FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1888.ptfa, 609 aa vs ./tmplib.26680 library 1768408 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4901+/-0.00429; mu= 16.8279+/- 0.287 mean_var=90.5331+/-20.996, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1348 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0822 ( 1574 res) mic38093 (1574) 1403 284 7.5e-77 mKIAA1062 ( 1416 res) mbg17754 (1416) 731 153 1.5e-37 mFLJ00002 ( 1486 res) mbg13511 (1486) 217 53 1.9e-07 mKIAA1520 ( 782 res) mbh00594 ( 782) 176 45 3.3e-05 >>mKIAA0822 ( 1574 res) mic38093 (1574 aa) initn: 1695 init1: 710 opt: 1403 Z-score: 1472.1 bits: 283.8 E(): 7.5e-77 Smith-Waterman score: 1697; 44.850% identity (46.552% ungapped) in 602 aa overlap (1-600:986-1567) 10 20 30 mKIAA1 AMPPYFAMENAENHKIKAYTQLKLSGLLPS : :::.:: .. ..: .:. ::..:::.:: mKIAA0 QTDRSTYLMDETIHPLEDLWKTAFWLILTSACPPYIAMSSVTDYKNRAWFQLRVSGLFPS 960 970 980 990 1000 1010 40 50 60 70 80 mKIAA1 AYWVGQAVVDIPLF-FVVLIL-MLGSLFAFHHGLYFYPAKFLAVVFCLIAYVPSVILFTY :::::::.:::::. :: :.. .. :: : .. .. . . : ..:. :.:..:: mKIAA0 AYWVGQAMVDIPLYCFVFLFMSLMDYLFRFPDTMFSIISHVIQIP-CSVGYAISLIFLTY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 IASFTFKKILNTKEFWSFIYSVTALACVAITETTFFLQYAVTAVFHYTFCIAIPIYPLLG . :: .: ... .::. . . .. ::. ..: . : .. .: . . :: :.: mKIAA0 VISFISRKGKKNSGIWSLSFYIITVFSVAV----ILLAFDVDGTQYYIIFL-IPPSTLVG 1080 1090 1100 1110 1120 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 CLISFIKGSWKNMPKNENTYNPWDRLLVAVIMPYLQCILWIFLLQHYEKIHGGRSIRKDP ::: .. .. .. .. .:. .. ..:.:. ...:: :. : : ...:::: mKIAA0 CLILSLHLFIGQIFEEGQVIEPF----LVFLIPFLHVFIFIFTLRCLEWKFGKKTMRKDP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 FFRALSQKAKNKKFPEPPINEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPAIMVCNLHKEYDD .:: .. . :: : :::::::. ::... . . .:::.:.. :.::: mKIAA0 IFRISPRNNDVYQNPEEP--EDEDEDVQMERMRTANALVSTSFDEKPVIIASCLRKEYAG 1190 1200 1210 1220 1230 1240 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 KKDFLHSRKTTKVATKYISFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTVINTLVGDVEPTSGKIFLGD :. :.: .:.::. .::::.::::::::: ::::::: .. . ::.. :.:...: mKIAA0 KQKHCLSKKKAKIATRNVSFCVRKGEILGLLGHNGAGKSTSLKMISGDTKVTAGQVLL-- 1250 1260 1270 1280 1290 1300 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 YGSHSSEDDESIKCMGYCPQTNPLWPDLTLQEHFEIYGAVKGMSPGDMKEVISRITKALD ..:.. .. .::::: : :::.::..::.::..::.:. . .:.:.. :: mKIAA0 ---KGSREGDTPGFLGYCPQENALWPNLTVKEHLEIFAAVRGLRKSHAAVAITRLADALK 1310 1320 1330 1340 1350 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 LKEHLQKTVKKLPAGIKRKLCFALSMLGNPQVTLLDEPSTGMDPRAKQHMWRAIRTAFKN :...:.. :: : :.::::::.::.::::.. ::::::::.::...:..:.:::. .:: mKIAA0 LQDQLKSPVKTLSEGVKRKLCFVLSILGNPSILLLDEPSTGLDPEGQQQIWQAIRAIIKN 1360 1370 1380 1390 1400 1410 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 KKRAALLTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENL :.:::::::: ::::.::::::.:::.:::::..::::::::: :.::.:.: .: mKIAA0 TDRGALLTTHYMAEAEALCDRVAILVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKT-LE-- 1420 1430 1440 1450 1460 1470 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 EIDRLQREIQYIFPNASRQESFSSILAFKIPKEDVQSLSQSFAKLEEAKRTFAIEEYSFS ... :. :: .::.::::: .::..:.:.: : :: :::.: :::..:.:: .::::.: mKIAA0 QVEPLNTEILRLFPQASRQERYSSLMAYKLPVEAVQPLSQAFFKLEKVKQTFDLEEYSLS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 570 580 590 600 mKIAA1 QATLEQVFVELTKEQEEEDNSCGTLASTLWWERTQEDRVVF :.::::::.::.:::: . : :.. :. mKIAA0 QSTLEQVFLELSKEQELDGLELEELDSSIKWKLLPQEEA 1540 1550 1560 1570 >>mKIAA1062 ( 1416 res) mbg17754 (1416 aa) initn: 761 init1: 269 opt: 731 Z-score: 766.3 bits: 153.1 E(): 1.5e-37 Smith-Waterman score: 828; 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