDRK . :.: :. :. :.:. : .:.: : :. . .:..: mKIAA0 TPGGRPPYRSNAPWQWSG-----PASHNS-LPATKWTTPATPGHAQSLSRLPKQTPV--- 190 200 210 220 230 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 LPDGTRSSPSNQSSSSDPGPGGSGPWRPQVGYDGCPSPLLLEHQGPGSVECDGTGEQEDL .: : : .:. .: . :. .:: : :. : ::. mKIAA0 VP--FRESQPLHSKRYAAAPHPLLSFDPHFMHDGMSS---------GDSSSGGLTSQEST 240 250 260 270 280 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 LEGGRLPETKWHGPPSKVLSSYKERVLQK-----DGSCKESPNKLSHIGDKSCSSHSSSN .: . :: :: : . ::.. . .: :.. :.:::. :. :. . ::::::: mKIAA0 MERPK-PEPLWHVPAQARLSAMTGSIGSKHPSRQDAAGKDSPNRHSK-GEPQYSSHSSSN 290 300 310 320 330 340 700 710 720 730 mKIAA1 TLSSN-TSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTT-----P-CM------- ::::: .::.:::. : : ..:: .. ::.:.::::::: : :: mKIAA0 TLSSNASSSHSDDRWFDPLDPLEPEQDPFS--KGGSSDSGIDTTLYTSSPSCMSLAKAPR 350 360 370 380 390 400 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 ---PATILGPVHLTGSRSLMHSRAEQWADAADVSVADDDPAKMYALHGYASAISSSAA-- : : . : :. .: . .:: : :. .:: . ::.. mKIAA0 PTKPHKPPGNIGLCGGGRESAGRPHPVDRRREVSPA---PVVAGQNKGYRPKLYSSGSCT 410 420 430 440 450 800 810 820 830 840 mKIAA1 -DGSMGDLSEVSSHSS--GSQHSGSPSAHCSKSTSSLDSSKVYIVTHGGGQQAPGAVTKP : .: . . : ::. .: :. .:.: .. . ... . : .: : mKIAA0 PPGLVGGSRDPPRQPSDMGSR-AGYPTQ--VYKTASAETPRPSQLSQCSPFQLSTSVPKS 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 YH-RQGAANKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPRIYGEMDIMSTATQHPAVVGDSVSETQ . .: : ::. :::... :: : . .. . . . : . : : . mKIAA0 FFSKQPAHNKHSTGWKRTDEPPPRPLPFTDSKKQVDTNAKNVFGQPRLRASLRDLRSPRK 520 530 540 550 560 570 910 920 930 940 mKIAA1 HVLS--KDDFLKLMLPDS--PLVEEG----RRKFSF----------------YGNVSPR- . : .::. ::.. :. : :. .::.:. :. ::. mKIAA0 NYKSTIEDDLKKLIVMDNLGPEQERDTGSPKRKWSYPLFRSQPQAERAPRNYLGSHSPKT 580 590 600 610 620 630 950 960 970 980 990 mKIAA1 ----RSLYRTLSDESVCSNRRGSSFASSRSSILEQALPNDILFSTTPPY-HSTLPPR--- .:: :::::::.::.:: :::: : :: .::.:.::..: . :::: : mKIAA0 QSPQKSLQRTLSDESLCSGRREPSFASPAS--LEPGLPSDVLFTSTCTFPSSTLPARRQH 640 650 660 670 680 690 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 --THP-------APSMGS----LRNEFWFSDGSLSDKS----KCADPGLMPLPDTAAGLD .:: .:. :. .. . :. ::.: . :::.::::::::::. mKIAA0 QHAHPPSGAPSTTPATGNGFPEKKSAISASELSLADGRDRPLRRLDPGMMPLPDTAAGLE 700 710 720 730 740 750 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 WSHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHASYLDQRVASFCTLTDLQHGQELEGA--P---EL :: ::.::.:.: ::..:. .:.: . :. : : .: mKIAA0 WSSLVNAAKAYEV------------------QRAVSLFSLNDPALSPEIPPAHSPVHSHL 760 770 780 790 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 SLCVDPTSGKEFMDTPGEQSPSTLTGKVNQLELILRQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLR :: : . . : .:.:: ::::: :::..:.::.:::.::::::.:::.:: :: mKIAA0 SLERGPQTPRA-TPTMSEESPLDLTGKVYQLEVMLKQLHTDLQKEKQDKVVLQSEVASLR 800 810 820 830 840 850 1160 1170 1180 mKIAA1 QDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFSTIDKKA :.:.:::::::.:. :::::.: : mKIAA0 QNNQRLQEESQAASEQLRKFAELFSREKKEL 860 870 880 >>mKIAA0474 ( 726 res) mbe00481 (726 aa) initn: 704 init1: 411 opt: 665 Z-score: 480.0 bits: 100.1 E(): 1.4e-21 Smith-Waterman score: 665; 44.298% identity (44.493% ungapped) in 228 aa overlap (53-280:238-464) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 GTARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQAANSPKVPEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCRAGQ ::. . .. .::. .: . :.:..: . :: mKIAA0 SCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQ 210 220 230 240 250 260 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 STEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDFEL ..:::..... .::: :::..:::.:.:. :. .:. :: .:::.:.: .... :. mKIAA0 TSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEI 270 280 290 300 310 320 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 MFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVH :::::: ::: .. ::: ::::::::::..:::. .. ::.: : :.: :..:.:... mKIAA0 MFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENT-PFVPDMIASNFLHAYVVVQAE 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 NPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFR . .. :.:.:. ::: ::::.: ..: :. :..:::.:.:::: : .:.::: mKIAA0 GGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFA 390 400 410 420 430 440 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 AMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSIGAIMWH . ::: :. : :.. mKIAA0 KLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGSDDDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMD 450 460 470 480 490 500 >>mKIAA1272 ( 467 res) mic25008 (467 aa) initn: 243 init1: 109 opt: 234 Z-score: 178.1 bits: 43.6 E(): 9e-05 Smith-Waterman score: 248; 27.273% identity (28.571% ungapped) in 242 aa overlap (54-294:224-455) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 TARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQAANSPKVPEQLLKLDEQGLSFQHKIGILYCRAGQS :. ..: .:: . :::...: :: mKIAA1 PFYFCRLLLDDLGMNSWDRRKNFHLLKKNSKLLRELKNLDSRQCRETHKIAVFYIAEGQE 200 210 220 230 240 250 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 TEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTGTHSLYTTYKDFELM . . :: .. :.:.:. :: .: :. . . :. .. ::: . : . . :.. mKIAA1 DKCSILANERGSQAYEDFVAGLGWEVDLSTHCGFMGGLQ-RNGSTGQTAPYYATSTVEVI 260 270 280 290 300 310 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 FHVSTLLPYMPNNRQQLLRK-RHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVH ::::: .: . .. .: .: ::.::: : ::..: . . : . : : .:. mKIAA1 FHVSTRMPSVSDD--SLTKKLRHLGNDEVHIVWSEHSR-DYRRGIIPTAFGDVSIIIY-- 320 330 340 350 360 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 NPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFR : .: . . .... .:: ::: . ... : .. ... : ::: :.. . mKIAA1 -P-MKNHMFFITITKKPEVPFFGPLFDGAIVSGK--LLPSLICATCINASRAVKCLIPLY 370 380 390 400 410 420 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 AMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLGAKKKERVKPRKDAHLFSIGAIMWH . : ::. . .: . : . : : mKIAA1 QSFYEERALYLEAIIQNHREVMTFEDFAAQVFSPSPSYSVSGTD 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 VVARDFGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAFYERGE >>mKIAA1039 ( 336 res) mbg02540 (336 aa) initn: 249 init1: 216 opt: 218 Z-score: 168.5 bits: 41.4 E(): 0.0003 Smith-Waterman score: 218; 46.154% identity (46.753% ungapped) in 78 aa overlap (210-286:2-79) 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 ALPFTPKNIRSHFQHVFVIVKVHNPCTENVCY-SVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSA :. .:.:. .::: ::::.:. .: :.: mKIAA1 NCFIQVSVTAREDVPAFGPPLPSPPVFQKGA 10 20 30 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 VFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSAKFSFITLG ::.:::.:. ::::: ::.:: . ::: : .: ... : . : mKIAA1 EFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHTHTQVMLGMGPEEDKFE 40 50 60 70 80 90 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 AKKKERVKPRKDAHLFSIGAIMWHVVARDFGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFN mKIAA1 NGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGSQRKLHGGNLPGSLSGGIVHNSMEVTKTTFSPP 100 110 120 130 140 150 1185 residues in 1 query sequences 1767832 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:43:16 2006 done: Mon Mar 27 10:43:18 2006 Scan time: 1.120 Display time: 0.370 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]