FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0639.ptfa, 810 aa vs ./tmplib.26680 library 1768207 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5922+/-0.00686; mu= 0.4210+/- 0.452 mean_var=279.1834+/-69.128, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 136 in 1/35 Lambda= 0.0768 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4109 ( 801 res) mfj19244 ( 801) 1246 152 3e-37 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 300 47 1.4e-05 mKIAA0291 ( 993 res) mfj01134 ( 993) 252 42 0.00047 >>mKIAA4109 ( 801 res) mfj19244 (801 aa) initn: 920 init1: 660 opt: 1246 Z-score: 761.1 bits: 151.7 E(): 3e-37 Smith-Waterman score: 1375; 36.976% identity (40.473% ungapped) in 787 aa overlap (1-774:55-786) 10 20 30 mKIAA0 VQESGTLPLMEECILSVGIGCVKVRPLRSP ::.::::::: : ::::.:::: .: : mKIAA4 ELHQAKDVNTGGVFQLRQGHSRRVQVTVKPVQHSGTLPLMVEAILSVSIGCVTAR---ST 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 KIHENVHEEEEDMDSYQDRDLERLRRKWLNALTKRQEYLDQQLQKLVSKHDKTEDDADRE :.... .::::..::. .:..: .:: ::.::::.:..:. .:..::::: .:: mKIAA4 KLQRG-------LDSYQEEDLNCVRERWSDALIKRREYLDEQIKKVSNKKEKTEDDMERE 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 AQLLEMRLTLTEERNAVMVPSAGSGIPGAPAEWTPVPGMETHIPVIFLDLNADDFSSQDN :.:.:. . ::::::::.::. :::::::::.:.: :::::::::.::::::::.:.... mKIAA4 ARLVEQWVGLTEERNAVLVPAPGSGIPGAPADWVPPPGMETHIPVLFLDLNADDLSANEQ 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 mKIAA0 LDDPEA-GWDATLTGEEEEEFFELQIVKQHDGEVKAEASWDSAVHSCPQLSKGTPADERV : :.: : .. : :. .:: : :.:. : ::.: :::::.::. .:.. :: .::. mKIAA4 LVGPHASGVNSILPKEHGSQFFYLPIIKHSDDEVSATASWDSSVHDSLHLNRVTPQNERI 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 FLILRVTVQLSHPADMQLVLRKRICVHVHGRQGFAQSLLKKMSHRSSIPGCGVTFEIVSN .::...:::::::: :.::::::: ......:.:.::: ...: . .::::.::::: mKIAA4 YLIVKTTVQLSHPAAMELVLRKRIAANIYNKQSFTQSLKRRISLINICYSCGVTYEIVSN 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 IPEDAQGVEEREALARMAANVENPASADSEAYIEKYLRSVLAVENLLTLDRLRQEVAVKE ::. .. .:.::.:: .:: :: .. :.:.::::: :.:: :::.:.:.:::: :.::: mKIAA4 IPKATEEIEDRETLALLAARSENEGTLDGETYIEKYTRGVLQVENILSLERLRQAVTVKE 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 QLTGKGKLSRRSISSPSMNRLSGSRQELSPSHSLGSNKGRWESQQDVS------QTLVSR :. :.. :::.:.:... .:.:: .:: ..:: :.: ::: : .. mKIAA4 ALSTKARHIRRSLSTPNVHNVSSSRPDLSGFDE--DDKGWPENQLDVSDYSSSYQDVACY 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 GIAPGPPALSVSPQNNQSSDPGLGGVAASYLNPVKSLVPQMPKLLKSLFPVRDDRRGRHS : : ::. .. . :. . : . ..: :.. :: ::..: :.::..... : mKIAA4 GTLPRD-----SPRRSKEGCPSENPHALT-VSPFKAFSPQPPKFFKPLMPVKEEHKKR-- 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 SPLAHQPVPRILVQPTFSDTWATRTEEAQQGSPGPSGALESMVKMAAPAVKI--CDKPVK :: . : .: : .. . : . . .:: .:. . . . : :: .. . mKIAA4 --LALEARP-LLSQESMPPSQAH--NPGCIVTPGSNGSSMPVEHSSKPEKKIDSEEEENE 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 VSSPPSPMVVTQPPEGQDGPPSPLSEASSGYFSHSVSSATLSETLTLGLDTTGLGSQTPG . . ...::: :. :. . .. :. . : . . :. .: . . mKIAA4 LEALSRKLMLTQPY-------VPVEFADFSVYNASLENREWSSSKADLTDSRALEKAVSR 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 SPPALCQVTPEPELAFLSCTLSHPPAPEEAHVPAAPTQSTELEVPRAPLLSEPASAVPTS :: . .. ...: . :. . : ::.. . : .: : .: : : . mKIAA4 SPTTSSLTS-----GYFSHSASNATLSDMA-VPSSDS-SDQLAVST----KEVECAEPPG 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 PFRIRKVRTSELKSFTGMLGGASSGAEEDPLASEDPSNARGQTLGRLEVTSDSEDASEVP : :: . . .: . : .:: .: . . ..: . : : :..:..: mKIAA4 PSLAPDVRRASNQELTEV--GRGSGKDETIAVPLEENSALPK--GTPSPQSIPEESSRMP 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 mKIAA0 EWLREGEYVVVGTNKTG-IVRYIGPTDFQEGTWIGVELDLPAGKNDGSIGGKQY---FRC . :: .: : .: . : . .. : . : ::.. : mKIAA4 CRTASCSELDVGPSKDGHQAREFCPGEVTIEHTTNILEDHSFTEFMGVSDGKDFDGLADC 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 NPGYGLLVRPSRVRRAVGTGRRRSSGLQPQGAPEVRRSATISGSATNLASLTAALAKGDR . : .::: :::. :.. .:. :. :.. : mKIAA4 SVG-----EPSR-RRAL-TNETDHKGI-PERPPDADRLHPKIENDQEATATR 760 770 780 790 800 800 810 mKIAA0 SYKNPENRKSWAS >>mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319 aa) initn: 265 init1: 265 opt: 300 Z-score: 192.3 bits: 47.2 E(): 1.4e-05 Smith-Waterman score: 306; 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