FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4034.ptfa, 1554 aa vs ./tmplib.26680 library 1767463 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5363+/-0.00576; mu= 12.8601+/- 0.384 mean_var=162.1231+/-38.350, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1007 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0234 ( 1390 res) mpm08099 (1390) 3391 506 2.4e-143 mKIAA0677 ( 1080 res) mpm07016 (1080) 448 78 1.1e-14 mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129) 434 76 4.7e-14 mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027) 432 76 5.4e-14 mKIAA0314 ( 886 res) mbg04168 ( 886) 219 45 0.0001 mKIAA0783 ( 358 res) mni08250 ( 358) 190 40 0.001 mKIAA1696 ( 675 res) mpm12224 ( 675) 193 41 0.0012 mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945) 199 42 0.0013 >>mKIAA0234 ( 1390 res) mpm08099 (1390 aa) initn: 3710 init1: 2578 opt: 3391 Z-score: 2666.0 bits: 505.9 E(): 2.4e-143 Smith-Waterman score: 3811; 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.::.:::.::: ::..:: : :. :.: : mKIAA0 GYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRRFQPERYKLWK 290 300 310 320 330 340 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 VVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCIKCKTTCFMSAI mKIAA0 AGKDSTVIDHTLPTPEAAEFLKDSGGLTPRAGSEECPEEDVEAADQGEEGDVKRSLAKHR 350 360 370 380 390 400 >>mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129 aa) initn: 493 init1: 433 opt: 434 Z-score: 344.7 bits: 76.1 E(): 4.7e-14 Smith-Waterman score: 460; 23.517% identity (29.223% ungapped) in 927 aa overlap (383-1253:125-926) 360 370 380 390 400 mKIAA4 GSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLVPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECN----KP--QEAFG .: .:. .: . : : : . : mKIAA0 RPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTG 100 110 120 130 140 150 410 420 430 440 450 mKIAA4 ----FEQ---AARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVT : : . .:.. : ..:.. : . : .. : .:...:. .. . mKIAA0 QSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSSK---YCTPRYL-DYEDLERKYWKNLTFVAPI-- 160 170 180 190 200 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 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