FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0666.ptfa, 1087 aa vs ./tmplib.26680 library 1767930 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8493+/-0.0105; mu= -13.2102+/- 0.696 mean_var=570.4195+/-136.192, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0537 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0381 ( 1032 res) mbe05005 (1032) 2056 175 5.6e-44 mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285) 1010 94 1.6e-19 mKIAA4117 ( 1192 res) mfj20353 (1192) 982 92 6.8e-19 mKIAA2014 ( 1045 res) mpm02193 (1045) 848 81 8.3e-16 mFLJ00304 ( 864 res) mng15233 ( 864) 798 77 1.1e-14 mKIAA1727 ( 1159 res) mbh01547 (1159) 648 66 4.1e-11 mKIAA1902 ( 293 res) mph04215 ( 293) 291 37 0.0036 >>mKIAA0381 ( 1032 res) mbe05005 (1032 aa) initn: 3974 init1: 1609 opt: 2056 Z-score: 882.0 bits: 174.9 E(): 5.6e-44 Smith-Waterman score: 4444; 64.345% identity (69.851% ungapped) in 1091 aa 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