FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4073.ptfa, 797 aa vs ./tmplib.26680 library 1768220 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4648+/-0.00894; mu= -12.9284+/- 0.589 mean_var=537.5257+/-129.938, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0553 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0805 ( 1659 res) mpf00243 (1659) 3451 291 8.1e-79 mKIAA0435 ( 1388 res) mbg09138 (1388) 2983 253 1.3e-67 >>mKIAA0805 ( 1659 res) mpf00243 (1659 aa) initn: 3445 init1: 3419 opt: 3451 Z-score: 1507.4 bits: 290.8 E(): 8.1e-79 Smith-Waterman score: 3459; 64.794% identity (67.755% ungapped) in 801 aa overlap (3-781:764-1551) 10 20 30 mKIAA4 PLQLWDLLYKLRFVLTYIAPWQITWGSAFHAF .::.:::::.:: ::.:::::::::::::: mKIAA0 IFTVLFFKFDYEAFSETMLLDLFFMSILFSKLWELLYKLQFVYTYVAPWQITWGSAFHAF 740 750 760 770 780 790 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 AQPFAVPHSAMLFLQALLSGLFSTPLNPLLGSAVFIMSYARPLKFWERDYNTKRVDHSNT :::::::::::::.::..:..:::::::.::::.:: ::.::.::::::::::::::::: mKIAA0 AQPFAVPHSAMLFVQAIVSAFFSTPLNPFLGSAIFITSYVRPVKFWERDYNTKRVDHSNT 800 810 820 830 840 850 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 RLVTQLDRNPGADDNNLNSIFYEHLTRSLQHTLCGDLVLGRWGNYGPGDCFVLASDYLNA ::..:::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:::::::. ::::.:::::::: mKIAA0 RLASQLDRNPGSDDNNLNSIFYEHLTRSLQHSLCGDLLLGRWGNYSTGDCFILASDYLNA 860 870 880 890 900 910 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LVHLIEVGNGLITFQLRGLEFRGTYCQQREVEAITEGVEEDEGCCCCEPGHLPRVLSFNA ::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:.:::::: mKIAA0 LVHLIEIGNGLVTFQLRGLEFRGTYCQQREVEAITEGVEEDEGFCCCEPGHVPHVLSFNA 920 930 940 950 960 970 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 AFGQRWLAWEVTASKYVLEGYSISDNNAASMLQVFDLRKILVTYYVKSIIYYVSRSPKLE :::::::::::...::.::::::.::.:::::::::::..:.:::::.:::::. : ::: mKIAA0 AFGQRWLAWEVVVTKYILEGYSITDNSAASMLQVFDLRRVLTTYYVKGIIYYVTTSSKLE 980 990 1000 1010 1020 1030 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 TWLNHEGIAAALRPVRALGYADSDPTFSLSVDEDYDLRLSGLSLPSFCAVHLEWIQYCAS :: .: . .:: .:.: ::::. ..::::: ::.:.: :::...: ::.::.: mKIAA0 EWLANETMQEGLRLCADRNYVDVDPTFNPNIDEDYDHRLAGISRESFCVIYLSWIEYCSS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 RRSQPVDQDWNSPLVTLCFGLCVLGRRALGTASHSMSASLEPFLYGLHALFKGDFRITSP ::..:.: : .: :::::.::::::::::::::: ::..:: :::::::::::::::.: mKIAA0 RRAKPLDVDKDSSLVTLCYGLCVLGRRALGTASHHMSSNLESFLYGLHALFKGDFRISSV 1100 1110 1120 1130 1140 1150 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 RDEWVFADMDLLHRVVAPGVRMALKLHQDHFTSPDEYEEPAALYDAIAANEERLVISHEG ::::.::::.::..::.::.::..:::::::::::::..:..::.::...:. :::.::: mKIAA0 RDEWIFADMELLRKVVVPGIRMSIKLHQDHFTSPDEYDDPTVLYEAIVSHEKNLVIAHEG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 DPAWRSAILSNTPSLLALRHVMDDASDEYKIIMLNRRHLSFRVIKVNRECVRGLWAGQQQ :::::::.:.:.::::::::::::...::::::::::.:::::::::.:::::::::::: mKIAA0 DPAWRSAVLANSPSLLALRHVMDDGTNEYKIIMLNRRYLSFRVIKVNKECVRGLWAGQQQ 1220 1230 1240 1250 1260 1270 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 ELVFLRNRNPERGSIQNAKQALRNMINSSCDQPLGYPIYVSPLTTSLAGSHPQLRALWGG :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::: . :: ::. . :: mKIAA0 ELVFLRNRNPERGSIQNAKQALRNMINSSCDQPIGYPIFVSPLTTSYSDSHDQLKEILGG 1280 1290 1300 1310 1320 1330 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 PVSLGAIARWLLRSWERLHKGCGAGCNSGGNVDDSDCGGGGGLTSLSNHPPLAHPTPEN- :.::: : ... .:.::.::::::::::::..::: ::: :: .. .. :.: mKIAA0 PISLGNIRNFIVSTWHRLRKGCGAGCNSGGNIEDSDTGGG---TSCPGNSAVTASDPHNN 1340 1350 1360 1370 1380 1390 640 650 660 670 680 mKIAA4 -AAGSSEQP--------LPPGPSWGPRPSLSGSGDGRPPPLLQWPPPRLPGPPPASPA-- . ::. .: :: :. : . : :. . :.. : : .: mKIAA0 VSQGSTGHPGQGAGSGLHPPTTSYPPTLGTSHSAHSVQSSLVRQSPARASMASQSSYCYS 1400 1410 1420 1430 1440 1450 690 700 710 720 730 mKIAA4 --------PTEGPRPSRPSGPALLNSEG-PSGKWSLGGRKGLGGPDGEPASGSPKGGTPK : : : : :. . .. .. :: :. .: .. . . : :: .:: mKIAA0 SRHSSLRMSTTGFVPCRRSSTSQISLRNLPS---SIQSRLSMVN-QMEAAS---QGGMGC 1460 1470 1480 1490 1500 740 750 760 770 780 790 mKIAA4 SQAPLDLSLSPDVSSEASPARTTQDL-PCLDSSIPEGCTPSGAPGDWPVPAEERESPAAQ : : : : ::.. :: . : : . .: . . ::. ::. mKIAA0 VQHGLPSSSS---SSQSIPACKHHTLVAFLGAEGGQGSATEAQPGNTSSPANISHARKGE 1510 1520 1530 1540 1550 1560 mKIAA4 PLLEHQY mKIAA0 VIYRVQIVDLSQILEGINVSKRKELHWPDEGIRLKAGRNSWKDWSPQEGMEGHVVHRWVP 1570 1580 1590 1600 1610 1620 >>mKIAA0435 ( 1388 res) mbg09138 (1388 aa) initn: 2736 init1: 1493 opt: 2983 Z-score: 1306.4 bits: 253.4 E(): 1.3e-67 Smith-Waterman score: 2987; 62.084% identity (64.318% ungapped) in 691 aa overlap (3-676:526-1209) 10 20 30 mKIAA4 PLQLWDLLYKLRFVLTYIAPWQITWGSAFHAF .: ::: ::.:::.:.::::..:::.::.: mKIAA0 GFTVIFFHFDYKDISESFLLDFFMVSIVFTKLGDLLQKLQFVLAYVAPWQMAWGSSFHVF 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 AQPFAVPHSAMLFLQALLSGLFSTPLNPLLGSAVFIMSYARPLKFWERDYNTKRVDHSNT :: ::.:::::::.:.. ...:::::.:.:::..:: ::.::.:::::.:::.:.:.::: mKIAA0 AQLFAIPHSAMLFFQTFATSIFSTPLSPFLGSVIFITSYVRPVKFWERSYNTRRMDNSNT 560 570 580 590 600 610 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 RLVTQLDRNPGADDNNLNSIFYEHLTRSLQHTLCGDLVLGRWGNYGPGDCFVLASDYLNA ::..:..:.::.:::::::::::::::.::..:::::::::::::. ::::.:::: ::: mKIAA0 RLAVQMERDPGSDDNNLNSIFYEHLTRTLQESLCGDLVLGRWGNYSSGDCFILASDDLNA 620 630 640 650 660 670 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 LVHLIEVGNGLITFQLRGLEFRGTYCQQREVEAITEGVEEDEGCCCCEPGHLPRVLSFNA .:::::.::::.:::::::::::::::::::::: :: :.:.:::::.:::::..:: :: mKIAA0 FVHLIEIGNGLVTFQLRGLEFRGTYCQQREVEAIMEGDEDDRGCCCCKPGHLPHLLSCNA 680 690 700 710 720 730 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 AFGQRWLAWEVTASKYVLEGYSISDNNAASMLQVFDLRKILVTYYVKSIIYYVSRSPKLE :: :::.::.: ..:.:::::: :::::.::::.:::..:. :::::::::. :::: mKIAA0 AFHLRWLTWEITRTQYILEGYSIIDNNAATMLQVYDLRRVLIRYYVKSIIYYMVTSPKLV 740 750 760 770 780 790 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 TWLNHEGIAAALRPVRALGYADSD-PTFSLSVDEDYDLRLSGLSLPSFCAVHLEWIQYCA .:...:.. .:.: . . : :....:.:: :.:.. :.: : :::::::: mKIAA0 SWVKNESLLKSLQPFAKWHHIERDLAMFNINIDDDYVPCLQGITRASYCNVFLEWIQYCA 800 810 820 830 840 850 340 350 360 370 380 mKIAA4 SRRSQ------PVDQDWNSPLVTLCFGLCVLGRRALGTASHSMSASLEPFLYGLHALFKG ..:.. ::.: .: :::: :.::.:::::::::.:.:. ::. ::::::::::: mKIAA0 GKRQELSKTLEHVDSDEDSALVTLAFALCILGRRALGTAAHNMAMSLDSFLYGLHALFKG 860 870 880 890 900 910 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 DFRITSPRDEWVFADMDLLHRVVAPGVRMALKLHQDHFTSPDEYEEPAALYDAIAANEER :::.:. :::::::::::::.::.:..::.::::::.:: :::::.::.::.:: . .. mKIAA0 DFRVTA-RDEWVFADMDLLHKVVVPAIRMSLKLHQDQFTCPDEYEDPAVLYEAIRSFAKK 920 930 940 950 960 970 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 LVISHEGDPAWRSAILSNTPSLLALRHVMDDASDEYKIIMLNRRHLSFRVIKVNRECVRG .:: ::::::::.:.::: ::.::::.:...::::.:::.: :::.:::::.::::: mKIAA0 VVICHEGDPAWRGAMLSNKEELLTLRHVVDEGADEYKVIMLHRGFLSFKVIKVNKECVRG 980 990 1000 1010 1020 1030 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 LWAGQQQELVFLRNRNPERGSIQNAKQALRNMINSSCDQPLGYPIYVSPLTTSLAGSHPQ :::::::::.:::::::::::::: ::.:::.::::::::::::.:::::::: :.: : mKIAA0 LWAGQQQELIFLRNRNPERGSIQNNKQVLRNLINSSCDQPLGYPMYVSPLTTSYLGTHKQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 LRALWGGPVSLGAIARWLLRSWERLHKGCGAGCNSGG-NVDDSDCGGGGGLTSLSNHPPL :...:::::.:. . :. : :..: :..: ::: :..: : ::.. : .. mKIAA0 LQSVWGGPVTLNRVRTWFQTRWLRMRKDCSVGQRSGGGNIED---GEGGAVPSAGGG--- 1100 1110 1120 1130 1140 630 640 650 660 670 mKIAA4 AHPTPENAAGSSEQPLPPGPS-WG-PRPSLSGSG--DGRPPPL-----LQWPPPRLPGPP . :. :. ::.::: : . :. :: . .: :: . .. :: : . mKIAA0 SAPNGESRDGSTEQPRKGGTQQWSSPRGEAQRAGRRKGRSQSVQAHSAISQRPPTLSSSG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 680 690 700 710 720 730 mKIAA4 PASPAPTEGPRPSRPSGPALLNSEGPSGKWSLGGRKGLGGPDGEPASGSPKGGTPKSQAP : mKIAA0 PILESHQAFLQTSTSVHELAQRPSGSRLSLHTSAASLHSQPPPVTTTGHLSVRERAEALI 1210 1220 1230 1240 1250 1260 797 residues in 1 query sequences 1768220 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:01:01 2006 done: Mon Mar 27 11:01:02 2006 Scan time: 0.910 Display time: 0.150 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]