FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0745.ptfa, 1078 aa vs ./tmplib.26680 library 1767939 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1391+/- 0.004; mu= 13.1952+/- 0.269 mean_var=79.2174+/-17.978, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1441 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1721 ( 1149 res) mpm03365 (1149) 291 71 9.3e-13 >>mKIAA1721 ( 1149 res) mpm03365 (1149 aa) initn: 164 init1: 77 opt: 291 Z-score: 321.4 bits: 71.3 E(): 9.3e-13 Smith-Waterman score: 476; 20.102% identity (23.396% ungapped) in 1179 aa overlap (2-1060:10-1142) 10 20 30 40 mKIAA0 SLAQLENLCKQLYETTDTTT---RLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGS .::::: : :. . .. : .::. .. : .: . .. :. .:: .. mKIAA1 AAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVSNEQRQHAEHIFLSFRKSKSPFAVCRHILETSK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 SSYSQLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARI .: . ::: . . : 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