FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0726.ptfa, 959 aa vs ./tmplib.26680 library 1768058 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5179+/-0.00415; mu= 18.8651+/- 0.278 mean_var=77.2229+/-17.548, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 9 in 1/35 Lambda= 0.1459 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0911 ( 1035 res) mbg12625 (1035) 3191 682 1e-196 mKIAA4134 ( 1021 res) mfj12267 (1021) 1720 372 1.8e-103 mKIAA1775 ( 918 res) mbg01642 ( 918) 152 42 0.0004 mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 142 40 0.0016 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 142 40 0.0025 mKIAA0327 ( 933 res) mfj34062 ( 933) 136 39 0.0042 >>mKIAA0911 ( 1035 res) mbg12625 (1035 aa) initn: 3108 init1: 1667 opt: 3191 Z-score: 3624.1 bits: 682.1 E(): 1e-196 Smith-Waterman score: 3416; 52.854% identity (54.289% ungapped) in 946 aa overlap (9-948:79-1005) 10 20 30 mKIAA0 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:.:.:::::.:.::::..:::: ::.:.::.::.:.:::: mKIAA0 YKLTVTAYDCGKKRATEDVLVKISVKPTCSPGWQGWSSRIEYEPGTGALAVFPSIHLETC 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 DEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLS :::. ..:::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: .::: :. . :::.:: mKIAA0 DEPVASVQATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTSELLPSPSSSFNWTVGLP 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 VHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPAGLGSGPQDGFSDHFTLSFWMKHSVTPSKGKKEE . ..::. .. :::::::..: : . : :.. : :.: ::.:. : :.:.: mKIAA0 TDNGHDSDQVFEFNGTQAVRIP-DGVVTLD--PKEPF----TISVWMRHG--PF-GRKKE 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 ETIVCNTVQNEDGYSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHY ::.:.. ... . :::: :::::..:: : :. ::..: :::.::::..:::. mKIAA0 -TILCSSDKTDMNRHHYSLYVHGCRLVFLLRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEDWHHF 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 ALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKKG-GENST .::.: :.::::.::: .: . .. .:: . : :..:::: : .. :. . : .: mKIAA0 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QGTERFWRPAAQFESARGVTLFPDIKIVSTFA-KTEASGDMRATGTAPKSAVLEEMLHNL 700 710 720 730 740 750 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 DGCEISLVGDDLDPERESLLLDMASLQQRGLELTNTSAYLTIAGVETITVYEEILRQARY : :.: ..: ::::..: : :. . :.:: :. ::..: .: :: ... ::..:.. :: mKIAA4 DFCDILVLGGDLDPRQECLELNHSELHQRHLDATNSTAGYSIYGVGSMNRYEQVLHHLRY 760 770 780 790 800 810 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 QLRHGAALYARKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVA---HPSHVLSSQQFLHR . : ..: .:.::..:::.::::.:::: .::.::: . ::. : .:.. . ::. mKIAA4 RNWHPTSLETRRFRIKCSELNGRYTSNEFNLEVSVLHEV-RVSDKEHVNHLIVQPPFLQS 820 830 840 850 860 870 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 GHQPPPEMAGHSLASSHRNSMVPSAATLIIVVCVGFLVLMVILGLVRIHSLHRRVSGTGG :.: .. .: .:.:.::: ::..:.. : .::..: .:. :.. :.. mKIAA4 VHHP------ETRSSIQRSSVVPSIATVVIIISVCMLVFVVAMGVYRVRIAHQHFIQE-- 880 890 900 910 920 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 PSGASTDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQ---NQQTCVAGVAGGQQEEEDSSDSEAAD . :. .. :::::::: :::::... : . .. : .. :: ::.: ... mKIAA4 ----TEAAKEAEMDWDDSALTITVNPMEKHEGPGNGEDETTEVEEEEEAEEGSSSSSSGS 930 940 950 960 970 980 950 mKIAA0 SPSSDERRIIESPPHRY . : .:. mKIAA4 DDSEEEEEEGMGRVRHGQSGTSSQSPERSTWNTAGVINIWK 990 1000 1010 1020 >>mKIAA1775 ( 918 res) mbg01642 (918 aa) initn: 95 init1: 63 opt: 152 Z-score: 166.4 bits: 42.1 E(): 0.0004 Smith-Waterman score: 152; 26.708% identity (27.389% ungapped) in 161 aa overlap (85-242:245-404) 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 ALDKDAPLRYAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQKEHTFTIQA .:. .: ..: .: : .. : .:. : mKIAA1 IFKVQAEDKDTGSGGSVTYSLQNLHSSKFSMDRHSGVLRLQAGATLDYEKSRAHYITVIA 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 YDCGEGPDGTNTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLY-DRILRVEAID : : :.. : .:: . :.::.. ::.:: : . : : : ...: : ::: mKIAA1 KDGGGRLRGADMVFSATTTVTINVEDVQDTAPIFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLTVVAID 280 290 300 310 320 330 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 GDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDN-DGNIENTEKLQYSGEKLYKFTVTAYDCGKK-RA :: . ..: : . . : :.. .: : .. ...:.. : . . .. mKIAA1 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