# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg18715e.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1079.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1079, 1062 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917503 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2305+/-0.000193; mu= 9.8497+/- 0.011 mean_var=102.6550+/-19.884, 0's: 26 Z-trim: 36 B-trim: 162 in 1/65 Lambda= 0.126586 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|149850242|dbj|BAF64833.1| apoptosis-associated (1471) 7072 1302.8 0 gi|118573331|sp|Q3TYD6.2|LMTK2_MOUSE RecName: Full (1471) 7065 1301.6 0 gi|148687077|gb|EDL19024.1| mCG122819 [Mus musculu (1468) 7048 1298.4 0 gi|126031764|gb|AAI31505.1| LMTK2 protein [Homo sa ( 888) 3183 592.4 3.4e-166 gi|145559492|sp|Q8IWU2.2|LMTK2_HUMAN RecName: Full (1503) 3183 592.6 5.1e-166 gi|27356940|gb|AAN08717.1| KPI-2 protein [Homo sap (1503) 3183 592.6 5.1e-166 gi|114614765|ref|XP_527828.2| PREDICTED: lemur tyr (1474) 3164 589.1 5.6e-165 gi|114614763|ref|XP_001134909.1| PREDICTED: lemur (1503) 3164 589.1 5.7e-165 gi|13365853|dbj|BAB39312.1| hypothetical protein [ ( 746) 3153 586.9 1.3e-164 gi|119597125|gb|EAW76719.1| lemur tyrosine kinase (1866) 3131 583.2 4.4e-163 gi|168273150|dbj|BAG10414.1| serine/threonine-prot (1454) 2806 523.8 2.6e-145 gi|119597126|gb|EAW76720.1| lemur tyrosine kinase (1454) 2805 523.6 3e-145 gi|149034919|gb|EDL89639.1| similar to lemur tyros (1531) 2193 411.8 1.4e-111 gi|73958123|ref|XP_851196.1| PREDICTED: similar to (1606) 1727 326.7 6e-86 gi|37590109|gb|AAH58653.1| Lmtk2 protein [Mus musc ( 219) 1499 284.5 4.2e-74 gi|118097709|ref|XP_001232429.1| PREDICTED: simila (1461) 1509 286.9 5.3e-74 gi|74177517|dbj|BAE34627.1| unnamed protein produc ( 632) 1484 282.1 6.5e-73 gi|26333431|dbj|BAC30433.1| unnamed protein produc ( 209) 1432 272.2 2e-70 gi|224070476|ref|XP_002191869.1| PREDICTED: simila (1549) 1348 257.5 4e-65 gi|149408990|ref|XP_001512369.1| PREDICTED: simila (1956) 935 182.2 2.4e-42 gi|47215009|emb|CAG03149.1| unnamed protein produc (1434) 892 174.2 4.4e-40 gi|125813436|ref|XP_693087.2| PREDICTED: hypotheti (1445) 816 160.3 6.6e-36 gi|126308910|ref|XP_001380053.1| PREDICTED: simila (1603) 580 117.3 6.8e-23 gi|47217662|emb|CAG03059.1| unnamed protein produc (1531) 574 116.1 1.4e-22 gi|118099828|ref|XP_420079.2| PREDICTED: similar t ( 880) 508 103.9 3.8e-19 gi|28703754|gb|AAH47378.1| AATK protein [Homo sapi ( 589) 459 94.9 1.4e-16 gi|149054993|gb|EDM06810.1| rCG32884, isoform CRA_ (1313) 458 94.9 3e-16 gi|109489490|ref|XP_001075880.1| PREDICTED: simila (1370) 458 94.9 3.1e-16 gi|114149222|sp|Q6ZMQ8.2|LMTK1_HUMAN RecName: Full (1374) 456 94.6 3.9e-16 gi|74181026|dbj|BAE27789.1| unnamed protein produc (1203) 454 94.2 4.6e-16 gi|26331622|dbj|BAC29541.1| unnamed protein produc (1317) 447 92.9 1.2e-15 gi|109119005|ref|XP_001111343.1| PREDICTED: simila (1394) 446 92.7 1.4e-15 gi|2459993|gb|AAB71837.1| apoptosis associated tyr (1317) 443 92.2 2e-15 gi|74196298|dbj|BAE33045.1| unnamed protein produc (1317) 443 92.2 2e-15 gi|51593714|gb|AAH80846.1| Apoptosis-associated ty (1317) 443 92.2 2e-15 gi|81912939|sp|Q80YE4.1|LMTK1_MOUSE RecName: Full= (1365) 443 92.2 2e-15 gi|123856882|emb|CAM22923.1| apoptosis-associated (1374) 443 92.2 2e-15 gi|29824958|gb|AAO92351.1| brain apoptosis-associa (1374) 443 92.2 2e-15 gi|194676298|ref|XP_588863.4| PREDICTED: similar t (1485) 436 90.9 5.3e-15 gi|189526196|ref|XP_001920174.1| PREDICTED: simila (1644) 430 89.9 1.2e-14 gi|189526191|ref|XP_683424.3| PREDICTED: similar t (1648) 430 89.9 1.2e-14 gi|189516813|ref|XP_001344052.2| PREDICTED: simila (1255) 423 88.5 2.4e-14 gi|194674819|ref|XP_001789580.1| PREDICTED: simila (1423) 418 87.6 5e-14 gi|62871645|gb|AAH94377.1| Lmtk3 protein [Mus musc (1424) 408 85.8 1.8e-13 gi|81910384|sp|Q5XJV6.1|LMTK3_MOUSE RecName: Full= (1424) 408 85.8 1.8e-13 gi|149850244|dbj|BAF64834.1| apoptosis-associated (1424) 398 84.0 6.3e-13 gi|71051920|gb|AAH36690.1| LMTK3 protein [Homo sap ( 687) 344 73.9 3.3e-10 gi|119572738|gb|EAW52353.1| hCG1811754 [Homo sapie (1458) 345 74.3 5.2e-10 gi|117949603|sp|Q96Q04.2|LMTK3_HUMAN RecName: Full (1460) 344 74.1 5.9e-10 gi|122937267|ref|NP_001073903.1| lemur tyrosine ki (1489) 344 74.1 6e-10 >>gi|149850242|dbj|BAF64833.1| apoptosis-associated tyro (1471 aa) initn: 7072 init1: 7072 opt: 7072 Z-score: 6975.4 bits: 1302.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 7072; 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