# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg16847.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0743.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0743, 1211 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917319 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3034+/-0.000184; mu= 13.9052+/- 0.010 mean_var=78.5941+/-15.312, 0's: 40 Z-trim: 65 B-trim: 9 in 1/65 Lambda= 0.144670 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|118087591|ref|XP_419373.2| PREDICTED: similar t (1466) 5867 1235.2 0 gi|73969592|ref|XP_531818.2| PREDICTED: similar to (1477) 5866 1234.9 0 gi|224047382|ref|XP_002198759.1| PREDICTED: neurex (1466) 5864 1234.5 0 gi|194220735|ref|XP_001917758.1| PREDICTED: neurex (1477) 5864 1234.5 0 gi|17369704|sp|Q9ULB1.1|NRX1A_HUMAN RecName: Full= (1477) 5855 1232.6 0 gi|126303879|ref|XP_001375416.1| PREDICTED: simila (1476) 5853 1232.2 0 gi|119620587|gb|EAX00182.1| neurexin 1, isoform CR (1500) 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