# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg21326.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4170.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4170, 1376 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7901541 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3591+/-0.000204; mu= 10.4424+/- 0.011 mean_var=132.8609+/-25.250, 0's: 37 Z-trim: 96 B-trim: 245 in 1/64 Lambda= 0.111269 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|109892762|sp|Q5DTJ9.2|MYPN_MOUSE RecName: Full= (1315) 8795 1424.5 0 gi|148700109|gb|EDL32056.1| mCG123411 [Mus musculu (1307) 8713 1411.3 0 gi|30268571|emb|CAD38923.2| hypothetical protein [ (1391) 7986 1294.6 0 gi|73952757|ref|XP_546131.2| PREDICTED: similar to (1322) 7814 1267.0 0 gi|149690280|ref|XP_001503648.1| PREDICTED: simila (1318) 7747 1256.2 0 gi|109892761|sp|Q86TC9.2|MYPN_HUMAN RecName: Full= (1320) 7747 1256.2 0 gi|119574652|gb|EAW54267.1| myopalladin, isoform C 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