FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0816.ptfa, 1168 aa vs ./tmplib.26680 library 1767849 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7325+/-0.00466; mu= 12.1418+/- 0.312 mean_var=106.9545+/-24.369, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 8 in 1/35 Lambda= 0.1240 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4142 ( 1639 res) mpm06020 (1639) 2757 505 3.4e-143 >>mKIAA4142 ( 1639 res) mpm06020 (1639 aa) initn: 1943 init1: 1496 opt: 2757 Z-score: 2663.1 bits: 505.2 E(): 3.4e-143 Smith-Waterman score: 2757; 48.063% identity (48.771% ungapped) in 826 aa overlap (63-883:58-876) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 CLPSGQNYTCACPTGFRKINSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADV .:::: : :.: .. : . .. . . mKIAA4 TAPTRAPPPPPPPLLLLVLYCSLVPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGVKLESTIVA-SGL 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 mKIAA0 RSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTG---QEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNK ..:.:.:.. ::::::: ..:... . :: :..:. ..: :: ::: ::: .: mKIAA4 EDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAAQNIVI-SGLVSPDGLACDWVGKK 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 LYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGM :::::. :.:::::: .:. : ::.:..::.:: :...: ::::::::: .:.:::::: mKIAA4 LYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGEAPRIERAGM 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 DASSRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPF :.:.:..:..:.. :::::.:: :.:::::: .. :. :.:::: :. .. ..: ::: mKIAA4 DGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSFRQKVVEGSLTHPF 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 GLTLYGQRIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRQR-PPVTTLCAV .::: :. .:::::::.::.. .. :: .:. . : . :::.:. ..: :: : : mKIAA4 ALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKWTGEQRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPPFHTPCEE 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLRDGKTCSPGMNSFLIFARRIDVRMVSLDIPY .::::::::: :: .::.::::..: .::::. : . :..::: :.: .::: : mKIAA4 DNGGCSHLCLLSPREPFYSCACPTGVQLQDNGKTCKTGAEEVLLLARRTDLRRISLDTPD 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 FADVVVPINMTMKNTIAIGVDPLEGKVYWSDSTLHRISRASLDGSQHEDIITTGLQTTDG :.:.:. .. ....::: ::::: :::.:. .. : :: :::: . ...: .. :: mKIAA4 FTDIVLQVG-DIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDG 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 LAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGE .::: ..:..:::::::.:::: :.:. ::.:: ..:: ::::::. ::.:::::::: mKIAA4 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIVLHPVMGLMYWTDWGE 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 NAKLERSGMDGSDRTVLINNNLGWPNGLTVDKTSSQLLWADAHTERIEVADLNGANRHTL : :.: ...:: :: ::.:..:::::::..: ..: :.::.:..::: ...:..:.:: mKIAA4 NPKIECANLDGRDRHVLVNTSLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINIDGTKRKTL 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 V-SPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKSTGSNVILVRSNLPGLMDIQAVDRAQP . . . : .:.::: ..::::::: :::.:. : .: ... ..:: :: ..::. :. mKIAA4 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVII-DQLPDLMGLKAVNVAKV 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 LGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDRKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRI .: : :.. ::::::::. : . .:.:: :..: .: ::: ::..:.:.::..:.:: mKIAA4 VGTNPCADGNGGCSHLCFFTPRATKCGCPIGLELLSDMKTC-IIPEAFLVFTSRATIHRI 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 SLDTDDHTDVHVPVPGLNNVISLDYDSVHGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGHGL ::.:... :: .:. :.... .::.: ....:.::: : .: :: .:::..: :: :: mKIAA4 SLETNNN-DVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVIEFGL 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 KTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFW .:.::::...::::.::: : ::..::::. :.::. .::.::..:. : :::..: mKIAA4 DYPEGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYW 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 TDWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGK :.:: .: :: .::.. .:.. .: : ::.:: .:.::.: . :::... :. mKIAA4 TEWGGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDK-VGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQ 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 LRQVLVSHVSHPFALTNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDGHPCSLVPGLVPPAPRATSM :.:... . .::.::. mKIAA4 ERMVIADDLPYPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFH 870 880 890 900 910 920 1168 residues in 1 query sequences 1767849 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:29:26 2006 done: Mon Mar 27 10:29:28 2006 Scan time: 1.090 Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]