FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1062.ptfa, 1416 aa vs ./tmplib.26680 library 1767601 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2615+/-0.00568; mu= 7.4911+/- 0.375 mean_var=164.9985+/-41.252, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 136 in 1/35 Lambda= 0.0998 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1888 ( 609 res) mbg15934 ( 609) 731 118 5.4e-27 mKIAA0822 ( 1574 res) mic38093 (1574) 649 107 3.9e-23 mKIAA1520 ( 782 res) mbh00594 ( 782) 191 40 0.0017 >>mKIAA1888 ( 609 res) mbg15934 (609 aa) initn: 761 init1: 269 opt: 731 Z-score: 577.0 bits: 118.1 E(): 5.4e-27 Smith-Waterman score: 828; 29.773% identity (33.094% ungapped) in 618 aa overlap (788-1365:2-597) 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 NKTSASLSLDYLLQGTDVVIAIFIIVAMSFVPASFVVFLVAEKSTKAKHLQFVSGCNPVI .: :.. . ... :: .:: : mKIAA1 AMPPYFAMENAENHKIKAYTQLKLSGLLPSA 10 20 30 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 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