FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0306.ptfa, 1359 aa vs ./tmplib.26680 library 1767658 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7105+/-0.00952; mu= -26.1715+/- 0.625 mean_var=729.2967+/-177.701, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0475 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848) 400 44 0.00038 mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 321 38 0.009 >>mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848 aa) initn: 476 init1: 158 opt: 400 Z-score: 166.8 bits: 43.7 E(): 0.00038 Smith-Waterman score: 570; 23.163% identity (27.345% ungapped) in 1334 aa overlap (140-1354:79-1327) 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 FSHSGVHSLDGGEVDSQALQELTQMVSGPASYSGPKPSPQYGAPGSFAAPGEGGTLA--- ..:: :.: : : : . .. mKIAA1 PPPRHLPTQFNLLASSSAATAAEPSSPQLYNFSGAAPGP----PPERALPRQDTVIKHYQ 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 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