FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0345.ptfa, 962 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768055 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7803+/-0.00428; mu= 19.2319+/- 0.284
 mean_var=118.3536+/-28.946, 0's: 0 Z-trim: 10  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1179

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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mKIAA1400  ( 1098 res)   mbh01141                  (1098) 1302  233 1.3e-61
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Smith-Waterman score: 1907;  41.266% identity (43.008% ungapped) in 790 aa overlap (29-799:23-799)

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       ::. ...:::..:::.  :  :. :..  . :..:::.: :..: ..:::::::    : 
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       .:..:... ::.::..:..: ::::  :::      : : :.  ::. : :..: :.:..
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       ::.:: : :.:.::::: :..  :.:..:::.:.:..:. :.:.::: :    ..:.. :
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         : .: . ....:..: : .. ..:::   :.:..:.:.: :   .. .::.:...:::
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       :::.::.....:. :: ::: :. :.:..::.: ::. ::..  :.  ..:: : :. ::
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       :.: :. ..:.:.: : : :::.:.. ..: :::.::::: .: :  .:..  .::. :.
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       .  :..:::: ::: ::: :::::..: .:.  :   : :  ..::. :::.:.: :.:.
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       . .::::..:..::....: :  : .         ::  ::.  ::   .::: : : : 
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          ::   .. :  . ...  .:  ::  :  .. .:..                     
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       .:: :: :..:::::  ::. :  :..:. :..:. .: ..: : . .::::::::..:.
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        : ......:..  ..: ::.:. ::::: : : :.  .. : :    :.:. :  : : 
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       :: .: :.. :.:::.: :.::.:: :....:     .   ...     : :  :....:
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         ..:    :   . ..  .:. .   .::.   :.:.:. .:::       .  :. : 
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       : :::.: . : :  .: . .:.:    .    .. :   ..::.   ::.. :  .:.:
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       ... . . .:::    :  :    . .: ::: : ..   . :...  :.     :.:..
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       ..:::::: ::. :. .: :       :.:..  .: .:.. :.:.::: ::.. :.:  
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        . ..:. . . . .:  ::..:.:: ::: :: .:  . :  :. .  : .   . .: 
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Smith-Waterman score: 1934;  41.045% identity (43.941% ungapped) in 804 aa overlap (32-790:59-854)

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       ...:.: ::: : ..:::: . .: .    : :.: .: . :.:..:.::.  ... ..:
mKIAA1 QLNATDPDEGQNGEVVYSFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQA
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mKIAA1 KDLGPNAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEISFSTVKEAVSEGAAPGTVVALFSVTDRDSEEN
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       :.:.::::::: :.:: : :.: ::: :::.:..::: : :   :: ..::..: ..   
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        . .:::.....: ..::. .:.:... ..::: ::::: : ::..:.:......:.:::
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mKIAA0 APTEGGP---GKPMLVCSSAVGTWSYSQQRRQRVCSGEGPPKTDLMAFSPSLTPCPVNQD
           .     ..   .:    :. : .   ::     .   :.:.:  . . .:      
mKIAA1 EKKLNIYTCLASDCCLCCCCCGNGSSTCCGRQARARKKKLSKSDIMLVQSANVPSNPAQV
              810       820       830       840       850       860

        800       810       820       830       840       850      
mKIAA0 KEDKLVGDIDFSIKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSS
                                                                   
mKIAA1 PVEESGGFGSHHHNQNYCYQVCLTPESAKTDLMFLKPCSPSRSTDAEHNPCGAIVTGYSD
              870       880       890       900       910       920

>>mKIAA1313  ( 969 res)   mbh01521                        (969 aa)
 initn: 912 init1: 485 opt: 1221  Z-score: 1124.4  bits: 219.5 E(): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1258;  37.500% identity (39.006% ungapped) in 544 aa overlap (198-737:1-527)

       170       180       190       200       210       220       
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                                     ..: . .  .   ::..: :.::   ....
mKIAA1                               EIKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSF
                                             10        20        30

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mKIAA0 LITAVDGGKPELTGTTQVKITVLDVNDNAPAFEKTFYKVRLPENAPNGTVVVDVDASDLD
        :::.::: :   ::. ..: : : ::: :.: .. :.: .:::.: .: :. ..::: :
mKIAA1 RITALDGGDPPHMGTVGLSIKVTDSNDNNPVFGESTYSVSVPENSPPNTPVIRLNASDPD
               40        50        60        70        80        90

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mKIAA0 EGVNKDIVYSFHQDMSLEILSKFHLDPISGYITVKGNIDFEETKSFEIQIEAADKGTPPM
       ::.: ..::::.  .. .    :..:: :: .:: : .:.:: . .:....: : :   .
mKIAA1 EGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSI
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mKIAA0 TDHCTVLVEIVDVNDNVP---ELVIKSLSLPVLENSAPSTVIALISVSDRDSGANGQVTC
         :: : : ..:.::: :    : ..:  . : :.. :. ::::. ::::::: ::.: :
mKIAA1 PAHCKVTVSVLDTNDNPPIINLLSVNSELVEVSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQC
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mKIAA0 SLTPQVPFKLVSTFKNYYSLVLDSVLDRETISNYNVVVTARDGGSPPLCTTASVSVEVAD
        :  .:::.: . .... ....:. ::::  ..::... :::.: : : .. : .:...:
mKIAA1 RLLGNVPFRL-QEYESFSTILVDGRLDREQHDQYNLTIQARDSGVPMLQSAKSFTVRITD
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mKIAA0 VNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGAHIFTVSAMDADAQENALVSYSLVERRVGERLLSSY
        ::: : :..: : :.:.::: :::....::: : :   :. :::..:  .: .  . .:
mKIAA1 ENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDPDMGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTY
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mKIAA0 VSVHAESGKVFALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPALGSNVTLQVFVLDENDNAPTLLG
       ::.. .:: ..::. ..::. . ..:.: :.:.:.:.: ::.:..:..:: :::.:.. .
mKIAA1 VSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGLPSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITA
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mKIAA0 PHAGSAVSEL-VSRTVGAGHVVTKVRAVDADSGYNAWLSYELQSAAGSGRLPFRVGLYTG
       :   ....:. . :. : :..:: :.: : : : :. ..:..  .    :  :..   .:
mKIAA1 PPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKADDYDEGENGRVTYDMTEG---DRGFFEIDQVNG
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mKIAA0 EISTTRVLDETDAPRQRLLVLVKDHGEPVLTATATLLVSLVESGHTPNTPSRTLVDSAGR
       :. :::...:.. :  .:.:...:::.  :.:.: .:. :        .:.    .: : 
mKIAA1 EVRTTRTFNENSKPSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLIYL--------SPALDAQESMGS
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mKIAA0 EASLVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYLALRCSTAPTEGGPGKPMLVCSSAVGTWSYS
           :.... .:::. .....: .:.. ..:..:.                         
mKIAA1 ----VNLSLIFIIALGSIAGILFVTMI-FVAIKCKRDNKEIRTYNCSNCLTITCLLGCFI
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mKIAA0 QQRRQRVCSGEGPPKTDLMAFSPSLTPCPVNQDKEDKLVGDIDFSIKPRQPNPDWRYSAS
                                                                   
mKIAA1 KGQNSKCLHCISVSPNSEEQDKKAEEKVSLRGKRIAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLV
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>>mKIAA0811  ( 1654 res)   mbg07446                       (1654 aa)
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Smith-Waterman score: 699;  31.306% identity (34.047% ungapped) in 559 aa overlap (161-699:6-539)

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mKIAA0 LQVFHVEVEVRDINDNPPVFPVATKNLFIYESRPLGSRF-SLEGASDADIGTNSLLSYSL
                                     :. : ::.. :.....  :    ::.. . 
mKIAA0                          TFSASEDLPEGSEIGSVKAVAAQDPIIYSLVQGTT
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        190       200       210       220        230       240     
mKIAA0 ---NSSEYFSLDVKRKDEEIKSLGLVLKKLLNREDIPEHNL-LITAVDGGKPELTGTTQV
          ::.. ::::   .:  .    : .:: ...:.   ... :..       .:.. ..:
mKIAA0 PESNSDDVFSLD---QDTGV----LKVKKAMDHESTKWYQIDLMAHCPHEDTDLVSLVSV
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mKIAA0 KITVLDVNDNAPAFEKTFYKVRLPENAPNGTVVVDVDASDLDEGVNKDIVYSFHQDMSLE
       .: : ::::: :.::   ::. : :: :.::.:..: :.: : : . .. : .  . . .
mKIAA0 NIQVEDVNDNRPVFEADPYKAFLTENMPGGTTVIQVTANDQDTGSDGQVSYRLSVEPGSN
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mKIAA0 ILSKFHLDPISGYITVKGNIDFEETKSFEIQIEAADKG-TPPMTDHCTVLVEIVDVNDNV
       : . : .:  ::.::.  ..: :  ..... . : :.: :  ....  : : :.: ::: 
mKIAA0 IHQLFAVDSESGWITTLQELDCETQQTYRFYVVAFDHGQTIQLSSQALVEVSITDENDNP
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mKIAA0 PELVIKSLSLPVLENSAPSTVIALISVSDRD-SGANGQVTCSLTPQVPFKL--VSTFKNY
       :... ..    :.::. :. ..: ... : : :  : :::: .:   :.    .:   . 
mKIAA0 PRFASEDYRGSVVENNEPGELVATLKTLDADISEQNRQVTCYITEGDPLGQFSISQVGDE
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mKIAA0 YSLVLDSVLDRETISNYNVVVTARDGGSPPLCTTASVSVEVADVNDNAPAFAQPEYTVFV
       . ..  ..:::: :..: . .:: ::    . ... : : : :.:::.:  .:  ::  :
mKIAA0 WRITSRKTLDREHIAKYLLRITASDG---KFQASVPVEVFVLDINDNSPQCSQLLYTGKV
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mKIAA0 KENNPPGAHIFTVSAMDADAQENALVSYSLVERRVGERLLSSYVSVHAESGKVFALQPLD
       .:.  ::  :. :::.:.: . :: ..:::    . :  :. .      .:.. .:. ::
mKIAA0 REDVTPGHFILKVSAIDVDMDTNAQITYSLHGPGAQEFKLDPH------TGELTTLSVLD
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mKIAA0 HEELELLQFQVSARDAGVPALGSNVTLQVFVLDENDNAPTLLGPHAGSAVSELVSRTVGA
       .:. .. .. ..: :.:  .  ..:::..   : ::::: ..  : . :: .  . :: .
mKIAA0 RERKDVYNLVAKATDGGGQSCQAEVTLHIE--DVNDNAPRFFPSHCAVAVFD--NTTVKT
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mKIAA0 GHVVTKVRAVDADSGYNAWLSYELQSAAGSGRLPFRVGLYTGEISTTRVLDETDAPRQRL
          :. : : : :.: :: . : : ..: .:.  : .   .: :   . :.  ..   .:
mKIAA0 P--VAVVFARDPDQGVNAQVVYSLTDSA-DGQ--FSIDATSGVIRLEKPLQVRSSSAVEL
           440       450       460          470       480       490

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mKIAA0 LVLVKDHGEPV-LTATATLLVSLV----------ESGHTPNTPSRTLVDSAGREASLVDI
        : ..: : :. :.. .:. ::.:          .: :. ..:  .:.:           
mKIAA0 TVRASDLGTPIPLSTLGTVTVSIVGLEDYLPIFLNSEHSTQVPEDALIDMEVLYLATLTR
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mKIAA0 NVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYLALRCSTAPTEGGPGKPMLVCSSAVGTWSYSQQRRQRV
                                                                   
mKIAA0 PGSEKTGYHITGGNEQGKFRLDAHTGILYVNGSLDFETNPKYFLSIECSRKSSSSLSDVT
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>>mKIAA1775  ( 918 res)   mbg01642                        (918 aa)
 initn: 219 init1: 151 opt: 264  Z-score: 245.0  bits: 56.7 E(): 1.7e-08
Smith-Waterman score: 498;  24.909% identity (28.375% ungapped) in 827 aa overlap (50-816:103-888)

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mKIAA0 AMVFSQREDRHLLLWLLLFAAWEAGSGQLHYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPR
                                     .:.::..  :. :  .    : .  :  : 
mKIAA1 GLLRIYLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLN---GTD-PEGDPI
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      80         90       100       110       120       130        
mKIAA0 LFRVA-SKDRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVEV
        .... . .  ... :. . : . .  ..:::    :  :    . .     : . .: .
mKIAA1 SYHISFDPSTRSVFSVDPNFGNITLVEELDRE----REDEIEAIISISDGLNLVAEKVVI
      130       140       150       160           170       180    

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mKIAA0 EVRDINDNPPVFPVATKNLFIYESRPLGSRFSLEGASDADIGTNSLLSYSLNS--SEYFS
        : : ::. : :      . . :. : :: .    : : : :... ..:::..  :  ::
mKIAA1 LVTDANDEAPRFIQEPYIIRVPENIPAGSSIFKVQAEDKDTGSGGSVTYSLQNLHSSKFS
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mKIAA0 LDVKRKDEEIKSLGLVLKKLLNREDIPEHNLLITAVDGG------KPELTGTTQVKITVL
       .:  :..  ..   :     :. :    : . . : :::         ...:: : :.: 
mKIAA1 MD--RHSGVLR---LQAGATLDYEKSRAHYITVIAKDGGGRLRGADMVFSATTTVTINVE
            250          260       270       280       290         

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mKIAA0 DVNDNAPAFEKTFYKVRLPENAPNGTVVVDVDASDLDEGVNKDIVYSFHQDMSLEILSKF
       ::.:.:: :  : :   . :..  :. :. : : : :.:  . :.: . .. .    . :
mKIAA1 DVQDTAPIFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLTVVAIDGDRGKPNHILYRLLNESD----GIF
     300       310       320       330       340       350         

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mKIAA0 HLDPISGYITVKGNIDFEETKSFEIQI---EAADKGTPPMTDHCTVLVEIVDVNDNVPEL
       ...  :: :.:  .  . . . .:...   :. . :.:       : ..:::.:.. : .
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]