# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg16135.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1708.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1708, 1291 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7897588 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8249+/-0.000211; mu= 7.7582+/- 0.012 mean_var=181.9732+/-34.781, 0's: 37 Z-trim: 117 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.095076 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|50401187|sp|Q9QXL2.2|KI21A_MOUSE RecName: Full= (1672) 8290 1151.0 0 gi|50400977|sp|Q7Z4S6.2|KI21A_HUMAN RecName: Full= (1674) 7744 1076.1 0 gi|149714100|ref|XP_001500073.1| PREDICTED: simila (1786) 7727 1073.8 0 gi|119578207|gb|EAW57803.1| kinesin family member (1661) 6693 931.9 0 gi|33187651|gb|AAP97680.1|AF450487_1 kinesin-like (1662) 6644 925.2 0 gi|119892302|ref|XP_868987.2| PREDICTED: kinesin f (1660) 6580 916.4 0 gi|224093118|ref|XP_002194164.1| PREDICTED: kinesi (1658) 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