FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0634.ptfa, 1485 aa vs ./tmplib.26680 library 1767532 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2622+/-0.00597; mu= 2.8029+/- 0.394 mean_var=245.4708+/-59.749, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0819 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0289 ( 1249 res) mbg08647 (1249) 4386 532 2.2e-151 >>mKIAA0289 ( 1249 res) mbg08647 (1249 aa) initn: 3775 init1: 868 opt: 4386 Z-score: 2810.0 bits: 532.4 E(): 2.2e-151 Smith-Waterman score: 4386; 50.922% identity (52.566% ungapped) in 1247 aa overlap (262-1483:15-1247) 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 AGAGAGTGAGAGAAAAAASAASPGSAGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAVQDDLDNTEL .:.: .::. :::..::...: :::.:::: mKIAA0 PFLRENDLSIMHSPSASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTEL 10 20 30 40 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 PFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQEPSEIVEEQM :.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: . : .::.. mKIAA0 PYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEEL 50 60 70 80 90 100 360 370 380 390 400 mKIAA0 HILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHEIHYIPSVLL .:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:::::::::. mKIAA0 RILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLI 110 120 130 140 150 160 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 GPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDYEEEEEPPRRANHVSRE-----DEFG : ..:::.:..:.: ::: . :::::::: :.:. . .:..:: ..:. mKIAA0 GGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGYEYDITDL----RHHLQRECMNGGEDFA 170 180 190 200 210 220 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 SQMTHALDSLGRPGEEKVEFEKKAAAEATQETVESLMQKFKESFRANTPVEIGQLQPASR ::.:..:::: . .:: .. ... .. :::.:.:... :..::. .. : . mKIAA0 SQVTRTLDSL-QGCNEKSGMDLTPGSDNAKL---SLMNKYKDNIIATSPVDSNHQQATLL 230 240 250 260 270 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 SSTSAGKRKR-RNKSRGGISFGRTKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GLLKSPV : ::...::: ::.:.: .: .: :..::... ::::::. ::::::. : .::: mKIAA0 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library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:24:57 2006 done: Mon Mar 27 10:24:58 2006 Scan time: 1.180 Display time: 0.180 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]