FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0627.ptfa, 1188 aa vs ./tmplib.26680 library 1767829 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4595+/-0.00614; mu= -0.2345+/- 0.409 mean_var=200.6036+/-46.866, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0906 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0622 ( 791 res) mbg10155 ( 791) 2424 330 9.3e-91 >>mKIAA0622 ( 791 res) mbg10155 (791 aa) initn: 3399 init1: 1241 opt: 2424 Z-score: 1721.8 bits: 330.0 E(): 9.3e-91 Smith-Waterman score: 3538; 70.744% identity (74.206% ungapped) in 793 aa overlap (431-1188:1-791) 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 LVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVARSSRIPRPSVSQGCSREASRESSRDTSPV ::::::::::.::::::..::::::::::. mKIAA0 ARSSRIPRPSMSQGCSRDTSRESSRDTSPA 10 20 30 470 480 490 500 mKIAA0 RSFQPLGP----------------G----YGISQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVAD :.: ::. : .:..::.:. .::.:::::.:..:.: :::: mKIAA0 RGFTPLASRRHSRSTSALSTAESVGQSDRFGLGQSGRIPGSVNAMRVLSTSTDLEAAVAD 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 ALLLGDIRTKKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSERSYSSRNGSIPTYMRQTEDVA :::::: :.::::.::::: :::.:::::::::::.::::::.::::.:: :.::::::: mKIAA0 ALLLGDARSKKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSERSYGSRNGGIPHYLRQTEDVA 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 EVLNRCATSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADLHGKRVFSMFL ::::.::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::: mKIAA0 EVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHSKRVFSMFL 160 170 180 190 200 210 630 640 650 660 670 mKIAA0 ETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKWVLICLALFRQKFRKPL-ILQES--------- ::::::: .::::::::::::::::::: :. . : .: : . ..: mKIAA0 ETLVDFIIIHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAKVQKALDVTRDSFPFDQQFNI 220 230 240 250 260 270 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 LMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPRDFTNSSETRLAVSRVITWTTEPKSSD :::: :::::::.::::::::::::.::.:::: ::.:::::::::::.::::::::::: mKIAA0 LMRFIVDQTQTPNLKVKVAILKYIESLARQMDPTDFVNSSETRLAVSRIITWTTEPKSSD 280 290 300 310 320 330 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 VRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLRNTGNGTQSSMGSPLTR :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..: .: .. . : mKIAA0 VRKAAQIVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLKNSSNTGVGSPSNTIGR 340 350 360 370 380 390 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 PTPRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPSAFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFRSQ : :.. .:::::::: :.. :::: .::::::.:::.::::::::::::..:::::: mKIAA0 TPSRHPSSRTSPLTSPTNCSHGGLSPSMLDYDTENLNSEEIYSSLRGVTEAIEKFSFRSQ 400 410 420 430 440 450 860 870 880 890 900 mKIAA0 EDMSEPVRRDPKKEDGDTICSGPGMSDPRA---GGDAADGSQPALDNKASLLHSMPLHS- ::..::..:: :: : : . : ..: . ::. .:.. :::::.:::...: .. mKIAA0 EDLNEPIKRDGKK-DCDIVSRDGGAASPATEGRGGSEIEGGRMALDNKTSLLNTQPPRAF 460 470 480 490 500 910 920 930 940 950 960 mKIAA0 -SPRSRDYNPYNYSDSISPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSNHN .::.:.:::: :::.:. ..:.:::::.:::: .:. :. .:::::::.::::::::: mKIAA0 PGPRAREYNPYPYSDTINTYDKTALKEAVFDDDMEQL-RDVPIDHSDLVADLLKELSNHN 510 520 530 540 550 560 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA0 ERIEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPTIRALALKVLKEILR ::.:::: :: ::.:.:.:.:..::.:::::::::::::::::. .::::::.::.:::: mKIAA0 ERVEERKGALLELLKITREDSLGVWEEHFKTILLLLLETLGDKDHSIRALALRVLREILR 570 580 590 600 610 620 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA0 HQPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRSAEEAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQTAD .::::::::::::.::::::::: ::::::.::::::.::.:: :::::::::::::::: mKIAA0 NQPARFKNYAELTIMKTLEAHKDSHKEVVRAAEEAASTLASSIHPEQCIKVLCPIIQTAD 630 640 650 660 670 680 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 YPINLAAIKMQTKVIERVSKETLNMLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHAVI ::::::::::::::.::..::.: .:: .:.:::.:::::.::::::: ::::::...:: mKIAA0 YPINLAAIKMQTKVVERITKESLLQLLVDIIPGLLQGYDNTESSVRKASVFCLVAIYSVI 690 700 710 720 730 740 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 GDELKPHLSQLTGSKMKLLNLYIKRAQTGSAGADPTADVSGQS :..:::::.::::::::::::::::::: ..... ..::: .: mKIAA0 GEDLKPHLAQLTGSKMKLLNLYIKRAQTTNSNSSSSSDVSTHS 750 760 770 780 790 1188 residues in 1 query sequences 1767829 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:24:46 2006 done: Mon Mar 27 10:24:48 2006 Scan time: 1.150 Display time: 0.080 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]