FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0520.ptfa, 1334 aa vs ./tmplib.26680 library 1767683 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8453+/-0.00425; mu= 18.0098+/- 0.285 mean_var=82.4323+/-18.683, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1413 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4070 ( 645 res) mbg13014 ( 645) 673 148 6.7e-36 mKIAA0422 ( 391 res) mbh03531 ( 391) 658 144 4e-35 mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150) 633 140 2.8e-33 mKIAA1060 ( 1115 res) mbh01281 (1115) 588 131 1.6e-30 mKIAA4084 ( 626 res) mfj00113 ( 626) 349 82 4.9e-16 mKIAA4004 ( 422 res) mfj25198 ( 422) 325 77 1.1e-14 >>mKIAA4070 ( 645 res) mbg13014 (645 aa) initn: 577 init1: 487 opt: 673 Z-score: 736.9 bits: 147.6 E(): 6.7e-36 Smith-Waterman score: 673; 44.000% identity (45.489% ungapped) in 275 aa overlap (962-1228:312-585) 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 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.:... : :. . : . . :: ...... mKIAA0 KGLLPDRVSRKVVPYLLWLLISAQI-FSYLGLNFSRAHAASDTVG-----WQAFFVFSFF 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 MQLPLYLS--LFLGVVYSVLFE-TFGYHFRNEDCYPSPGPGALHWELLSRALLHVCIHAI . ::: :: ....:: :. ..: ... : :. :.:. ..:..: . mKIAA0 ITLPLSLSPIVIISVVSCVVHTLVLGVTVAQQQQDELEGMQLLR-EILANVFLYLCAIIV 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 GIHLFVMSQVRSRSTFLKVGQSIMHGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEES :: . :.. . :..::.. ::. .:: .. .: .. :..:. .::...:. mKIAA0 GIMSYYMADRKHRKAFLEARQSLEVKMNLEEQSQQQENLMLSILPKHVADEMLKD----- 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 ENSVKRHATSSPKNRKKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHA ::. :: : . : . :.::::::::::::..:. ::. mKIAA0 ---------------MKKDESQKDQQQFNTMYMYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQE 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LVGLLNDLFGRFDRLCEQTKCEKISTLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIE :: :::.::.:::.: . . .:. :::::::. : :. : ::: : : :::.:..:: mKIAA0 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