FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1998.ptfa, 1366 aa vs ./tmplib.26680 library 1767651 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8032+/-0.00584; mu= 16.7157+/- 0.390 mean_var=166.3363+/-38.928, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0994 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0651 ( 985 res) mbg06227 ( 985) 1592 241 6e-64 mKIAA0521 ( 740 res) mbg02422 ( 740) 1058 165 5.9e-41 mFLJ00369 ( 939 res) msh02173 ( 939) 527 89 5.8e-18 mKIAA0382 ( 1553 res) mbg03948 (1553) 496 84 1.7e-16 mKIAA2016 ( 1731 res) mbg07142 (1731) 247 49 1e-05 mKIAA0380 ( 653 res) mfj03079 ( 653) 212 43 0.00019 mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059) 199 42 0.00091 >>mKIAA0651 ( 985 res) mbg06227 (985 aa) initn: 906 init1: 403 opt: 1592 Z-score: 1240.4 bits: 241.5 E(): 6e-64 Smith-Waterman score: 1592; 39.607% identity (41.168% ungapped) in 712 aa overlap (662-1363:10-704) 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 EPPGEKRIQEEEWDEYVIPAKSESEKYKVSRTFSFLMNRMTSPRNKSKMKNKDTKEKEKM :.: .... :.: ::: ..:. . mKIAA0 AGLPVVRRDRVFWAARKKVAPTREKEKMK--EAKDARYT 10 20 30 700 710 720 730 740 mKIAA1 NRHQFVPGTFSGVLQCSGCDKTLLGKESLQCANCKANTHKGCKDAVPPCT--KKFQEKYN : : :. . ::. .: .:.:.. .::.: : .:... :. :::.. :: :. :.: mKIAA0 NGHLFTTISVSGMTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAA 40 50 60 70 80 90 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 KNKPQSILGSSSVRDVPA----PGLSLHPSSSMPIGLPAGRKEFAAQVHPLSRSVPGTTL . .. : : :.:. . : ...::.:. .: ..:. ... :..:: :.. mKIAA0 LLRNNTALQSVSLRSKTTTRERPTSAIYPSDSFRQSLLGSRRGLSSL--SLAKSVSTTNI 100 110 120 130 140 150 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 ESFRRAVTSLESEGDSWRSRSHSDELFQSMGSSPSTESFMME--DVVDSSLWIDLSSDAQ . . :: . :.: . .. . . :.::.. : .: . : :. : . mKIAA0 AGH----FNDESPLGLRQILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEGVEVFYNELMSDFEMDEK 160 170 180 190 200 210 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 EFEAESWSLVVDPSFCSRQEKDVIKRQDVIFELMQTEVHHIQTLLIMSEVFRKGMKEELQ .:::.::::.:: :: ....:.:.:.::::.::.:::.::..:: ::...:: :: :::: mKIAA0 DFEADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKKQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELQ 220 230 240 250 260 270 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 LDHSTVDKIFPCLDELLETHRHFFFSMKERRQES-CAGSDRNFVINQIGDILVQQFSEEN .. .:. .:::.::: . : .:. .. :::... : :: :::::...::.:..::: : mKIAA0 MEPEVVQGLFPCVDELSDIHTRFLNQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGSN 280 290 300 310 320 330 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 ASKMKRIYGEFCSHHKEAMSLFKELQ-QNKKFQNFIKIRNSNLLARRRGIPECILLVTQR : .:.. :.::::.: .:..:.::: ..:.::.::. . . . .:.:. ::::::::: mKIAA0 AEQMRKTYSEFCSRHTKALKLYKELYARDKRFQQFIRKMTRSAVLKRHGVQECILLVTQR 340 350 360 370 380 390 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA1 ITKYPVLVERILQYTKERTEEHRDLCKALGLIKDMIAAVDLKVSEYEKNQKWLEILNKIE :::::::..:::: .. ::..:: .::::.:.... :: : : ::. . :: :... mKIAA0 ITKYPVLINRILQNSHGVEEEYQDLASALGLVKELLSNVDQDVHELEKEARLQEIYNRMD 400 410 420 430 440 450 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA1 NKTYTKLKNGHVFRKQALLSQERALLHDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQ .. : . . : .. :: .: :.:.: . ::::::::::.: ::.::::.::::::: mKIAA0 PRAQTPVPGKGPFGRDELL--RRKLIHEGCLLWKTATGRFKDVLLLLMTDVLVFLQEKDQ 460 470 480 490 500 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA1 KYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRR ::::...: ::::.:::.::.:..::. .:::::: :. :::::.:. :...:..:.: mKIAA0 KYIFTSLD-KPSVVSLQNLIVRDIANQAKGMFLIS--SGPPEMYEVHAASRDDRTTWIRV 510 520 530 540 550 560 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA1 IQQAVESCPEEEGGRTSESDEERRKAEARVAKIQQCQEILSNQDQQICTYLEEKLHIYAE :::.:. :: .: :.... . .. :.:: .. : . :. . : .:. : mKIAA0 IQQSVRLCPSREDFPLIETEDKAYLRRIKT-KLQQKNQALVELLQKNVELFAEMVHFQAL 570 580 590 600 610 620 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA1 LGELSGFEDVHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALREAESLQVAVKASKMGDVSQSSEE . . :. : :. :.. . : .. :: ::::.:.:. . . . :. .:.: mKIAA0 KAGFVGMPPPAL-PRGLFRLESFESLRGERLLKDALREVEGLKDLLLGPCV-DLPTTSRE 630 640 650 660 670 680 1350 1360 mKIAA1 SPGGTVLMDTPSTQDVPASPTACGI :. . :. : : :. : mKIAA0 -PALPLDSDSGSCPGVTANGEARTFNGSIELCRADSDSSQKDRNGNQLRSPQEEVLQPLI 690 700 710 720 730 740 >>mKIAA0521 ( 740 res) mbg02422 (740 aa) initn: 540 init1: 540 opt: 1058 Z-score: 827.6 bits: 164.7 E(): 5.9e-41 Smith-Waterman score: 1058; 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