FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1015.ptfa, 831 aa vs ./tmplib.26680 library 1768186 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1637+/-0.00522; mu= 10.6785+/- 0.345 mean_var=165.3064+/-41.963, 0's: 0 Z-trim: 60 B-trim: 152 in 1/35 Lambda= 0.0998 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 1454 222 1.8e-58 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 1329 204 6.2e-53 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 1082 168 2e-42 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 1063 166 1.8e-41 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 982 154 6.3e-38 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 971 153 2e-37 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 960 151 4.6e-37 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 940 148 2.8e-36 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 938 147 3.8e-36 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 929 146 9.2e-36 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 909 143 6.6e-35 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 904 142 1e-34 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 899 142 1.7e-34 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 899 142 1.8e-34 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 896 142 2.8e-34 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 864 137 7e-33 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 864 137 7e-33 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 801 128 3.3e-30 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 793 127 8.1e-30 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 750 120 4.8e-28 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 710 115 3e-26 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 663 108 3e-24 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 643 105 3.2e-23 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 632 103 6.8e-23 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 602 99 1.4e-21 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 542 91 6.5e-19 mKIAA4071 ( 207 res) mpf00551 ( 207) 498 84 2.5e-17 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 457 78 2.9e-15 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 416 73 3.4e-13 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 398 69 3.5e-13 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 400 70 7.8e-13 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 390 69 3.6e-12 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 367 65 2.1e-11 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 372 67 2.3e-11 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 361 65 4.3e-11 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 359 65 8.5e-11 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 330 60 7e-10 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 331 60 7e-10 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 328 60 1.4e-09 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 297 55 2.7e-08 mKIAA4092 ( 180 res) mpk02569 ( 180) 268 50 2.1e-07 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 276 53 2.7e-07 mKIAA0287 ( 1618 res) mbg03130 (1618) 277 53 3.3e-07 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 265 51 5.4e-07 mKIAA1483 ( 492 res) mth00273 ( 492) 263 50 6.4e-07 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 262 50 7.4e-07 mFLJ00134 ( 174 res) mbg08825 ( 174) 250 48 1.2e-06 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 256 49 1.3e-06 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 249 48 3.2e-06 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 237 47 1e-05 >>mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 (558 aa) initn: 5752 init1: 1036 opt: 1454 Z-score: 1142.3 bits: 221.8 E(): 1.8e-58 Smith-Waterman score: 1509; 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