FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0700.ptfa, 1101 aa vs ./tmplib.26680 library 1767916 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8365+/-0.00507; mu= 13.9957+/- 0.339 mean_var=123.0655+/-29.149, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1156 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4126 ( 1285 res) mic04070 (1285) 2753 471 4.5e-133 >>mKIAA4126 ( 1285 res) mic04070 (1285 aa) initn: 3892 init1: 1478 opt: 2753 Z-score: 2481.4 bits: 471.1 E(): 4.5e-133 Smith-Waterman score: 3793; 51.973% identity (56.583% ungapped) in 1166 aa overlap (29-1101:122-1285) 10 20 30 40 50 mKIAA0 TSNMAHAGSGGSAGRGFGGSRWGRSGSGGHEKLP-VHVEDALTYLDQVKIRFGSDPAT :.... ..:::::.::::::..:::.: . mKIAA4 SHHHPTAVQPHGGQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQV 100 110 120 130 140 150 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 YNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQ 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