FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0688.ptfa, 893 aa vs ./tmplib.26680 library 1768124 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6365+/-0.0054; mu= 15.1222+/- 0.362 mean_var=133.7777+/-30.689, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1109 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1346 ( 998 res) mfj09039 ( 998) 2466 406 8.5e-114 mKIAA4060 ( 1035 res) mbg16808 (1035) 1083 185 3.5e-47 mKIAA2029 ( 1233 res) meh00056 (1233) 858 149 2.7e-36 mKIAA1445 ( 632 res) mph02187 ( 632) 250 52 3.3e-07 mKIAA0021 ( 853 res) mbh01716 ( 853) 235 49 2.1e-06 mKIAA4089 ( 1251 res) mbg12616 (1251) 216 47 2.2e-05 mKIAA0550 ( 612 res) mbg18962 ( 612) 170 39 0.0023 >>mKIAA1346 ( 998 res) mfj09039 (998 aa) initn: 2312 init1: 1575 opt: 2466 Z-score: 2135.3 bits: 406.5 E(): 8.5e-114 Smith-Waterman score: 2613; 47.967% identity (52.282% ungapped) in 836 aa overlap (96-874:67-890) 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 MGLHPRRGLTGHWLRRFQPCLPLHTVQWRRLLLLA----FLLSLAWPASPLPREEEIVFP ::::: .: . . . : ..::.:.: mKIAA1 LGSRKQKPCSDMGDVQRAARSRGSLSAHMLLLLLASITMLLCARGAHGRPTEEDEELVLP 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 mKIAA0 EKLNGSSILPG-SGVPARLLYRLPAFGEMLLLELEQDPGVQVEGLTVQYLGQAP----EM .:. . :: ... .:: :: :::..: :.:. : : . :.:.: .:..: . mKIAA1 -SLERA---PGHDSTTTRL--RLDAFGQQLHLKLQPDSGFLAPGFTLQTVGRSPGSEAQH 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 mKIAA0 LG--GAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGALN----- : : . .::.:::: :.:.: : . :.. .: :. .:: : : . mKIAA1 LDPTGDLAHCFYSGTVNGDPGSAAALSLCEG-VRGAFYLQGEEFFIQPAPGVATERLAPA 160 170 180 190 200 230 240 250 mKIAA0 -----SAGGPGAHILRRKS----------------PASSQGPMCT-------VKAPS--- :.. : :::::. :.:.. : :. :. mKIAA1 VPEEESSARPQFHILRRRRRGSGGAKCGVMDDETLPTSDSRPESQNTRNQWPVRDPTPQD 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 -GSPS-PISRRTKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGTGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSI :.:: : : : :::.: :.:::..:::..:: :::.:::.::::....::. .::::: mKIAA1 AGKPSGPGSIRKKRFVSSPRYVETMLVADQSMADFHGSGLKHYLLTLFSVAARFYKHPSI 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 RNPVNLVVTR-LVIGPARKGPKW---GQVPPRPYAASAPGSGASTPLTTQILTTLTAILF :: ..:::.. ::: .:::. . . : . ..: . ::::: mKIAA1 RNSISLVVVKILVIYEEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQH--NSPSDRDPEHYDTAILF 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 TRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKP ::::::: ::::::::::::::::.:::...::::::.:::.:::::::::: ::..: mKIAA1 TRQDLCGSHTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHDDAKH 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 CTNLNGQGGSSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPA :..::: :.: :.:: ... .: .::::::: ..:.:::::.:.::.:::. :..::. mKIAA1 CASLNGVTGDS-HLMASMLSSLDHSQPWSPCSAYMVTSFLDNGHGECLMDKPQNPIKLPS 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 TFPGKDYDADRQCQLTFGPDSSHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCG .:: :::.::::.::: .:.:::. :..:::.: .: .::::: :::::: :: mKIAA1 DLPGTLYDANRQCQFTFGEESKHCPDAASTCTTLWCTGTSGGLLVCQTKHFPWADGTSCG 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 SSQACMGGRCLHVDQLKDFNVPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGG .. :..:.:.. ..: : .: :.:::::::::::::::::::.. :.: :::.::: mKIAA1 EGKWCVSGKCVNKTDMKHFATPVHGSWGPWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGG 570 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 KYCEGRRTRFRSCNTENCPHGSALTFREEQCAAYNHRTDL-FKSFPGPMDWVPRYTGVAP :::::.:.:.:::: :.:: ... ::::::: :.:. . : . : ..:.:.:.::.: mKIAA1 KYCEGKRVRYRSCNIEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGNEP-TVEWTPKYAGVSP 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 RDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVADGTPCSPDTSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKC .:.:::::.:...::..::.:.:.::::::::..::::::.:..::::::: :::::::: mKIAA1 KDRCKLTCEAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKC 690 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 mKIAA0 MVCGGDGSRCSKQSGSFKKFRYGYSDVVTIPAGATHILV--RQQGGSGLKSIYLALKLSD ::::.:: :.:.:: . : :: :.::::::::.: : :.: :: .. .::.. .: mKIAA1 GVCGGNGSTCKKMSGIVTSTRPGYHDIVTIPAGATNIEVKHRNQRGSRNNGSFLAIRAAD 750 760 770 780 790 800 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 GSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQN :.: :::..:: :.. :.: :::::..:: : . . .:: .:::.:::..:. mKIAA1 GTYILNGNFTLSTLEQDLTYKGTV-LRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLMVGHALR 810 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 mKIAA0 ARLRYSFFVPRPVPS-TPRPPPQDWLQRRAEILKILRKRPWAGRK ......:. . . : . : ..:. mKIAA1 PKIKFTYFMKKKTESFNAIPTFSEWVIEEWGECSKTCGSGWQRRVVQCRDINGHPASECA 870 880 890 900 910 920 >>mKIAA4060 ( 1035 res) mbg16808 (1035 aa) initn: 791 init1: 249 opt: 1083 Z-score: 939.4 bits: 185.2 E(): 3.5e-47 Smith-Waterman score: 1221; 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