FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1122.ptfa, 1071 aa vs ./tmplib.26680 library 1767946 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9514+/-0.00583; mu= 7.5373+/- 0.387 mean_var=167.2221+/-39.845, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0992 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1259 ( 1196 res) mpm05149 (1196) 532 89 4.1e-18 mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945) 436 76 7.9e-14 mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890) 406 71 1.5e-12 mKIAA0809 ( 1368 res) mbp01279 (1368) 245 48 1e-05 mKIAA2023 ( 1687 res) mtg03092 (1687) 187 40 0.0038 >>mKIAA1259 ( 1196 res) mpm05149 (1196 aa) initn: 1231 init1: 517 opt: 532 Z-score: 417.5 bits: 89.1 E(): 4.1e-18 Smith-Waterman score: 903; 29.504% identity (42.561% ungapped) in 766 aa overlap (527-1065:151-908) 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 RDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNREQPSLLNQSLSLKPYQKVGLNWLALV : . ::...: .: : :: :.:::: . mKIAA1 ESRAAALRAADKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL--KGYQLKGMNWLANL 130 140 150 160 170 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 HKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLFQEGNK-GPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPS ...:.:::::::::::::.:.::.::.: .. : :: ::. ::::..:: .: . . :. mKIAA1 YEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPK 180 190 200 210 220 230 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 LNVLCYYGSQEERKQIRFNIHNKYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEG ..:: :.:. ..:.: ..... ..:..:.:. ... : . :.:.: .: ..::. mKIAA1 FKVLPYWGNPHDRSQK--TLYTQDAPFHVVITSYQLVVQ---DVKYFQRVKWQYMVLDEA 240 250 260 270 280 290 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 HMLKNMGSIRYQHLMTINARNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMF . ::. .:.:.. :. .. ::::::::::.::.. :: .::.:.:: .:.: :. . : mKIAA1 QALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHE-EFNEWF 300 310 320 330 340 350 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 SSKTKP-ADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKLLPPKKDRIELCAMSEKQEQ :. . :...: ....... ..:.:::.:::.:..: . : : . . : .. .:. mKIAA1 SKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILTYCQLTSRQKL 360 370 380 390 400 410 800 810 820 830 mKIAA1 LYSGLFNR------LKKSINNLEK--NTE--MCNVMMQLRKMANHP-LLHRQY------- ::..: :. :..:... .. :: . :..::.::. ::: :..:: mKIAA1 LYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHI 420 430 440 450 460 470 840 mKIAA1 ----------------------------------YTPEKLK------------------- ..:. .. mKIAA1 SLKPYEISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLKVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGINEGSCFSFLR 480 490 500 510 520 530 850 mKIAA1 -------EMSQLMLK--------------------------EP---TH------------ ::..:::. :: .: mKIAA1 FIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWAEPDGTSHQSYLRNKDFLLG 540 550 560 570 580 590 860 870 880 mKIAA1 ------------CEANPDLIFEDM-EVMTDFELHV----------------------LCK : .:.: . .... . :: :: mKIAA1 VDFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDHVVHQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCV 600 610 620 630 640 650 890 mKIAA1 QYQHINSYQLDM------------------------------------------------ .... :: mKIAA1 ASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERGVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEP 660 670 680 690 700 710 900 910 920 930 mKIAA1 ----------------------DLILDSGKFRALGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDI .:: ::::. :: .:..::..: ::...::.: :.:. mKIAA1 AGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDL 720 730 740 750 760 770 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 LEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVI :: . ...: :.::::...:::: .. .:.: :::::::::.:::::::::.:..:: mKIAA1 LEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVI 780 790 800 810 820 830 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 LHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVD ..: : :: :.:: :: ::.::::.: : .:: .::::: .:. ..: .... . . mKIAA1 FYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGG 840 850 860 870 880 890 1060 1070 mKIAA1 EADEGSM-PADIATLLKTSMGL . .. : ....:: mKIAA1 NFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKERKRKREKYAEKKKKED 900 910 920 930 940 950 >>mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945 aa) initn: 920 init1: 263 opt: 436 Z-score: 340.6 bits: 75.6 E(): 7.9e-14 Smith-Waterman score: 910; 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