FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4122.ptfa, 790 aa vs ./tmplib.26680 library 1768227 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4354+/-0.00449; mu= 11.9571+/- 0.299 mean_var=99.8550+/-23.580, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1283 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 ( 748) 1582 304 3.8e-83 mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 ( 792) 608 124 7.6e-29 mKIAA0695 ( 738 res) mbg01635 ( 738) 347 75 2.6e-14 mKIAA1406 ( 838 res) mph00927 ( 838) 196 47 7.3e-06 mKIAA0076 ( 1508 res) mfj09377 (1508) 167 42 0.00046 >>mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 (748 aa) initn: 1520 init1: 676 opt: 1582 Z-score: 1585.2 bits: 304.1 E(): 3.8e-83 Smith-Waterman score: 1698; 36.200% identity (39.112% ungapped) in 779 aa overlap (29-790:11-748) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 TRITVLDNFRTLLTMSSNRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELY . .:. :. : . :. : . . .. . . . mKIAA4 TCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRF 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 THVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKD . .: :.. . : .: .:: . : ::.... .: : mKIAA4 SDIYALCVAYPE---------P---------------LGERLYAETKIFLESHVRHLYKR 50 60 70 130 140 150 160 170 mKIAA4 GEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI---- . .:.:: .: . ::.: .. .. . ::: ..... : : : :. mKIAA4 VLE-SEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQYIKKNKLTEADIQYGYGGVDMNE 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 mKIAA4 --YEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLN .:: ::: :: . .::.. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:.. mKIAA4 PLMEIGELALDMWRKLMVEPLQNILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV--- 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 EDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRR . . : : :. : : ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:. : mKIAA4 --EQYKKKFPLKFYQGIFVSPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIR 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 VQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLG . ::: :. .. ..:.: .. ::...:.: ..... ....:.. :: :. ...:: mKIAA4 CRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHSECHSIIQQERKNDMANMYVLLRAVSSGLP 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 ELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAA .. . :. :::..:: : . . . : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..: mKIAA4 HMIEELQKHIHDEGLRATSNLTQEHM--PTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSA 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 LDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFK :::: .: . .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..::: mKIAA4 LDKALTSVVNY----REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDKLTSFITVFK 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 YIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVS ::.::::::::::.::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:: mKIAA4 YIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVS 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 KDLNEQFKKHLTNSEP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTAF :::..:.. . :.. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : : : mKIAA4 ADLNNKFNNFIRNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELF 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 640 mKIAA4 YASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDST :... ::::::::. : ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::: mKIAA4 YSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDST 550 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 mKIAA4 QIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKSDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMK :.. :..... :: :.. ..:. ..: ... ..: .....:. . .:.. :. mKIAA4 QMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDID-----AESSFSLNMSFSSKRTKFKITTSMQ 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 mKIAA4 TEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVI . :: : :.. ..::::. .::::::::: ::::.:. :. ::..: .::.: . .: mKIAA4 KDTPQELEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMI 670 680 690 700 710 720 770 780 790 mKIAA4 KKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA ::::..::.:.:.:: .. : :::.: mKIAA4 KKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA 730 740 >>mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 (792 aa) initn: 1165 init1: 355 opt: 608 Z-score: 610.2 bits: 123.7 E(): 7.6e-29 Smith-Waterman score: 1228; 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