FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1076.ptfa, 855 aa vs ./tmplib.26680 library 1768162 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2991+/-0.0113; mu= -31.0594+/- 0.746 mean_var=717.7261+/-176.578, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 127 in 1/35 Lambda= 0.0479 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0339 ( 822 res) mph02448 ( 822) 1525 121 7.4e-28 mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744) 536 53 4.7e-07 mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520) 457 47 1.9e-05 mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 400 43 0.00018 mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048) 352 40 0.0022 mKIAA4065 ( 779 res) mpj03374 ( 779) 336 38 0.0037 mKIAA0388 ( 758 res) mbh00510 ( 758) 333 38 0.0042 >>mKIAA0339 ( 822 res) mph02448 (822 aa) initn: 1518 init1: 919 opt: 1525 Z-score: 592.5 bits: 120.6 E(): 7.4e-28 Smith-Waterman score: 1654; 40.904% identity (47.638% ungapped) in 863 aa overlap (11-855:64-822) 10 20 30 mKIAA1 SSPSSSSSSDKDDEDDNEADSDGQIDSDIDDQGAPLSE-- : ::. ..... . . .:..: :. mKIAA0 RPSTPAEEDEDDPEREKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFTLDSEGEEASQES 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 ASEKD--NGDSEEEDEEEMTVPGVEEEEEEEEEEEKETAMAAATVVAMAEESMPPVGGQD .:::: . : .:::::. . . ..: : . : : . ... .:. . . .: mKIAA0 SSEKDEDDDDEDEEDEEQEEAVDATKKEAEASDGEDEDSDSSSQCSLYADSDGENGSTSD 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 FEQDRAEVPLGPRGPMRESLGTEEEVDIEAEDEV-PEMQAPELEEPPLPMGARKLEGSPE :. . . . : ..: . : .. : : . :. : : :. : mKIAA0 SESGSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEEEEQSAVIPSASPPR--EVPEPL--------PA 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 PPEEPGPNTQGDMLLSPELPARETEEAQLPSPPEHGPESDLDMEPEPPPMLSLPLQPPLP : :.: .:.: .. :: .: : : ::. : :: :::: :.: ::: mKIAA0 PDEKP--ETDG-LVDSPVMPLSEKET--LPTQPA-GPAE------EPPP--SVP-QPPA- 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 PPRLLRPPSPPPE--PETPEPPKPPVPLEPPPEDHPPRTPGLCGSLAKSQSTETVPATPG .::. ::. :. : :. :.:: :::. : . : :. :: :. mKIAA0 -----EPPAGPPDAAPRLDERPSSPIPLLPPPKK---RRKTVSFSAAEEAP---VPE-PS 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 GEPPLSGGSSGLSLSSPQVPGSPFSYPSPSPGLSSGGLPRTPGRDFSFTPTFPEPSGPLL ::.. ::: : : : . . : :.. ..:: mKIAA0 TAAPLQAKSSG-----------PVSRKVPR--VVERTIRNLPLDHASLVKSWPEE----- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 LPVCPLPTGRRDERTGPLAS---PVLLETGLPLPLPLPLPLPLALPVPVLRAQPRPPPQL . : :.. : . : :.: . : . : :. :. :. mKIAA0 -----VARGGRNRAGGRVRSTEEEEATESGTEVDLAVLADLALT---PARRGLAT----- 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 mKIAA1 PPLLPATLAPCPTPIKRKPGRPRRSP---PSMLSLDGPL-VRPPPGPALGRDLLLLPGQP ::. : . . :: :: .: . : ..::: : : :. mKIAA0 ---LPTGDDSEATETSDEAERP--SPLLSHILLEHNYALAIKPPPTTPAPRPLE--PAPA 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 PAPIFPSAHDPRAVTLDFRNTGIPAPPPPLPPQPPPPPPPPPVESTKLPFKELDNQWPSE : .: : : . . . : : : : :. . .: :.. :: mKIAA0 LAALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKQQLQQQHPEQ------EGEE---EEEDEEEESE 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 AIPPGPRRDEVTEEYVDLAKVRGPWRRPPKKRHEDLVAPSASPEPSPPQPLFRPRSEFEE . . . :: : :: . : : : : :: : :.::::::. mKIAA0 S-SESSSSSSSDEE--------GAIRRRSLRSHTRRRRPPLPPPPPPP-PSFEPRSEFEQ 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 MTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKR-E :::::::::.:.: ::. .: .:::::::: .: :::::: :: : :.::. :.:.: . mKIAA0 MTILYDIWNSGLDLEDMSYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVQHTITNLSTPKRKRRPQ 540 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 DGIREHVTGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDE-PPMDTQGMSIPAQPHASTRAGS :: ::: :: :::::.: :.::.: .::. .:. . :::: ..:. : mKIAA0 DGPREHQTGSARSEGYYPISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGGDTQG---------TNRVLS 600 610 620 630 640 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 ERRSEQRRLLSSFTGSC--DSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMV :::::::::::.. : ::::::.::::::::::.: .:.::.::::::::::::::: mKIAA0 ERRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMV 650 660 670 680 690 700 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 IEYVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCY ::::::::::..:::::::: .:::::::.::::::::::::::::.:::::: :.:::: mKIAA0 IEYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCY 710 720 730 740 750 760 810 820 830 840 850 mKIAA1 AKVITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN :::::.:::::::::::: :.:.::::::::::.:: :::::::.:.:::.:: mKIAA0 AKVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN 770 780 790 800 810 820 >>mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744 aa) initn: 504 init1: 297 opt: 536 Z-score: 219.0 bits: 52.6 E(): 4.7e-07 Smith-Waterman score: 693; 28.065% identity (34.387% ungapped) in 930 aa overlap (67-855:845-1744) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SEASEKDNGDSEEEDEEEMTVPGVEEEEEEEEEEEKETAMAAATVVAMAEESMPPVGGQD :: :.: :.: : : . .: mKIAA0 CSRLYWSTVDARRRCWYRCRILEYRPWGPREEPVYLEAAEENQTIVHSPTPSSEPPNHDD 820 830 840 850 860 870 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 FEQDRAEVPLGP--RGPMRESLGTEEEVDI-EAEDEVPE-MQAPELEEPPLPMGARKLEG . . . .: : ..:. ..: ..: .. .:. ... ... : . : : : mKIAA0 LPDTDSLIPGDPVHHSPI-QNLDPPLRTDSSNGPPPTPRSFSGARIKVPNYSPSRRPLGG 880 890 900 910 920 930 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 SPEPPEEPGPNTQGDMLLSPELPARETEEAQLPSPPEHGPE-SDLDMEPEPPPMLSLPLQ : :.:.. .. :. ..:. . ....:.::... . : : .: : : ::. mKIAA0 VSFGPL-PSPGSPSS--LTHHIPT--VGDSDFPAPPRRSRRPSPLATRPPPSRRTSSPLR 940 950 960 970 980 220 230 240 250 mKIAA1 PPLPPPRLLRPPSP------PPEPETPEPPKPPVPLEPPPEDHPPR------TPGL---- :.: : : : : : : :: :: :: : . :: mKIAA0 TS---PQLRVPLSTSVTALTPTSGELAPPDLAPSPL-PPSEDLGPDFEDMEVVSGLSAAD 990 1000 1010 1020 1030 1040 260 270 280 290 300 mKIAA1 ---CGSLAKSQ--STETVPATPGGEPPLSGGSSGLSLSSP-----QVPGSPFSYPSPSPG .:: .. . : : : : . :.:. .:: . : . : :. .:. mKIAA0 LDFAASLLGTEPFQEEIVAAGAVGSSQGGPGDSSEEEASPTTHYVHFPVTVVSGPALAPS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 310 320 330 340 350 mKIAA1 LSSGGLPR-------TPGRDFSFTPTFPEPSGPLLLPVCP-LPTGRRDERTGPLASPVLL : .: :: : : : . . .: : : : . : .: : : mKIAA0 -SLAGAPRIEQLDGVDDGTD-SEAEAVQQPRGQGTPPSGPGVGRGGVLGAAGDRARP--- 1110 1120 1130 1140 1150 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 ETGLPLPLPLPLPLPLALPVPVLRAQPRPP--PQLPPLLPATLAPCPTPIKRKPGRPRRS :: . . :. : : :: :. ::: .. : : .. .:. : :. mKIAA0 PEDLPSEIVDFVLKNLGGPGEGA-AGPREDSLPSAPPLANGS-QP-PQSLSTSPADPTRT 1160 1170 1180 1190 1200 1210 420 430 440 mKIAA1 ----P--PSM--LSLDGPLVRPP-PGPA-------LGRDLLLLPG----------QPPAP : :.. ::: :: .:: :. . ::. .. . : ::: : mKIAA0 FAWLPGAPGVRVLSL-GPAPEPPKPATSKIILVNKLGQVFVKMAGEGEPVAPPVKQPPLP 1220 1230 1240 1250 1260 1270 450 460 470 480 490 mKIAA1 --IFPSAHD-------PRAVTLDFRNTGI--PAPPPPLPPQP---PPPPPPPPVESTKLP : :.: : .: ..:. :::::: :: :: :: .. .. mKIAA0 PIIPPTAPTSWTLPPGPLLSVLPVVGVGVVRPAPPPPPPPLTLVFSSGPPSPPRQAIRVK 1280 1290 1300 1310 1320 1330 500 510 520 530 540 mKIAA1 -FKELDNQWPSEAIPPG---PRRDEVTEEYVDLAKVRGP---------WRRPPKKRHEDL . .... : .:: :: :: : : .: : . : . :: mKIAA0 RVSTFSGRSPP--VPPPNKTPRLDEDGESLEDAHHVPGISGSGFSRVRMKTPTVRGVLDL 1340 1350 1360 1370 1380 1390 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 VAPSASPEP-SPPQPLFRPRSEFEEMTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTYERL-LQQDNGM :. .:: :: . .. : : . . . :... . :. ...:.:. mKIAA0 NNPGEQPEEESPGESQWHHYSAGEASSSEEEPPSPEDKENQVPKRVGPHLRFEISSDDGF 1400 1410 1420 1430 1440 1450 610 620 630 mKIAA1 DWLNDTL---W---------------VYHPSTS-LSSAKK-KKREDGI---REHVTGCAR . ..: : . : : : .:.:. ..:.. :.. : : mKIAA0 SVEAESLEVAWRTLIEKVQEARGHARLRHLSFSGMSGARLLGIHHDAVIFLAEQLPGAQR 1460 1470 1480 1490 1500 1510 640 650 660 670 680 mKIAA1 SEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDEPPMDTQGMS----------------IPAQPHASTR . . :.:: ...... .:::.. .: . . .: .. . mKIAA0 CQHY-------KFRYHQQGEGQ-EEPPLNPHGAARAEVYLRKCTFDMFNFLASQHRVLPE 1520 1530 1540 1550 1560 690 700 710 720 730 mKIAA1 AGSERRSEQRRLLSSFTGSCDSDL---LKFNQLK-FRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIA ... . :.. : : . . .: ..: .:: :. . .: :: ::: . : mKIAA0 GATCDEEEDEVQLRSTRRATSLELPMAMRFRHLKKTSKEAVGVYRSAIHGRGLFCKRNID 1570 1580 1590 1600 1610 1620 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 ADEMVIEYVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSC : :::::: : ::.:..: ::: :. .::: ::::.: ..::: :: :::::::: mKIAA0 AGEMVIEYSGIVIRSVLTDKREKFYDGKGIGC-YMFRMDDFDVVDATMHGNAARFINHSC 1630 1640 1650 1660 1670 1680 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 NPNCYAKVITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDV--KIPCLCGSENCRGTLN .:::...:: ::.::.:::.. ..: .::.::::::::::. :.:: ::.. :: :: mKIAA0 EPNCFSRVIHVEGQKHIVIFALRRILRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKRCRRFLN 1690 1700 1710 1720 1730 1740 >>mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520 aa) initn: 565 init1: 269 opt: 457 Z-score: 190.3 bits: 47.1 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 476; 32.209% identity (36.082% ungapped) in 326 aa overlap (533-855:1227-1520) 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 WPSEAIPPGPRRDEVTEEYVDLAKVRGPWRRPPKKRHEDLVAPSASPEPSPPQPLFRPRS : .. ::::: ..::. . ...: . mKIAA1 RLYWSTRYANRRCRYLCSIEEKDGRPVFVIRIVEQGHEDLVLSDSSPKDVWDK-ILEPVA 1200 1210 1220 1230 1240 1250 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 EFEEMTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVT-YERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKK .. . . ... . . ::. : :. :. .. :.. .. . : ... mKIAA1 CVRKKSEMLQLFPAYLKGEDLFGLTVSAVARIAESLPGVEACENYTFRY--------GRN 1260 1270 1280 1290 1300 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 KKREDGIREHVTGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDEPPMDTQGMSIPAQPHASTR : . . ::::::: .. : . . :::. .: . : .. : : . mKIAA1 PLMELPLAVNPTGCARSEPKMSAHVK-RPHTLNSTSTSKSFQSTVTGELNAPY----SKQ 1310 1320 1330 1340 1350 1360 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 AGSERRSEQRRLLSSFTGSCDSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEM . :. ::. . . :... . .:.:. ::.: . : : mKIAA1 FVHSKSSQYRRMKTEW-----------------KSNVYLARSRIQGLGLYAARDIEKHTM 1370 1380 1390 1400 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 VIEYVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNC ::::.: ::. .:. .:: ::... : ::::.:.: .:::: :. ::.::::: ::: mKIAA1 VIEYIGTIIRNEVANRKEKLYESQNRGV-YMFRMDNDHVIDATLTGGPARYINHSCAPNC 1410 1420 1430 1440 1450 1460 810 820 830 840 850 mKIAA1 YAKVITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIED--VKIPCLCGSENCRGTLN :.:.: : .::.: :...:. .::. ::::: .:: :::: ::. ::: .: mKIAA1 VAEVVTFERGHKIIISSNRRIQKGEELCYDYKFDFEDDQHKIPCHCGAVNCRKWMN 1470 1480 1490 1500 1510 1520 >>mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 (801 aa) initn: 184 init1: 120 opt: 400 Z-score: 172.7 bits: 42.9 E(): 0.00018 Smith-Waterman score: 431; 26.611% identity (31.762% ungapped) in 481 aa overlap (129-563:75-523) 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 QDRAEVPLGPRGPMRESLGTEEEVDIEAEDEVPEMQAPELEEPPLPMGARKLEG----SP :. . : : :. .:. :: . mKIAA1 VGVVFRLHCRLSPGQPDLWRLALLPCLSLRELKKKAPPPRPTAPKPLLSRREEGEAVEAG 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 mKIAA1 EPPEEPGPNTQGDMLLSPELP------ARETEEAQLPSPPEHGPESDLDMEPEPPPMLSL . ::: . ::...:.:: . . . : : :: . : :: : mKIAA1 DTPEELR-SLPPDMMVGPRLPDPFLGTTAPLHFSPGPFPSSTGPATHYLSGPLPPGTYSG 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 mKIAA1 P---LQP----PLPPPRLLRP-PS--------PPPEPE-----TPE----PPKPPVPLEP : .:: :. : .: : :. : :. .: ::.: : : mKIAA1 PTQLMQPRAAVPMAPATVLYPAPAYTSELGLVPRSSPQHGIVSSPYAGVGPPQPVVGLPS 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 PPEDHPPRTPGLCGSLAKSQSTETVPATPGGEPPLSGGSSGLSLSSPQVPGSPFSYPSPS : ::. : ... .: :: .. . :.:. .. .: .: : :.: mKIAA1 AP---PPQLSGPELAMTVRPATTTVDSV---QAPISSHTAPRPNPTPALPQPCFPVPQPV 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 PGLSSGGLPRTPGRDFSFTPTFPEPSGPLLLPVCPLPTGRRDERTGPLAS---PVLLETG : : .:. : :. : . : ... :::: . : . :: mKIAA1 PQSVPQPQPLPVPYTYSIGTKQPLPA-PYTYSI-----GTKQHLTGPLPQHQFPPGIPTG 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 mKIAA1 LPLPLPLPLPLPLALPVPVLRAQPRPPPQLPPLLPATLAPCPTPIKRKPGRPRRSP-PSM .:.: : : : . ::.: :: : . : : : . .: :: .: :.. mKIAA1 FPVPRTGPQAQAQPQPQPQPQPQPQPQPQPQPQPQSQSQPQPQP-QPQPQRPAFGPQPTQ 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 LSLDGPLVRPPPGPALGRDLLLLPGQPPAPIFPSAHDPRAVTLDFRNTGIPAPPPPLPPQ : :. .: :. . .: :: : : :. .: ::: : : mKIAA1 QPL--PFQHPHLFPSQAPGIL-----PPPPPTPYHFTPQPGVLG-------QPPPTLHTQ 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 --PPPPPPPPPVESTKLPFKELD--NQWPSEAIPPGPRRDEVTEEYVDLAKVRGPWRRPP : : : : .: ::: . :. : :.: . . . .. .::: :: mKIAA1 LYPGPSQDPLPPHSGALPFPSPGPPHPHPTLAYGPAPSPRPLGPQATPVS-IRGP---PP 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 --KKRHEDLVAPSASPEPSP-PQPLFRPRSEFEEMTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTYER . ..:: .: :.: : : : .: mKIAA1 ASQPTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPSRPPTAEPPPCLRRGAAAADLLSSSPESQHGGTQPP 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 LLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKREDGIREHVTGCARSEGFYTIDKKDKLRY mKIAA1 GGGQPLLQPTKVDAAEGRRPQALRLIEQDPYEHPERLQQLQQELEAFRGQLGDAGALDAI 560 570 580 590 600 610 >>mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048 aa) initn: 139 init1: 139 opt: 352 Z-score: 153.3 bits: 39.7 E(): 0.0022 Smith-Waterman score: 362; 26.907% identity (31.990% ungapped) in 472 aa overlap (141-562:427-873) 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 PMRESLGTEEEVDIEAEDEVPEMQAPELEEPPLPMGARKLEGSPEPPEEPGPNTQGDMLL :: : :. . ::: . ... mKIAA1 ETIVSDGSTLSSKGGSEGQPEGSVASNNVAPPPPGGSGR--GSPSGGSTAETSDTASIRS 400 410 420 430 440 450 180 190 200 210 220 mKIAA1 SPELPARETEEAQLPSPPEHGPESDLDMEPEPPPMLSLPLQ-PPLPP----PRLLRPPSP : .: .: . .. :: :. ... . . . :: :: : :.: :::. mKIAA1 SGQLSGRSVSLRKMKRPPPP-PRRTYSLHQRGSAVPDGPLGLPPKPERKQQPQLPRPPTA 460 470 480 490 500 510 230 240 250 260 mKIAA1 PPEPETPEPPKPPVP-------LEPPPEDHPPRTPGLCGSLAKSQSTET----------- . :: : : .:::.: : ... :... mKIAA1 GGSSGVGAVSCPPSSAGTWGSGLSPGGSRRPPRSPERTLSPSSGYSSQSGTPTLPPKGLA 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 -VPATPG-GEPP-----LSGGSSGLSLSSPQVPGSPFSYPSPSPGLSSGGLPRTPGRDFS .::.:: ..:: : : : :.:: . : .:.: :: :: : mKIAA1 VAPASPGKAQPPKPDRVTSLRSPGASVSSSLTSLCS-SSSDPTPLDRSGPQMSTPLSDRF 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 mKIAA1 FTPTFPEPSGPLLLPVCPLPT-GRRDERTGP-LASPVL-------LETGLPLP-LPLPLP : :.:. : : : :. .. .....: ::.:.. ..:. : .: mKIAA1 VIP--PHPKVPA--PFSPPPSKSKSSNQAAPVLAAPAVAPGQVSTIDTSPASPSMPQTTL 640 650 660 670 680 380 390 400 410 420 mKIAA1 LPLALPVPVLRAQPRPPPQLPPLLPATLAPCPTPIKRKPGRPRRSPP----SMLSLDGPL : : :: . :::. :: . : : : : :: ...:: .. : : mKIAA1 TP-AQESPVASKDESPPPSPPP----SYHPPPPPTK-KPEVLEEAPPPPEAAVEILPDPS 690 700 710 720 730 740 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 VRPPPGPA-LGRDLLLLPGQPPAPIFPSAHDPRAVTLDFRNTGIPAPPPPLPPQPPPPPP ::: :: .:: . :: .: .: :. :. .. .:: : ::: : mKIAA1 WPPPPPPAPEEQDLSMADFPPPEEVFFNA-GPELGPLESCSSEAAVPPAASLSQTPPPAP 750 760 770 780 790 800 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 PPPVESTKLPFKELDNQWPSEAIPPGPRRDE----VTEEYVDLAKVRGPWRRPPKKRHED :: : . :. .: .. .::.: :: ......:. . mKIAA1 PPS--SGSEPLARLPQKDSVGKHSGAPREDSGTPLVTPSLLQMVRLRSV--------GAS 810 820 830 840 850 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 LVAPSASPEPSPPQ-PLFRPRSEFEEMTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGM :. :: : :: :: : : mKIAA1 TGIPNPSPGSSAPQKPLRRALSGRASPVTAPSSGLHAAVRLKASSLAASESPASALPTGI 860 870 880 890 900 910 >>mKIAA4065 ( 779 res) mpj03374 (779 aa) initn: 370 init1: 193 opt: 336 Z-score: 149.0 bits: 38.5 E(): 0.0037 Smith-Waterman score: 336; 41.129% identity (41.803% ungapped) in 124 aa overlap (715-838:644-765) 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 ERRSEQRRLLSSFTGSCDSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVIE ::.: . : . ::.: .:. .:.. : mKIAA4 DPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISE 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 YVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYAK : :. : : :: : : : :. . :..: ...: ..:::. :: :: ::: ::::::: mKIAA4 YCGEIISQDEADRRGKVY-DKYM-CSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAK 680 690 700 710 720 730 810 820 830 840 850 mKIAA1 VITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN :. :.....: :..:. :...::. .::.. :. mKIAA4 VMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGEELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP 740 750 760 770 >>mKIAA0388 ( 758 res) mbh00510 (758 aa) initn: 409 init1: 237 opt: 333 Z-score: 148.0 bits: 38.3 E(): 0.0042 Smith-Waterman score: 333; 41.935% identity (42.623% ungapped) in 124 aa overlap (715-838:623-744) 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 ERRSEQRRLLSSFTGSCDSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVIE ::.: . : . :: : : . .:.. : mKIAA0 DPDLCLTCGASEHWDCKVVSCKNCSIQRGLKKHLLLAPSDVAGWGTFIKESVQKNEFISE 600 610 620 630 640 650 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 YVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYAK : :. : : :: : : : :. . ::..: ...: ..:::. :: :: ::: ::::::: mKIAA0 YCGELISQDEADRRGKVY-DKYM-SSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAK 660 670 680 690 700 710 810 820 830 840 850 mKIAA1 VITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN :. :.....: :..:. :...::. .::.. :. mKIAA0 VVMVNGDHRIGIFAKRAIQAGEELFFDYRYSQADALKYVGIERETDVF 720 730 740 750 855 residues in 1 query sequences 1768162 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:35:29 2006 done: Mon Mar 27 10:35:30 2006 Scan time: 0.980 Display time: 0.320 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]