FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0696.ptfa, 555 aa vs ./tmplib.26680 library 1768462 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6078+/-0.00685; mu= -3.7526+/- 0.454 mean_var=304.6277+/-75.372, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0735 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4123 ( 639 res) mbg05860 ( 639) 3017 334 2.9e-92 mKIAA4167 ( 342 res) mpj04828 ( 342) 311 46 4.4e-06 mKIAA0413 ( 1251 res) meh00513 (1251) 241 40 0.0017 mFLJ00045 ( 612 res) mfj40199 ( 612) 215 37 0.0074 >>mKIAA4123 ( 639 res) mbg05860 (639 aa) initn: 2160 init1: 2160 opt: 3017 Z-score: 1748.9 bits: 333.6 E(): 2.9e-92 Smith-Waterman score: 3017; 86.481% identity (86.826% ungapped) in 503 aa overlap (55-555:137-639) 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 PPPPPPGPIAAERRERGGAAGAAMEPDSVIEDKTIELMISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQK :. . . ..:::::.:: ..: ..:.: mKIAA4 KNSLRQTYNSCARLCINQETVCLTSTAMKTENCVAKAKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEK 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 EKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHI ::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .::::: mKIAA4 EKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHI 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 AENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL ::::::::::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: ::: mKIAA4 AENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYL 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 FKNRPTD--GPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYD :::.: : .:::::::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.:::::::::: mKIAA4 FKNKPPDENAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYD 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 DDKIISGLRDNSIKIWDKSSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNT :.::.::::::.:::::::.::: ..::::::::::::::::::.::::::::::::::. mKIAA4 DQKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNA 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 GEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVV ::.::::::: ::::::::.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: mKIAA4 GEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVV 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 DFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 DFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::: mKIAA4 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLMAALDPRAPAGTLCLRTLV 530 540 550 560 570 580 510 520 530 540 550 mKIAA0 EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR ::::::::::::::::.::::::::::::::: : . . :::::::::::: mKIAA4 EHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAHAEPPRSPSRTYTYISR 590 600 610 620 630 >>mKIAA4167 ( 342 res) mpj04828 (342 aa) initn: 278 init1: 133 opt: 311 Z-score: 201.6 bits: 46.4 E(): 4.4e-06 Smith-Waterman score: 426; 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