FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0984.ptfa, 816 aa vs ./tmplib.26680 library 1768201 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6594+/-0.00548; mu= 14.2106+/- 0.364 mean_var=129.9527+/-30.940, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 153 in 1/35 Lambda= 0.1125 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 180 40 0.00039 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 180 41 0.0007 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 166 38 0.0022 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 160 38 0.0072 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 161 38 0.0077 >>mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 (329 aa) initn: 218 init1: 137 opt: 180 Z-score: 166.7 bits: 40.5 E(): 0.00039 Smith-Waterman score: 274; 26.645% identity (30.224% ungapped) in 304 aa overlap (202-500:4-276) 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 ERSNPDDDSMGIQIVKDLHRTGCSSYCGQEAEQDRVVLKRVLLAYARWNKNVGYCQGFNI ..:: : ::: ::. . . ::::. mFLJ00 PLHSQQD---LFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAP 10 20 30 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 LAALILEVMEGNEGDALKIMIYLIDKVLPESYFVNNLRALSVDMAVFRDLLRLKLPELSQ .::..: : ... :. .. . .: :: .:. ..:.:...: .. .::. : . mFLJ00 IAAVLLMHMPAEQ--AFWCLVQVCEKYLP-GYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHK 40 50 60 70 80 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 HLDTLQRTANKESGGGYEPPLTNVFTMQWFLTLFATCLPNHTVLKIWDSVFFEGSEIILR ::. :. :: .. .::. :: :: .::..:: : :: .::.: mFLJ00 HLSR-QKI----------DPL--LYMTEWFMCAFARTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFR 90 100 110 120 130 360 370 380 390 400 mKIAA0 VSLAIWAK-LG--EQIECCETADEFYGTMGRLTQEMLEQDLLQSHELMQTVYSMAPFPFP :.:.. . :: :... :. : . :. ..... .: .:... . . mFLJ00 VGLVLLKHALGSPEKLKACQGQYETIEQLRSLSPKIMQEAFL-VQEVIELPVTERQIERE 140 150 160 170 180 190 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 QLAELREKYTYNITPFPATIKPTSVSGRHSKARDSDDENGPDDEDAVASAVGCLGPLSGL .: .::. . .. :. :. : : :: . .. : : ..: mFLJ00 HLIQLRRWQETR-----GELECRSLPRMHGAKAILDAEPGPRPALQPSPSIR-LPPDAAL 200 210 220 230 240 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 LAPELQKYQKQIKEATEEQTLRSNNIAEL--SPGAINSCRSEYHAAFNSMMMERMTTDIN :. . . . :.: .:: :... :.: ::: mFLJ00 LSSKAKPH----KQAQKEQK-RTKTSAQLDKSPGLSQATVVTAAGDACPPQGVSPKDPVP 250 260 270 280 290 300 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 ALKRQYSRIKKKQQQQLHQVYIRADKGPVTSILPSQANSSPVINHLLLGKKMKITNRAAK mFLJ00 QDPTPQNLACHHSQESLTSQESEDTYL 310 320 >>mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 (841 aa) initn: 286 init1: 121 opt: 180 Z-score: 162.0 bits: 40.9 E(): 0.0007 Smith-Waterman score: 293; 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