FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1060.ptfa, 1115 aa vs ./tmplib.26680 library 1767902 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3913+/-0.00403; mu= 18.5217+/- 0.271 mean_var=76.9300+/-17.331, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1462 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150) 1582 344 5.8e-95 mKIAA4004 ( 422 res) mfj25198 ( 422) 1067 235 1.5e-62 mKIAA0422 ( 391 res) mbh03531 ( 391) 1011 223 5.3e-59 mKIAA4070 ( 645 res) mbg13014 ( 645) 924 205 2.4e-53 mKIAA0520 ( 1334 res) mbg16592 (1334) 588 135 8.5e-32 mKIAA4084 ( 626 res) mfj00113 ( 626) 171 46 1.6e-05 >>mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150 aa) initn: 1782 init1: 747 opt: 1582 Z-score: 1797.3 bits: 344.4 E(): 5.8e-95 Smith-Waterman score: 2028; 34.636% identity (38.138% ungapped) in 1100 aa overlap (57-1100:71-1125) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 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..:...:. :: :::::. mKIAA0 EEQSQQQENLMLSILPKHVADEMLKDM------KKDESQKDQQQFNTMYMYRHENVSILF 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 ADIVGFTRLASDCSPGELVHMLNELFGKFDQIAKENECMRIKILGDCYYCVSGLPISLPN :::::::.:.: :: :::..:::::..::..: . . .:::::::::::. ::: . mKIAA0 ADIVGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLRIKILGDCYYCICGLPDYRED 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 HAKNCVKMGLDMCEAIKKVRDATGVDINMRVGVHSGNVLCGVIGLQKWQYDVWSHDVTLA :: . ::: : :::. ::. : . ..::::::.:.:: ::.: ..::::::: :::.: mKIAA0 HAVCSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLGGVLGQKRWQYDVWSTDVTVA 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 NHMEAGGVPGRVHISSVTLEHLNGAYKVEEGDGEIRDPYLKQHLVKTYFVINPKGE-RRS :.:::::.:::::::. :.. :.: . :: ::: : :: .. ..::..: : : ... mKIAA0 NKMEAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGDGGSRCDYLDEKGIETYLIIASKPEVKKT 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 PQHLFRPRHTLDGAKMRASVRMTRYLESWGAAKPFAHLHHRDSMTTE-NGKISTTDVPMG :. . . .:: .. .:. .: . : : . : . . . .: : mKIAA0 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.: : :. . .:: :: ::. : .. :. :. ... : .: .::. :. mKIAA4 VALPAVAWASGRELTSDPSFLTTVLCALGGFSLLLGLASREQQLQRWTRPLSGLIWVALL 50 60 70 80 90 100 150 160 170 mKIAA1 AMGYLFMCFGGTVSAWDQ-------------------------------VSFFLFIIFVV :.:: :. ::.:::::: :::::::::.: mKIAA4 ALGYGFLFTGGVVSAWDQVRKIKAWGKVNLKFRPWAQHHGHSASHTLLQVSFFLFIIFTV 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 YTMLPFNMRDAIIASVLTSSSHTIVLSVYLSATPGAKEHLFWQILANVIIFICGNLAGAY :.:::..:::: :.:..: :: .::..::. : ... :. :. ::...:.:::..::: mKIAA4 YAMLPLGMRDAAAAGVISSLSHLLVLGLYLGWQPESQRALLPQLAANAVLFLCGNVVGAY 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 HKHLMELALQQTYRDTCNCIKSRIKLEFEKRQQERLLLSLLPAHIAMEMKAEIIQRLQGP :: ::: ::. :.:.. . ..:: .:. ::..::.::::.:::..: ::::::. :::. mKIAA4 HKALMERALRATFREALSSLHSRRRLDTEKKHQEHLLLSILPAYLAREMKAEIMARLQAG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 KAGQMENTNNFHNLYVKRHTNVSILYADIVGFTRLASDCSPGELVHMLNELFGKFDQIAK . .. :::::::.:::::: .::.:::::::::::::.::: ::: :::::::::::::: mKIAA4 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mKIAA4 QKYHQLQDEYFTSAVVLA-LILAALFGLIYLLVIPQSV-------AVLLLLVFS--ICF- 130 140 150 160 170 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 GQLLQCSKKASASLLWLLKSSGIIANRPWPRISLTIVTTAIILTMAVFNMFFLSNSEETT :. :. :.: : . .: . ::. . ..:. . .. mKIAA4 --LVACT-------LYL----HITRVQCFPGCLTIQIRTALCVFIVVLIYSVAQGCVVGC 180 190 200 210 220 740 750 760 770 780 mKIAA1 LPTANASNANVSV----PDNQTAILHARNLFFLPYFIYSCILGLISCSVFLRVNYELKML :: : .:..: :. .. ..: : . . :..: . ..::::. ::. mKIAA4 LPWAWSSQSNSSLVVLAAGGRRTVLPALPCESAHHALLCCLVGTLPLAIFLRVSSLPKMI 230 240 250 260 270 280 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 IMMVALVGYNIILLHTHAHVLDAYSQVLFQRPGIWKDLKTMGSVSLSIFFITLLVLGRQS .. ..: ..: :..:..: : . . ... .: :: . .:: mKIAA4 LLSGLTTSYILVLE------LSGYTKV---GGGALSGRSYEPIMAILLFSCTLALHARQV 290 300 310 320 330 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 EYYCRLDFLWKNKFKKEREEIETMENLNRVLLENVLPAHVAEHFLARSLKNEELYHQSYD . :::.:: . ..::...: .. :. .: :.::::::.::: . .: .::.:::. mKIAA4 DVRLRLDYLWAAQAEEERDDMERVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSYS 340 350 360 370 380 390 910 920 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