FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0340.ptfa, 983 aa vs ./tmplib.26680 library 1768034 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7928+/-0.00884; mu= -19.2717+/- 0.581 mean_var=524.1977+/-129.968, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0560 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0751 ( 1297 res) mpg01166 (1297) 2743 237 1.3e-62 >>mKIAA0751 ( 1297 res) mpg01166 (1297 aa) initn: 2821 init1: 1743 opt: 2743 Z-score: 1216.4 bits: 236.9 E(): 1.3e-62 Smith-Waterman score: 3295; 57.113% identity (64.195% ungapped) in 970 aa overlap (92-966:1-958) 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 DRNKGAEPSQQALGPEQKQASRSRSEPPRERKKAPGLS-EQNGKGGQKSERKRVPKSVVQ ::..:..: .:: . :. ::. . : mKIAA0 RKRSPSVSRDQNRRYEQSEEREDYSQYV-- 10 20 130 140 150 160 mKIAA0 PGEGT-----ADERERKERRETRRLEKGRSQDYPD---RLEKREDGRVAEDE-------- :..:: .: .:. .:: . :. .: : : ... ...:: mKIAA0 PSDGTMPRSPSDYADRRSQREPQFYEEPGHLNYRDSNRRGHRHSKEYIVDDEDVESRDEY 30 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 -KQRKEEEYQTRYRSDPNLARYPVKAPLEEQQMRMHARVSRARHERRHSDVALPHTEAAA .::.:::::.:::::::::::::: :.:::.::.:::::::::::::.: ..: mKIAA0 ERQRREEEYQARYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANAELED 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 mKIAA0 AV---------SAETTAGKR--AQTTARVSPPESPR-ARAPAAQPP--AEHGPPPPRPAP . : . ....: :. . : : : :.. .. : ..:.:: :: .: mKIAA0 SRISLLRMDRPSRQRSVSERRAAMENQRSYSMERTREAQGQSSYPQRTSNHSPPTPRRSP 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 GPAEPPEPRVPEPLRKQGRLDPGSAVLLRKAKREKAESMLRNDSLSSDQSESVRPSPPKP : . :. : . :::: .:::.::: ::.:::: :.::::::::::::::::: ::.: mKIAA0 IPLDRPDMRRADSLRKQHHLDPSSAV--RKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPRP 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 HRPKRGGKRRQMSVSSSEEEGVSTPEYTSCEDVELESESVSEKGDLDY-WLDPATWHSRE :. :.::: ::.:.:::::: .::::::::.::::::::::::::..: ::. :.::: : mKIAA0 HKSKKGGKMRQVSLSSSEEELASTPEYTSCDDVELESESVSEKGDMEYSWLEQASWHSSE 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 TSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILNKRT---TMPKESGALLGLKVVGGKMTDLGRLGA .::.: :::::::::.:::::::..:::: ..:..:::.:::::::::::. ::: : mKIAA0 ASPMSLHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCA 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 FITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPI ::::::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: :::::..::::: mKIAA0 FITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPI 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 GDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYD :::::::.:.: :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.: mKIAA0 GDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFD 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 KVGHQLIVNVLQATDLPPRVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKLLEPKWNQTF ::::::::..: : ::: : ::::::::::.:::::::::.::::::::: ::::::::: mKIAA0 KVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTF 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 VYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQDEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDES .:: ::::.:::::::::.::: ::..::::::::::::::::::::::::::::::: : mKIAA0 IYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVS 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 SLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRASARES :::::.:::..:::..:::: ...::::.:::::..:::. .::.::: :: ..:. mKIAA0 SLPLPRPSPYLPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCEDGVGVVSD--YRHNGRDL 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 mKIAA0 KATTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGDDQGRPRSRLPNVPL-QRSLDEIH-PTR------ ...::.:::: ...: : : :::: : :: :: :..: ::.... : :: mKIAA0 QSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSAPPPQRNVEQGHRGTRATGHYN 690 700 710 720 730 740 800 810 820 mKIAA0 ------RSRSPTRHHDASRS----LAD----HRSRHAE-----------SQYSSEPD--- : : :....:. :: :::: .: :. : .:: mKIAA0 TISRMDRHRVMDDHYSSDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSSERPDTNL 750 760 770 780 790 800 830 840 850 860 mKIAA0 --------------------RTH-RQGSPTQSPPADTSFGSRRGRQLPQVPVRSGSIEQA :.: : :: .:. :..: .::::::::.: . :..:.. mKIAA0 MRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGS-VQTSPSSTPGTGRRGRQLPQLPPK-GTLERS 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 SLVVEERTRQMKMKVHRFKQTTGSGSSQELDHEQYSKYNIHKDQYRSCDNASAKSSDSDV .. .:::.::::. ...::..:: : :. .::: : .:. :..:.::::::: mKIAA0 AMDIEERNRQMKL--NKYKQVAGSDPRLEQDY--HSKYRSGWDPHRGADTVSTKSSDSDV 870 880 890 900 910 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 SDVSAISRASSTSRLSSTSFMSEQSERPRG--RISSLTLVLLMMALPYKFVQKSRLF :::::.::.::.::.::::.:: ::::::: .:: :: mKIAA0 SDVSAVSRTSSASRFSSTSYMSVQSERPRGNRKISFSPLVQDHGAQTPVQPPLIPLGPDL 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 NVFTSKMQNRQMGVSGKNLTKSTSISGDMCSLEKNDGSQSDTAVGALGTSGKKRRSSIGA 980 990 1000 1010 1020 1030 983 residues in 1 query sequences 1768034 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:18:14 2006 done: Mon Mar 27 10:18:15 2006 Scan time: 1.040 Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]