FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1297.ptfa, 1171 aa vs ./tmplib.26680 library 1767846 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4416+/-0.0101; mu= -26.2545+/- 0.667 mean_var=677.2429+/-164.220, 0's: 0 Z-trim: 32 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0493 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4163 ( 536 res) mfj30170 ( 536) 487 50 1.1e-06 mKIAA0968 ( 487 res) mbg13747 ( 487) 479 50 1.5e-06 mKIAA1142 ( 597 res) mph00410 ( 597) 462 48 4.1e-06 mKIAA0175 ( 648 res) mpj02836 ( 648) 447 47 9.1e-06 mKIAA0369 ( 791 res) mbg01404 ( 791) 442 47 1.3e-05 mKIAA4088 ( 652 res) mph00951 ( 652) 424 46 2.8e-05 mKIAA0096 ( 750 res) mbh04151 ( 750) 385 43 0.00021 mKIAA4230 ( 408 res) mbg00138 ( 408) 364 41 0.00039 mKIAA1278 ( 1271 res) mfj16286 (1271) 376 43 0.00048 mKIAA1477 ( 771 res) mfj36325 ( 771) 368 42 0.0005 mKIAA4207 ( 780 res) mph00550 ( 780) 365 42 0.00059 mKIAA4256 ( 705 res) mfj04284 ( 705) 361 41 0.00067 mFLJ00263 ( 695 res) mnh05102 ( 695) 355 41 0.00089 mKIAA0537 ( 575 res) mfj00259 ( 575) 343 40 0.0014 mKIAA0787 ( 419 res) mbg06488 ( 419) 321 38 0.0033 mKIAA4026 ( 986 res) mbg12171 ( 986) 330 39 0.0039 >>mKIAA4163 ( 536 res) mfj30170 (536 aa) initn: 365 init1: 175 opt: 487 Z-score: 212.4 bits: 50.1 E(): 1.1e-06 Smith-Waterman score: 487; 29.252% identity (30.605% ungapped) in 294 aa overlap (870-1154:38-327) 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 TVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAK : ..:: ..: :.::: : . ::. ..:: mKIAA4 GKPGLFACRPSHCPDPAMASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAK 10 20 30 40 50 60 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 IV---PYAAEGKRRVLQEYEVLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLS :. .:. .... .: .. : :.: .. ::.. . :. . . ::. . mKIAA4 IINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIV 70 80 90 100 110 120 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 DRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAADN---ALKIVDFGSAQP : ::: :.. . :.:..... : . ..: :.::.:::::. . :.:..::: : mKIAA4 AREYYSEADASHCIQQILESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIE 130 140 150 160 170 180 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 YNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDPIGSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQET . . .: .:: ...::... :: :. .:.:. ::. ::.: :: ::.. : .. mKIAA4 VQGDQQAWFGF-AGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRL 190 200 210 220 230 240 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 EARIVGGRFD-AFQLYPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWL--QDAYLMKL .: .: .: . ... : .. :.:...: .: . .. : :::. ... . mKIAA4 YQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMM 250 260 270 280 290 300 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 RRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRHKVLLRSYPGSP .:: :.. ::.: .... . : mKIAA4 HRQE---TVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKINNKANVVTSP 310 320 330 340 350 360 >>mKIAA0968 ( 487 res) mbg13747 (487 aa) initn: 352 init1: 175 opt: 479 Z-score: 209.8 bits: 49.5 E(): 1.5e-06 Smith-Waterman score: 479; 28.615% identity (30.000% ungapped) in 325 aa overlap (854-1169:6-324) 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 APQAPAPEPPPEPTKVTVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPPQKPYTFLEEKARGRFGV :. . .:. . : ..:: ..: :.: mKIAA0 SLACLPSARMATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSV 10 20 30 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 VRSCRENATGRTFVAKIV---PYAAEGKRRVLQEYEVLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLV :: : . .:. ..:::. .:. .... .: .. : :.: .. ::.. . mKIAA0 VRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHY 40 50 60 70 80 90 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 LIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAAD :: . . ::. . : ::: :.. . :.:... . : :.: :.::.:::::. mKIAA0 LIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASK 100 110 120 130 140 150 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 ---NALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDPIGSATDIWGAGVLTYI :.:..::: : . . .: .:: ...::... :: :. .:.:. ::. :: mKIAA0 LKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGF-AGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYI 160 170 180 190 200 210 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA1 MLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFD-AFQLYPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDC .: :: ::.. : .. .: .: .: . ... : .. :.:...: .: . . mKIAA0 LLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEA 220 230 240 250 260 270 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 LAHPWLQDAYLMK--LRRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRHKVLLRSYPGSP : :::.. . ..:: :.. ::.: . ::. : . :.. :. mKIAA0 LKHPWISHRSTVASCMHRQE---TVDCLKKFNA--RRKLKGAILTTMLATRNFSGGKSGG 280 290 300 310 320 mKIAA0 NKKNDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAF 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA1142 ( 597 res) mph00410 (597 aa) initn: 427 init1: 169 opt: 462 Z-score: 202.1 bits: 48.4 E(): 4.1e-06 Smith-Waterman score: 505; 27.386% identity (30.698% ungapped) in 482 aa overlap (657-1125:139-581) 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 VDGESVWHPVSSGIPDCYYNVTQLPVGVTVRFRVACSNRAGQGPFSNPSEKVFIRGTP-- : :.. ..::.: :. ..: . : mKIAA1 PPPPARAHQENGMLEERAAPARMAPDKAGSRARATGHSEAGSG--SGDRRRVGPEKRPKS 110 120 130 140 150 160 690 700 710 720 730 mKIAA1 --DSPAQPAAAPRDAPVTSGP-TRAPPPDSPTSLAPTPALAPPAS--QASTLSPSTSSMS :.:. : : :: ::: . .: : : :: . : : . .:.: : .... mKIAA1 SRDGPGGPQEASRDKRPLSGPDVSTPQPGSLTSGTKLAAGRPFNTYPRADTDHPPRGAQG 170 180 190 200 210 220 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 ANQALSSLKAVGPPPATPPRKHRGLLATQQAEPSPPSIVVTPSEPRSFVPDTGTLTP-TS ... : . : :: :: : :.. : : :.. :. .:. :.: : .: mKIAA1 EPHTM----APNGPSAT------GLAAPQSSSSSRP-----PTRARG-APSPGVLGPHAS 230 240 250 260 270 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 SPQGVKPAPSSTSLYMVTSFVSAPPAPQAPAPEPPP-EPTKVTVRSLSPAKEVVSSPTPE :: . :: . .. ..:::: :.:. : :: .:. ... : ..: .: mKIAA1 EPQLAPPARALAA-------PAVPPAPGPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDP--- 280 290 300 310 320 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 STTLRQGPPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAKIVPYAAEGKRRVL-QEYE : :.. . . ..: :.: ..:. ..: . . .:..: .: mKIAA1 ------GDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVV 330 340 350 360 370 920 930 940 950 960 970 mKIAA1 VLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQG ..: .:: .. ....:.. : .. : . : . . :..:...:. . .::. mKIAA1 IMRDYRHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALT-DIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQA 380 390 400 410 420 430 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 LDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHR---TGTLEFMA : ::.. :.: ::: :..::. :. .:. ::: . :. : . .: .:: .:: mKIAA1 LAVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFG----FCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMA 440 450 460 470 480 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 PEMVKGDPIGSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFDAFQLYPNTSQ ::... : : .:::. ::.. :..: :... : .. : . .. ..: mKIAA1 PELISRLPYGPEVDIWSLGVMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKASP 490 500 510 520 530 540 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 SATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRR : :: ..: : .: . . : ::.: : mKIAA1 SLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLTKAGPPASIVPLMRQHRTR 550 560 570 580 590 1160 1170 mKIAA1 AEAATRHKVLLRSYPGSP >>mKIAA0175 ( 648 res) mpj02836 (648 aa) initn: 194 init1: 166 opt: 447 Z-score: 195.9 bits: 47.4 E(): 9.1e-06 Smith-Waterman score: 447; 29.242% identity (30.112% ungapped) in 277 aa overlap (868-1140:14-286) 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 KVTVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFV : : . : . : :. :. . ::. . mKIAA0 PSRWTMKDYDELLKYYELYETIGTGGFAKVKLACHVLTGEMVA 10 20 30 40 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 AKIVPYAAEGKR--RVLQEYEVLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGL ::. : :. :: : ..:..:.:... .:... : . .. : : . ::. . mKIAA0 IKIMDKNALGSDLPRVKTEIDALKSLRHQHICQLYHVLETKNKIFMVLEYCPGGELFDYI 50 60 70 80 90 100 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 SDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAADNALKIVDFG-SAQPY .. : ::... . :.:... :.:.. : :.::.:::. .. ::..::: :.: mKIAA0 ISQDRLSEEETRVVFRQILSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDENHKLKLIDFGLCAKPK 110 120 130 140 150 160 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 NPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDP-IGSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQET . . . : :.: . :::...: .:: .:.:. :.: :... :. :: . . . mKIAA0 GNKDYH-LQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMAL 170 180 190 200 210 220 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 EARIVGGRFDAFQLYPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQ .:. :.... . : :. :.:...:.: : .: :... : :::... : .. : mKIAA0 YKKIMRGKYEVPKWL---SPSSILLLQQMLQVDPKKRISMRNLLNHPWVMQDYSCPVEWQ 230 240 250 260 270 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 TLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRHKVLLRSYPGSP . : :. mKIAA0 SKTPLTHLDEDCVTELSVHHRSSRQTMEDLISSWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPARLQL 280 290 300 310 320 330 >>mKIAA0369 ( 791 res) mbg01404 (791 aa) initn: 267 init1: 225 opt: 442 Z-score: 192.9 bits: 47.1 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 472; 30.328% identity (32.938% ungapped) in 366 aa overlap (793-1133:348-709) 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 GLLATQQAEPSPPSIVVTPSEPRSFVPDTGTLTPTSSPQGVKPAPSSTSLYMVTSFVSAP : .: : .. .:: .:. : .:.: mKIAA0 QDDFLLDESECRVVKSTSYTKIASASRRGTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTP 320 330 340 350 360 370 830 840 850 860 870 mKIAA1 PAPQAPAPEP--PPEPTKVTVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPP---------QKPYT . ..:.: : : : . . . .. .:: :. .. : : : : mKIAA0 RSGKSPSPSPTSPGSLRKQRISQHGGSSTSLSSTKVCSSMDENDGPGEEESEEGFQIPAT 380 390 400 410 420 430 880 890 900 910 920 mKIAA1 FLEEKARGR------FGVVRSCRENATGRTFVAKIVPYAA-EGKRRVLQ-EYEVLRTLHH . :. :: :.::. : : .:.: .. ::. . .::....: : .:: ..: mKIAA0 ITERYKVGRTIGDGNFAVVKECIERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKH 440 450 460 470 480 490 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 ERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGH .. : : . .: : :. : . .:. .... .:.: :.. .. .: ... :::. mKIAA0 PNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTSKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSL 500 510 520 530 540 550 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 HVLHLDIKPDNLLLA----ADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKG ...: ::::.:::. ....::. ::: : . :: :: ..:::.. mKIAA0 NIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDG----PLYTVCGTPTYVAPEIIAE 560 570 580 590 600 610 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 DPIGSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQETE-ARIVGGRFDAFQLY-PNTSQSATL : .:::.:::.:::.: :. :: : ::. .:. :. : . : :.:.:: mKIAA0 TGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKE 620 630 640 650 660 670 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 FLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAA .. .: :. .: : . : :::..: : . ..: mKIAA0 LINMMLLVNVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPSSTAAGV 680 690 700 710 720 730 1160 1170 mKIAA1 TRHKVLLRSYPGSP mKIAA0 SVIATTALDKERQVFRRRRNQDVRSRYKAQPAPPELNSESEDYSPSSSETVRSPNSPF 740 750 760 770 780 790 >>mKIAA4088 ( 652 res) mph00951 (652 aa) initn: 246 init1: 144 opt: 424 Z-score: 187.1 bits: 45.7 E(): 2.8e-05 Smith-Waterman score: 436; 29.114% identity (30.976% ungapped) in 316 aa overlap (830-1133:31-339) 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 PQGVKPAPSSTSLYMVTSFVSAPPAPQAPAPEPPPEPTKVTVRSLSP-AKEVVSSPTP-- : : . .. .: : : ...:: : mKIAA4 ARGSARAATAARPTPPRGPRTMESVALLQRPSQAPSASALASESARPLADGLIKSPKPLM 10 20 30 40 50 60 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 -ESTTLRQGPPQK---PYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAK-IVPYAAEGKRRV .... :. .. : ::: ..: .: :.. ::. .:: . : : . .. . mKIAA4 KKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDL 70 80 90 100 110 920 930 940 950 960 mKIAA1 LQ---EYEVLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVAT :. : :.. .:.: .....::.. . .:.. : . .: .:.: : :: :. mKIAA4 LHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERPRLSERDARH 120 130 140 150 160 170 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 YVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGT . :....: : : . ..: :.: .:.:: :.. .::.::: .. :. : : :. mKIAA4 FFRQIVSALHYCHQNGIVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHKG--KFLQTFCGS 180 190 200 210 220 230 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 LEFMAPEMVKGDP-IGSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFDAFQL . .::.:.: : .: .: :. ::: ::.. : :: : . .: .: :.. mKIAA4 PLYASPEIVNGKPYVGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGQDHKTLVKQISNG---AYRE 240 250 260 270 280 290 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA1 YPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQTLTFTTNRLKEFRG :. :.. : .: .: :.: : .:.: .: :.. .: . .: mKIAA4 PPKPSDACGL-IRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYTTGVGEQEALREGGHPSGDFG 300 310 320 330 340 350 1150 1160 1170 mKIAA1 EQRRRRAEAATRHKVLLRSYPGSP mKIAA4 RASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHVPGGGSTVPGLERQHSLKKSRKENDMAQNLQ 360 370 380 390 400 410 >>mKIAA0096 ( 750 res) mbh04151 (750 aa) initn: 198 init1: 136 opt: 385 Z-score: 171.3 bits: 43.0 E(): 0.00021 Smith-Waterman score: 385; 29.008% identity (30.769% ungapped) in 262 aa overlap (870-1123:18-272) 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 TVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAK : . . .::.:.::. :. ::. ..: mKIAA0 TSMAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVK 10 20 30 40 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 IVPYA-----AEGKRRVLQEYEVLRTLHHERLMSLHEAYITPRYLVLIAE-SCGNRELLC .. . : :. ..:: . .. ..: .. :.:. : : :: : . :. . mKIAA0 VIDKTKLDTLATGH--LFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDY 50 60 70 80 90 100 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 GLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPDNLLLAADNAL-KIVDFGSAQ .. . .:: . : .:......: : ::.: :.::.:... ..: :..::: .. mKIAA0 IMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSN 110 120 130 140 150 160 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 PYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDPIGS-ATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQ ..: : : :.: . :::.. :: . :.:::. ::. .... : :: : . . mKIAA0 KFQPG--KKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDS 170 180 190 200 210 220 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 ETEARIVGGRFDAFQLYPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLR :: . :. .. . : .: . .. ..:. : : ::.. .::::: mKIAA0 ETLTMIMDCKYT---VPPRVSAGCRDLITRMLQRDPKRRASLEEIESHPWLQGVDPSPAT 230 240 250 260 270 280 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 RQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRHKVLLRSYPGSP mKIAA0 KYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILR 290 300 310 320 330 340 >>mKIAA4230 ( 408 res) mbg00138 (408 aa) initn: 190 init1: 122 opt: 364 Z-score: 166.6 bits: 41.3 E(): 0.00039 Smith-Waterman score: 364; 26.370% identity (27.798% ungapped) in 292 aa overlap (835-1122:35-315) 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 PAPSSTSLYMVTSFVSAPPAPQAPAPEPPPEPTKVTVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQG : :. : :: . .. ..: . :. mKIAA4 PKIWQYCMSSHFLVFVYITFQHISHGDGRQEVTSRTGRSGARCRNSIASCADEQ------ 10 20 30 40 50 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 PPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAKIVPYAA---EGKRRVLQEYEVLRTL : : .:. ..: :. :. :. ::: . ::. . . .....: .... : mKIAA4 PHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKIL 60 70 80 90 100 110 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 HHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLH .: ...: :. : . : :: : .. :.. : . :..: .. . :......: : mKIAA4 NHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCH 120 130 140 150 160 170 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 GHHVLHLDIKPDNLLLAADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDP ....: :.: .:::: :: .::.::: .. .. . : :. . :::. .: mKIAA4 QKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGS--KLDTFCGSPPYAAPELFQGKK 180 190 200 210 220 230 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA1 I-GSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFDAFQLYPNTSQSATLFLR : .:.:. ::. : ..:: :: . .: . :.. :.. . .: .:. .:. mKIAA4 YDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYR-IPFYMSTDCEN--LLK 240 250 260 270 280 290 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA1 KVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRH . : ..: .: .:.. . :.. mKIAA4 RFLVLNPVKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEI 300 310 320 330 340 350 >>mKIAA1278 ( 1271 res) mfj16286 (1271 aa) initn: 179 init1: 179 opt: 376 Z-score: 164.9 bits: 42.6 E(): 0.00048 Smith-Waterman score: 376; 31.390% identity (32.558% ungapped) in 223 aa overlap (850-1066:18-238) 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 SAPPAPQAPAPEPPPEPTKVTVRSLSPAKEVVSSPTPESTTLRQGPP---QKPYTFLEEK . :: .: : : . : .. : :: mKIAA1 SVPGSKTGLPDVWNYPWIYSSLSPSSFYLLRDPETLAMEKYHVLEMI 10 20 30 40 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 ARGRFGVVRSCRENATGRTFVAKIVPYAAEGKR--RVLQ-EYEVLRTLHHERLMSLHEAY ..: :: : . :.. .... . :..: ..... : :: : :..: : : .. . ... mKIAA1 GEGSFGRVYKGRKKYSAQVVALKFIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLWHPNIVHMLDSF 50 60 70 80 90 100 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 ITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLHGHHVLHLDIKPD : . .:.... .. ::. : : . ::.: . ..::...: :::.:..:: :.::. mKIAA1 ETDKEVVVVTDY-AEGELFQILEDDGKLPEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQ 110 120 130 140 150 160 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 NLLLAADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDPIGSATDIWGAGV :.::: ...:. ::: :. .. ... : :: .:.::.:. : ..:.:..: mKIAA1 NILLAKGGGIKLCDFGFARAMSTNTMV-LTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGC 170 180 190 200 210 220 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA1 LTYIMLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFDAFQLYPNTSQSATLFLRKVLSVHPWSRPSL . : . : ::: mKIAA1 ILYELAVGTPPFYTTSIFQLVSLILKDPVRWPSTISVITEPAGSDLGTPFTSRLPPELQV 230 240 250 260 270 280 >>mKIAA1477 ( 771 res) mfj36325 (771 aa) initn: 136 init1: 82 opt: 368 Z-score: 164.6 bits: 41.8 E(): 0.0005 Smith-Waterman score: 368; 26.370% identity (27.899% ungapped) in 292 aa overlap (836-1122:6-286) 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 APSSTSLYMVTSFVSAPPAPQAPAPEPPPEPTKVTVRSLSP-AKEVVSSPTPESTTLRQG :.: . :. : .. ..: : :. mKIAA1 ETHIPPAKSSSRQNLPRCRNSITSATDEQ------ 10 20 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 PPQKPYTFLEEKARGRFGVVRSCRENATGRTFVAKIVPYAA---EGKRRVLQEYEVLRTL : : . . ..: :. :. :. ::: ..::. . . .....: .... : mKIAA1 PHIGNYRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRTMKIL 30 40 50 60 70 80 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 HHERLMSLHEAYITPRYLVLIAESCGNRELLCGLSDRFRYSEDDVATYVVQLLQGLDYLH .: ...: :. : . : :. : .. :.. : . :..: .. . :......: : mKIAA1 NHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCH 90 100 110 120 130 140 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 GHHVLHLDIKPDNLLLAADNALKIVDFGSAQPYNPQALKPLGHRTGTLEFMAPEMVKGDP . ..: :.: .:::: :: .::.::: .. .. . . : :. . :::. .: mKIAA1 QKCIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT--VGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKK 150 160 170 180 190 200 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA1 I-GSATDIWGAGVLTYIMLSGYSPFYEPDPQETEARIVGGRFDAFQLYPNTSQSATLFLR : .:.:. ::. : ..:: :: . .: . :.. :.. . .: .:. .:. mKIAA1 YDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYR-IPFYMSTDCEN--LLK 210 220 230 240 250 260 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA1 KVLSVHPWSRPSLQDCLAHPWLQDAYLMKLRRQTLTFTTNRLKEFRGEQRRRRAEAATRH :.: ..: .: ::.. . :.. mKIAA1 KLLVLNPIKRGSLEQIMKDRWMNVGHEEDELKPYSEPELDLSDAKRIDIMVTMGFARDEI 270 280 290 300 310 320 1171 residues in 1 query sequences 1767846 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:40:09 2006 done: Mon Mar 27 10:40:11 2006 Scan time: 1.160 Display time: 0.380 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]