FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1436.ptfa, 812 aa vs ./tmplib.26680 library 1768205 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4232+/-0.00406; mu= 18.6769+/- 0.273 mean_var=76.2491+/-17.229, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1469 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0466 ( 1214 res) mpm03293 (1214) 634 144 6.9e-35 mFLJ00271 ( 494 res) mib18067 ( 494) 495 115 2.8e-26 >>mKIAA0466 ( 1214 res) mpm03293 (1214 aa) initn: 568 init1: 182 opt: 634 Z-score: 718.7 bits: 144.5 E(): 6.9e-35 Smith-Waterman score: 822; 25.864% identity (28.173% ungapped) in 781 aa overlap (1-755:89-831) 10 20 30 mKIAA1 VELASTWEVGFPAQLYRERLQRGDILLRRT :...:: . .:: .: .:.. : : ..: mKIAA0 TIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIYLPSAPEREVQIVSTVDSSFPYAIYTQRVRGGKIYVERI 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 ANDAVELHIKNVQPSDQGHYKCSTPSTDATVQGNYEDTVQVKVLADALVVGPSSRPPPGL .... ::: ..: : :.:.: ::.:: :.: ... :. :.: .. : : mKIAA0 QGNSALLHITDLQARDAGEYECHTPNTDERYFGSYSAKMNLVVIPDSL---QTTAVPQTL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 mKIAA1 SLREGEPFELRCIASTTSPLHTHLALRWELHRG---PVHRSILALSHEGRFHPGPGYEQR : .:.:: : ..: . ::::.. : ..: ::. ...::.. .: . : :: mKIAA0 HKVEQDPLELSCEVATETVQHTHLSVSWLRQKGGENPVE--VISLSRDFILHSSSEYAQR 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 YHSGDVRLDTVGSDAYRLSVARALSADQGSYRCVVSEWITE-QGSWQEIQEKAVEVATVV :.:::: .: ...::.. . .::: . : ..::: . .::: . .: : :.: mKIAA0 QSLGEVRLDKLGRSTFRLTIFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVN 240 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 IQPT----ALQLAVPRTVSVTEGKDLDLSCNITTDRVDDVRPEVTWYFKKTPDTSLLAS- .::: ...: . . . : :. ... : . .. . : :.: : ..::.:. mKIAA0 VQPTDKEFTVRLETDKRLH-TVGEPVEFRCILEAQNIPDRYFAVSWAF----NSSLIATM 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 mKIAA1 --HMLARLDRDSLVH--SSPHVALSHVDTRSYHLLVRDVSKENSGYYLCLVALWAPGHNR . . :. : ..: .. .. ... . . : . . .:.:: : : :. .. mKIAA0 GPNAVPVLNSD-FAHREAKGQLKVAKESDGVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTERE--KTV 350 360 370 380 390 400 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 SWHKVAEAMSAPSGVSVTWLEPE----YQVYLNASKVPGFSDDPTELQCRVIDTKRLEAG . . . . . :... .. : . .: ::: : . . ...: : . ::.: mKIAA0 TGEFIDKESKRPKNIPIVVLPLKSSISVEVASNASVV--LEGEDLHFSCTVRTVGRLQA- 410 420 430 440 450 460 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 VRLTVSWYY--RMTRRNDDVVASELLAVMDGDWTLRYGERSKQRAQDGEFIFSKEHTDTF :..: : :..::.. . .: : ::. : .:.. : . . . . ..: mKIAA0 -RFSVIWQLVDRQNRRSN-------VMWLDRDGTLQPGSAYWERSSYGGIQMEQVQPNSF 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 NFRIQRTTEEDRGNYYCVVSAWTRQRNNSW-VKSKDVFSKPVNIFWASEDSVLVVKARQP .. : . .::.:.: : :. :.: .. : . .. : :.: .. .. ..: : . mKIAA0 SLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTLVSI--TALETGFAVTAISR 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 mKIAA1 KPFFAAGNTFEMTCKVSSKNIKSPRYSVLITAE-KPVGDLSSPNETKYIISLDQDSVVKL : . ...:.. : . : : : .: . .::: . : . .... .:. :. mKIAA0 TPGVTYSDSFDLQCII--KPHYPARVPVSVTWRFQPVGTV----EFHDLVTFTRDGGVQW 580 590 600 610 620 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 ENWTDASRVDGVVLEKVQEDEFRYRMYQTQVSDAGLYRCMVTAWSPIGGSLWREAATSLS . ... :. .. . . .. : . ... ..:: :.:.. : .. : . : : mKIAA0 GDKSSTFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRRNYNNTWTRLAERTS 630 640 650 660 670 680 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 NPIEIDFQTSGPTFNASVHSDTPSVTRGDLIKLFCIVTVEGAVLDPDDMAFDVSWFAVHS : .:: ...: . : ..... :.: : : . . :.. : : :. ::. mKIAA0 NLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENRAIQLNCSVKSQTS---PNSH-FAVLWY-VHK 690 700 710 720 730 740 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 FGLDKAPVLL----SSLDRKGVVTTGQRDWKSTVSLER-VSVLEFLLQVHGSEDQDFGNY . . ..: :: . :. . .. .. ...:: :: : : :. .: .: :.: mKIAA0 PSDADGKLILKTTHSSAFEYGTYAE-EEGLRGRLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSY 750 760 770 780 790 800 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 YCSVTPWVRSPTGSWQREAEIHSRPIFITVKMDVLNAFKYPLLIGVGLSTVIGLLSCLIG :: : :. ::. .: . :: : .:::. mKIAA0 YCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLKLSQVQGSLSVLETRQIQLECVV 810 820 830 840 850 860 790 800 810 mKIAA1 YCSSHWCCKKEVRETRRERRRLMSMEMD mKIAA0 LNRTSVASQLLVEWFVWKPNHPEREVVAHLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHAESPSSGV 870 880 890 900 910 920 >>mFLJ00271 ( 494 res) mib18067 (494 aa) initn: 634 init1: 292 opt: 495 Z-score: 564.1 bits: 114.6 E(): 2.8e-26 Smith-Waterman score: 606; 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