FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4170.ptfa, 1376 aa vs ./tmplib.26680 library 1767641 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9906+/-0.00831; mu= -9.2024+/- 0.549 mean_var=464.3743+/-113.854, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0595 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0992 ( 1081 res) mph02462 (1081) 1888 178 1.1e-44 >>mKIAA0992 ( 1081 res) mph02462 (1081 aa) initn: 2868 init1: 1120 opt: 1888 Z-score: 894.8 bits: 177.6 E(): 1.1e-44 Smith-Waterman score: 3066; 46.964% identity (53.838% ungapped) in 1120 aa overlap (361-1376:1-1081) 340 350 360 370 380 mKIAA4 TQKLRSREVPEGSRVQLDCIVVGIPPPQVRWYCEGKELENSPDIHI-VQAGNLHSLTIAE :.:::::: ::::..: ..:.::.:.::: mKIAA0 WFCEGKELYNSPDVQIHCESGELHTLVIAE 10 20 30 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 AFEEDTGRYSCFASNIYGTDSTSAEIYIEGVSSSDSEGDP-----NKEEMNRIQKPNEVS :::.:::::.:.:.: 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