FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0202.ptfa, 470 aa vs ./tmplib.26680 library 1768547 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2085+/-0.00646; mu= 4.8169+/- 0.431 mean_var=234.4566+/-53.979, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 29 in 1/35 Lambda= 0.0838 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0128 ( 449 res) mfj19346 ( 449) 2058 261 1e-70 mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 ( 391) 933 125 7.7e-30 mKIAA0158 ( 367 res) mpm05359 ( 367) 811 111 2e-25 mKIAA0991 ( 605 res) mph02064 ( 605) 792 108 1.3e-24 mKIAA4169 ( 281 res) mbg08918 ( 281) 607 86 4.6e-18 >>mKIAA0128 ( 449 res) mfj19346 (449 aa) initn: 2051 init1: 2051 opt: 2058 Z-score: 1362.2 bits: 261.3 E(): 1e-70 Smith-Waterman score: 2058; 75.854% identity (75.854% ungapped) in 410 aa overlap (61-470:40-449) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 PQPARPVRSSPWRPPTWNASRTQSLSPGACPWAAMLGLTASLTSWSVKSVTQGFSFNILC : :. .:. . . :::.::: ::::: mKIAA0 AEAPEAALADQGAMAAADIARQVGEDCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILC 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 VGETGIGKATLMNTLFNTTFETEEASHHEECVRLRPQTYDLQESNVHLKLTIVDAVGFGD :::::.::.:::.::::: :: : :.: . :.:. .::::::::: ::::::..::::: mKIAA0 VGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVGLKLTIVSTVGFGD 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 QINKDDSYRPIVDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDL ::::.:::.:::..:::::: :::::::::: : .:::.:::::::::.::::::::::: mKIAA0 QINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHSYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLDL 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 VTMKKLDSKVNIIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINA ::::::::::::::.:::.:.:::::: :::::: .:::::::::::::::::.:.:::. mKIAA0 VTMKKLDSKVNIIPVIAKSDAISKSELAKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVSEING 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 VMNAHLPFAVVGSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLR .:::::::::::::::::.:::..::::::::.:::::: :::::::::::::::::::: mKIAA0 TMNAHLPFAVVGSTEEVKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLR 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 EQTHSRHYELYRRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFV ::::.::::::::::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::.:::.:::::::::: mKIAA0 EQTHARHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFV 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 NKVKETELELKEKERELHEKFEHLKRIHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNCRKAAMEALQ ..::: : :::: :.::::::..::..:::::.:.:.:.. :.:: :::. :::: : :: mKIAA0 QRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQEEKKKLEDKKKCLDEEMNAFKQRKAAAELLQ 370 380 390 400 410 420 460 470 mKIAA0 SQALHATSQQPLRKDKDKKN ::. .: ..: :..::.::: mKIAA0 SQGSQAGGSQTLKRDKEKKN 430 440 >>mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 (391 aa) initn: 878 init1: 309 opt: 933 Z-score: 628.1 bits: 125.3 E(): 7.7e-30 Smith-Waterman score: 933; 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