FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0322.ptfa, 1177 aa vs ./tmplib.26680 library 1767840 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9506+/-0.00593; mu= 9.3606+/- 0.396 mean_var=175.2929+/-40.949, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0969 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1301 ( 1455 res) mbg18866 (1455) 3782 542 3.2e-154 mKIAA0093 ( 904 res) mbg10506 ( 904) 1339 200 1.4e-51 mKIAA4011 ( 876 res) mpm01139 ( 876) 1245 187 1.2e-47 mKIAA0312 ( 2934 res) mbf01960 (2934) 1021 156 7.2e-38 mKIAA1625 ( 222 res) mbh04778 ( 222) 744 116 5.7e-27 mKIAA4216 ( 906 res) mfj70377 ( 906) 634 102 6.3e-22 mKIAA0032 ( 938 res) mbg05393 ( 938) 612 98 5.4e-21 mKIAA1593 ( 1058 res) mpm02342 (1058) 608 98 8.6e-21 mKIAA0010 ( 1086 res) mbg01752 (1086) 562 92 7.6e-19 mKIAA0317 ( 826 res) mbg01653 ( 826) 505 83 1.6e-16 mKIAA1320 ( 150 res) mef00242 ( 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mKIAA0 ERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLD ....::.:.::::::::: .: ::: : :::: ..::::: :: . :::.:::::::: mKIAA4 KEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLD 790 800 810 820 830 840 1160 1170 mKIAA0 LPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE :::: :: .: :::: :.::: :: : mKIAA4 LPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE 850 860 870 >>mKIAA0312 ( 2934 res) mbf01960 (2934 aa) initn: 1046 init1: 461 opt: 1021 Z-score: 772.2 bits: 156.2 E(): 7.2e-38 Smith-Waterman score: 1021; 42.298% identity (42.857% ungapped) in 383 aa overlap (797-1176:2553-2933) 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 FSPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIR ::..: . : ..:: : . . .: mKIAA0 RTVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVR 2530 2540 2550 2560 2570 2580 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 RDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYITFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLF :::..: .. .. : .:. .:.:::.: :::: : .: ::.....:.:.:::.:.:: mKIAA0 RDHVFEDSYRELHRKSPEEM-KNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALF 2590 2600 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..:.. :: . mKIAA1 QHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQK 100 110 120 130 140 150 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA0 ELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTS ::::.:.: .::::::..::. . :.. ..:::: ::: :..:.: ::::::::.. mKIAA1 ELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHCVADSN-IVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGST 160 170 180 190 200 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA0 SVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVE :: .:: ::.:. mKIAA1 RVPLQGFKALQGD 210 220 >>mKIAA4216 ( 906 res) mfj70377 (906 aa) initn: 629 init1: 184 opt: 634 Z-score: 486.0 bits: 101.5 E(): 6.3e-22 Smith-Waterman score: 634; 30.364% identity (32.680% ungapped) in 494 aa overlap (697-1176:433-905) 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 HSLIAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEM-LQERQPSLARNHTLREKIHYIRT :. :. ::: . ::. .. ..: mKIAA4 SKCLKMVYYANVVGGDVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGDERRNKK-GPRVDPLET 410 420 430 440 450 460 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 EGNHGLDKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQSAFH--PGYSFSPRCSPCS-SPQNSPG : :. :.: :. ::: : ::..... :.: . . : .. : mKIAA4 E--LGVKTLDCRKPLIS----FEEFINE--PLNDVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPF 470 480 490 500 510 790 800 810 820 830 mKIAA0 LQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPG---KIKLIIRRDHLLEGTFN--Q . : .. . : : . .. . : .. :: ..: .::::... .. . mKIAA4 ILNAVTKNLGLYY-DNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLE 520 530 540 550 560 570 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 VMAYSRKELQRNKLYITFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQ ..:. ...::. : ::.:.: .: :.::: :. .:.::: :.: :. : mKIAA4 MIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDEA-TKLFW 580 590 600 610 620 630 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 ISPMSAFVENYLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKGLLKLPCDLSDLEYLDEE ..: : .:. : . : .::::. .. .::. : :. :. . :: mKIAA4 FNPSSFETEGQ---FTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPV 640 650 660 670 680 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 FHQSLQWM--KDNNITDILDLTFTVNE-EVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERM ..:::. . .... : . .:: ... ..::. .:: .: . .:..:.::... . mKIAA4 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.:.. . .: . :. :: .: .... .:. ::. ...:... : .. mKIAA0 NRQEFVDAYVNYIFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPAELRAMMVGNSNYDWEE 780 790 800 810 820 830 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 WRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGL .... ::: : . : ... :: . ..: :.. ..: :.::.. .: :.:.:. mKIAA0 LEETAVYRGDYSSTHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQ----- 840 850 860 870 880 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA0 RRFCIEKWGKITS-LPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE . :.. . :: ::::.: :::: : : .. .: :... :.: mKIAA0 --IIIQSTATGEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEIMKARLTQALDNYEGFSLA 890 900 910 920 930 >>mKIAA1593 ( 1058 res) mpm02342 (1058 aa) initn: 614 init1: 280 opt: 608 Z-score: 465.6 bits: 98.0 E(): 8.6e-21 Smith-Waterman score: 608; 31.285% identity (32.749% ungapped) in 358 aa overlap (823-1176:712-1057) 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 PYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLY :..::.... : .:. ... .. : mKIAA1 QMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIESVNPCLILVVRRENIV-GDAMEVLRKTKNIDYKKPLK 690 700 710 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