FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1727.ptfa, 1159 aa vs ./tmplib.26680 library 1767858 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2437+/-0.0102; mu= -20.0167+/- 0.677 mean_var=562.9700+/-136.387, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0541 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285) 671 68 1.2e-11 mKIAA0666 ( 1087 res) mbg21234 (1087) 648 66 3.8e-11 mKIAA4117 ( 1192 res) mfj20353 (1192) 645 66 4.7e-11 mKIAA0381 ( 1032 res) mbe05005 (1032) 558 59 4.7e-09 mKIAA2014 ( 1045 res) mpm02193 (1045) 531 57 2e-08 >>mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285 aa) initn: 604 init1: 435 opt: 671 Z-score: 301.3 bits: 67.8 E(): 1.2e-11 Smith-Waterman score: 722; 30.000% identity (32.739% ungapped) in 490 aa overlap (42-494:699-1184) 20 30 40 50 60 mKIAA1 HVMNCVSLASDKENGTLATAAAFMTGQTSPSASPPPPP-P-----PPPPPPCPHSGEGFS .: ::::: : :::::: : : : mKIAA4 PPLPGVASIPPPPPLPGATAIPPPPPLPGATAIPPPPPLPGGTGIPPPPPPLPGS-VGVP 670 680 690 700 710 720 70 80 90 100 mKIAA1 PSPP-------PPLPPPLPGGPPIPPPPP-----P------GLPSVSYLN-GYSSLGKKK : :: :: :::.::.: :::::: : :.:.. : : . : mKIAA4 PPPPLPGGPGLPPPPPPFPGAPGIPPPPPGMGVPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKVYK 730 740 750 760 770 780 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 ---RMRSFFWKTIPEEQVRGKTNIWTLAAKQQHQYQIDKKTIEELFGQQEDTSKASLPKR ..: :. . :.. .. .:: . ... . . . :. : ::::. .. mKIAA4 PEVQLRRPNWSKFVAEDL-SQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLAFSAQTKTSKAKKDQE 790 800 810 820 830 840 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 GGALNSSFRDAR-EEVTVLDAKRSMNIGIFLKQFKKSPQSIVEDIYQGKSEHYGSETL-R :: ..: . . .:. :::.: ..:..::: .:. : . .... .: .:.. . mKIAA4 GGEEKKSVQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRM-PYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQ 850 860 870 880 890 900 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 EILKLLPESEEVKKLKAFNGDVSKLSLADSFLHCLIQVPNYSLRIEAMVLKKEFLPSCSS ...: .:: :..: :. .. . . :. ...: . :: :..:...: .: . . mKIAA4 NLIKQMPEPEQLKMLSELKEEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVEN 910 920 930 940 950 960 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 LFKDIRTLRAATKELMLCEELHSILHLVLQAGNIMNAGGYAGNAVGFKLSSLLKLADTKA . .: .. :: .:: :.. :.:.:.: .:: ::::. ..: ::..: : :: :::. mKIAA4 IKPEIVSVTAACEELRKSENFSSLLELTLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKS 970 980 990 1000 1010 1020 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 NKPGMNLLHFVAQEAQKQDAILLNFSEKLQHVQETSRLSLDITEAELHSLFVRTKSLQEN :.::::.:. ... .:.: ..: ::...::.: . . : .. . ..... mKIAA4 ADQKMTLLHFLAELCENDHPEVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKSLDQMKKQIADVERD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 410 420 430 440 450 mKIAA1 IQ-----LDQ--ELCQQMEDFLQFAVEKLAELELWKRELQGEAHTLIDFFCEDKETMKLD .: :. .. ..: .:.. : :. .:.. . ... . : :.: : . .... mKIAA4 VQNFPAATDEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGDYFVFDPKKLSVE 1090 1100 1110 1120 1130 1140 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ECFQIFRDFCTRFNKAVKDNHDREEQERKQLQRQKEMEQKRYSWSTGELGSFGRSSSEND : :. ...: . : .:::.:. :.: :.: ..: : ..: mKIAA4 EFFMDLHNFRNMFLQAVKENQKRRETEEK-MRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNA 1150 1160 1170 1180 1190 1200 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 VQMLAKTGTEDLPSFLKPRPNSPSYRPPNTRRSRLSLGISADRELLTFLESATSSPEDPN mKIAA4 EGDETGVMDSLLEALQSGAAFRRKRGPRQVNRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAPGPVKVP 1210 1220 1230 1240 1250 1260 >>mKIAA0666 ( 1087 res) mbg21234 (1087 aa) initn: 537 init1: 203 opt: 648 Z-score: 292.5 bits: 66.0 E(): 3.8e-11 Smith-Waterman score: 694; 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