FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1400.ptfa, 1098 aa vs ./tmplib.26680 library 1767919 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4356+/-0.0055; mu= 15.9917+/- 0.367 mean_var=133.0205+/-30.939, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 17 in 1/35 Lambda= 0.1112 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1313 ( 969 res) mbh01521 ( 969) 1556 262 3.3e-70 mKIAA1562 ( 1135 res) mfj24085 (1135) 1420 240 1.3e-63 mKIAA0327 ( 933 res) mfj34062 ( 933) 1366 231 4.8e-61 mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 ( 962) 1302 221 6e-58 mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 609 110 1.6e-24 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 564 103 3.7e-22 mKIAA1775 ( 918 res) mbg01642 ( 918) 348 68 7e-12 mKIAA4134 ( 1021 res) mfj12267 (1021) 166 39 0.0046 >>mKIAA1313 ( 969 res) mbh01521 (969 aa) initn: 1355 init1: 554 opt: 1556 Z-score: 1352.8 bits: 261.9 E(): 3.3e-70 Smith-Waterman score: 1961; 40.175% identity (46.348% ungapped) in 916 aa overlap (228-1078:1-859) 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 RFPLESAFDPDVGTNSLRDYEITPNSYFSLDVQTQGDGNRFAELVLEKPLDREQQAVHRY ...:.:::.::::::.:: :::: :. . . mKIAA1 EIKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSF 10 20 30 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 VLTAVDGGGGGGGGEGGGGGGGAGLPPQQQRTGTALLTIRVLDSNDNVPAFDQPVYTVSL .::.::: ::.. ::. :.:.: ::::: :.: . .:.::. mKIAA1 RITALDGGD----------------PPHM---GTVGLSIKVTDSNDNNPVFGESTYSVSV 40 50 60 70 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 PENSPPGTLVIQLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYE ::::::.: ::.:::.::::: ::.::::: .... :.:::: ..:..: . :.: :::: mKIAA1 PENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTVTGALDYE 80 90 100 110 120 130 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 ESPVYQVYVQAKDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISFSTVKE---AVSEGAAPGTV :. ::.. :::::::::..:::::: : :::.::: : :.. .:. :::.: :: : mKIAA1 EGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPIINLLSVNSELVEVSESAPPGYV 140 150 160 170 180 190 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 VALFSVTDRDSEENGQVQCELLGDVPFRLKSSFKNYYTIVTEAPLDREAGDSYTLTVVAR .:: :.:::: ::.:::.:::.:::::. .... ::.... :::: :.:.::. :: mKIAA1 IALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVDGRLDREQHDQYNLTIQAR 200 210 220 230 240 250 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 DRGEPALSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGAYIYAVSATDRDEGANA : : : :...::. :...: ::: :.::.: :.: : :::.::::. .::: : : : :. mKIAA1 DSGVPMLQSAKSFTVRITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDPDMGLNG 260 270 280 290 300 310 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 KLTYSILECQIQGMSVFTYVSINSDNGYLYALRSFDYEQIKDFSFQVEARDAGSPQALAG ...:.:. :.. : :::::::: ..: .::::::..:: : : :.: :.:.: : .: . mKIAA1 SVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGLP-SLQS 320 330 340 350 360 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 NATVNILIVDQNDNAPAIVAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGENARL :::: ..:.: :::.:.:.:: : ::: :. .::.. :::.: : : : :.:::.:. mKIAA1 NATVRVIILDVNDNTPVITAP-PLINGT-AEVYIPRNSGIGYLVTVVKADDYDEGENGRV 370 380 390 400 410 420 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 TYSIVRGNEMNLFRLDWRTGELRTARRVPAKRDPQRPYELVIEVRDHGQPPLSSTATLVV ::....:.. ..:..: .::.::.: . :. :::.. ..:::. ::..: ... mKIAA1 TYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFNENSKPS--YELIVVAHDHGKTSLSASALVLI 430 440 450 460 470 480 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 QLVDGAVEPQGGGGDRGGGSGEHLRPSRSGGGETSLDLTLILIIALGSVSFIFLLAMIVL : . :.. : . : :..:.::.::::::.. :....:: . mKIAA1 YL-SPALDAQESMG--------------------SVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFV 490 500 510 520 800 810 820 mKIAA1 AVRCQKE-KKLNIYTCLASDC----CLCCCCCGNGSSTC--C------------------ :..:... :.. :.: :.: :: : . .: : : mKIAA1 AIKCKRDNKEIRTYNC--SNCLTITCLLGCFIKGQNSKCLHCISVSPNSEEQDKKAEEKV 530 540 550 560 570 580 830 840 850 860 870 mKIAA1 ------------GRQARA-RKKKLSKSDIMLVQSANVPSNPAQVPVEESGGFGSHHHNQN :.: .. .:::.::.:: :: .. .. : ... : . . mKIAA1 SLRGKRIAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETD--KMNVVSCSSLTSSLNYFD 590 600 610 620 630 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 YCYQVCLTPESAKTDLMFLK-PCSPSRSTDAEHNPCGAIVTGYSDQQPDIISNGSILSNE : .: : ... ::. . .:.: : : .. .. . ::::.: :: : : mKIAA1 Y-HQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNTRNTTASHIYHHSF-NSQGPQQPDLIINGVPLP-E 640 650 660 670 680 690 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 NKHQRAELSYLVDRPRRV-NSSAFQEADIVSSKDSGHGDSEQGDSDHDVTN--RGQSAGM ... . .:. .: . . .::.:.. . : ::::: .:.: ::.::: ..: mKIAA1 TENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVN 700 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 DLFS-------------------NCTEECKALGHSDRCWMP-SFVPSDGRQAADYRSNLH :... .: :::. :::::::::: . .:. ... :. . mKIAA1 DVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRNPMPTRSKSPEHVRNIIA 760 770 780 790 800 810 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 VPGMDSVPDTEVFEPPEVQPGAERSFSTFGKEKALHGTLERKELDGLLSNTRAPYKPPYL . .. :.:... . : ..:.:.::::. . : . :: : : mKIAA1 LSIEATAADVEAYD--DCGP-TKRTFATFGKDVSSHRAEERPILKGKRTVDVTICSPKVN 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 TRKRIC mKIAA1 SAIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSPLPTKPSISYTVALAPPAHDLEHHANSGASRPSEAE 880 890 900 910 920 930 >>mKIAA1562 ( 1135 res) mfj24085 (1135 aa) initn: 1379 init1: 682 opt: 1420 Z-score: 1234.2 bits: 240.2 E(): 1.3e-63 Smith-Waterman score: 2255; 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