FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1634.ptfa, 1170 aa vs ./tmplib.26680 library 1767847 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8948+/- 0.007; mu= 4.5229+/- 0.465 mean_var=255.6054+/-61.512, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0802 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4129 ( 1125 res) mfj49110 (1125) 888 117 1.7e-26 mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252) 796 106 3e-23 mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 265 45 5.6e-05 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 253 44 0.0003 mKIAA0973 ( 1202 res) mbg08419 (1202) 241 42 0.00063 mKIAA0807 ( 1432 res) mbg07407 (1432) 216 39 0.0052 >>mKIAA4129 ( 1125 res) mfj49110 (1125 aa) initn: 1801 init1: 514 opt: 888 Z-score: 567.9 bits: 117.0 E(): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 2137; 42.952% identity (52.368% ungapped) in 901 aa overlap (7-775:240-1110) 10 20 30 mKIAA1 EDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFEN ::: :::::::: ::.:::::.:.:::.:: mKIAA4 DPRCLNKQQKPLEECEDDEGVHTEELDSELELPAGWEKIEDPVYGVYYVDHINRKTQYEN 210 220 230 240 250 260 40 50 60 mKIAA1 PVEEAKRKKQLGQ---------------AEIH-SAKTDVERAH----------------- :: :::::::: : .: : :. : .: mKIAA4 PVLEAKRKKQLEQQQQQQQPQPPQPEEWTEDHASVVPPVAPSHPPSNPEPARETPLQGKP 270 280 290 300 310 320 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 -FTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRPDEFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGD :::.::.::: .....:.::. :::::..:::.::::::.:... ::::: :::. :: mKIAA4 FFTRNPSELKGKFIHTKLRKSSRGFGFTVVGGDEPDEFLQIKSLVLDGPAALDGKMETGD 330 340 350 360 370 380 130 140 150 160 170 mKIAA1 VIVDINGNCVLGHTHADVVQMFQLVPVNQYVNLTLCRGYPLPDDSEDPVVDIVAAT---- :::..: .::::::::.::..:: .:.. :.: :::::::: : .:: ...:... mKIAA4 VIVSVNDTCVLGHTHAQVVKIFQSIPIGASVDLELCRGYPLPFDPDDPNTSLVTSVAILD 390 400 410 420 430 440 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 --PVI-NGQSLTKGETCMNTQDFKLGAMVLDQNGKSGQILASDRLNG-PSESSEQRASLA :.: ::: . . ... :...: : .: .::. .: :... .::: mKIAA4 KEPIIVNGQETYDSPASHSSKTGKVSSMK-DARPSSPADVASNSSHGYPNDT----VSLA 450 460 470 480 490 500 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 SSGSSQPELVTIPLIKGPKGFGFAIADSPTG--QKVKMILDSQWCQGLQKGDIIKEIYHQ :: ..::::.:. ..::: ::::.::::: : :.::.:.:: :.::..::.: :. .. mKIAA4 SSIATQPELITVHIVKGPMGFGFTIADSPGGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKK 510 520 530 540 550 560 300 310 320 330 340 mKIAA1 NVQNLTHLQVVEVLKQFPVGADVPLLILRGGPCSPTKTAKT----KTDTKENSG------ ::: ::: :::..: . : :..: ::. ::: : :. :. . :....: mKIAA4 NVQALTHNQVVDMLIECPKGSEVTLLVQRGGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSH 570 580 590 600 610 620 350 360 370 380 mKIAA1 -SLETIN---------EPIPQPMPFPPSIIRSGSPKLDPSEVYLKSKTLYEDKP--P--- ::.: . : .: : : . ::. : :: ... .:...::..: : mKIAA4 RSLHTASPSHGIQVLPEYLPADAPAPDQTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPA 630 640 650 660 670 680 390 400 410 420 mKIAA1 ---------------------NTKDLDVFLRKQESGFGFRVLGGDGPDQSIYIGAIIPLG : .. :.:: ..:.:::::.:::. : . :::: :.::: mKIAA4 SGLSKGERDREINSTNFGECQNYQEQDIFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLG 690 700 710 720 730 740 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 AAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNGHVLLTVRRKIFYGEKQPED ::. :::::..:::.:.:: :: ::::. :..:: ::..::: ::::::. .. . :. mKIAA4 AADTDGRLRSGDELICVDGTPVIGKSHQLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFAVPKAEN 750 760 770 780 790 800 490 500 510 mKIAA1 E------SHQAFSQNGS-------PRLNRAELPTRS---------------------APQ : ::.. .: .: :. .. : : : : mKIAA4 EVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRTPQGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSAVL 810 820 830 840 850 860 520 530 540 550 560 mKIAA1 EAYDVTLQRKENEGFGFVILTSKSKPPPGV--------IPHKIGRVIDGSPADRCGGLKV . ::: ..: :::::::::..: :.: :. .::::::.:.:::::::: ::: mKIAA4 QPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVSRPEAGTTFGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKV 870 880 890 900 910 920 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 GDHISAVNGQSIVDLSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVVAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHR ::.: :::: ::.. ::..::.:::.:: :::: .. .: . ::. . mKIAA4 GDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIKEAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEK-------- 930 940 950 960 970 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 PMGQAQANHIPGDRIALEGEIGRDVCSSYRHSWSDHKHLAQPDTAVISVVGSRHNQSLGC .. ..: :... . : : . . . : . : : . : mKIAA4 -IATITTTHAPSQQGTQET---RTTTKPKQDSQFEFK-------------GPQAAQEQDF 980 990 1000 1010 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 YPVELERGPRGFGFSLRGGKEYNMGLFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGI : :::::: .:::::::::.:::: :..::::::::: . :....::.:.::::: :... mKIAA4 YTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERCGKMRIGDEILEINGETTKNM 1020 1030 1040 1050 1060 1070 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 THTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGLCSYVKPEQHKAFRAFLGLSLKRL :.::::::. :: .: :.:: : : .:..: mKIAA4 KHSRAIELIKNGGRRVRLFLRRGDGSVPEYGGSNYENIPSFPGMTP 1080 1090 1100 1110 1120 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 GDWDTNSPSSSNVIYDEQPPPLPSSHSASTFEESHVPATEDSLTRVQICEKAEELKDTVQ >>mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252 aa) initn: 2390 init1: 562 opt: 796 Z-score: 509.8 bits: 106.4 E(): 3e-23 Smith-Waterman score: 2558; 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