FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0871.ptfa, 471 aa vs ./tmplib.26680 library 1768546 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6523+/-0.00635; mu= -0.3882+/- 0.417 mean_var=266.3136+/-65.462, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0786 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1537 ( 628 res) mbg18407 ( 628) 1292 160 4.5e-40 mKIAA4212 ( 600 res) mbg08227 ( 600) 1255 156 8.1e-39 mKIAA1749 ( 922 res) meh00393 ( 922) 212 38 0.0042 >>mKIAA1537 ( 628 res) mbg18407 (628 aa) initn: 1355 init1: 1256 opt: 1292 Z-score: 811.7 bits: 160.0 E(): 4.5e-40 Smith-Waterman score: 1597; 59.132% identity (62.110% ungapped) in 438 aa overlap (46-465:7-441) 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 TTDKITQAAMETIYLCKFRVSMDGEWLCLRELDDISLTPDPEPTH----EDPNYLMANER :: : .: : : .::. : :: mKIAA1 PPRACGELLTRSASPCPARTAAMATKDPT---AVER 10 20 30 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 MNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQFFVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSF ::.:::::::::::::::..:::::::: ::::::::::::::::::..:.::. ::.. mKIAA1 ANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKGRKSFLSYNKTI 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 WGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGRAWLRLALMQKKLSEYMKALINKKEL :::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.::::::::::::...:.. :: ..:: mKIAA1 WGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQREL 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 LSEFYEVNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCMKGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSK :::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.:::::::::::::::::::. . mKIAA1 LSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEEIG 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 GSEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQTKVDLLEKSNTKLTEELAVANNRIITL ..: . ::.::::::::::::::.::.::..:...:: :::::::: ::::.:.: :: : mKIAA1 NKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKL 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 mKIAA0 QEEMERVKEESSYLL--------------ESNRKGPKQDRTAEGQALSEARKHLKEETQL ::: .... :. .: :.. . :..: . . ..::..:..:.:: mKIAA1 QEENHQLRSENELILMRTRQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNDARRQLRDESQL 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 RLDVEKELELQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDALVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSS : :::.:: .:..:..:::::::.::::. ::::.:..:::::....:.. :. .::.: mKIAA1 RQDVENELSVQVGMKHEMELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQRLQGS 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 DLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQSEKDLVKQAKTLNSAANKLIPKHH . :.:.:.:. .:::::::.......:::: .. : : .. .: mKIAA1 EDGLKEKNEIIARLEEKTNKITTAMRQLEQRLQQAEKAQKEAEAEDEKYAQECLSQSDSL 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 QRQISQKEQQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDVLSHLRHETQKVISLKKEFLNLQ 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA4212 ( 600 res) mbg08227 (600 aa) initn: 1517 init1: 1174 opt: 1255 Z-score: 789.3 bits: 155.7 E(): 8.1e-39 Smith-Waterman score: 1496; 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