# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg13915.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1990.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1990, 885 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916303 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9921+/-0.000181; mu= 14.5450+/- 0.010 mean_var=69.9407+/-13.998, 0's: 45 Z-trim: 79 B-trim: 3269 in 1/64 Lambda= 0.153359 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81912665|sp|Q7TSQ8.1|PDPR_MOUSE RecName: Full=P ( 878) 5938 1323.5 0 gi|149038201|gb|EDL92561.1| similar to pyruvate de ( 878) 5778 1288.1 0 gi|109129193|ref|XP_001108170.1| PREDICTED: simila ( 878) 5579 1244.1 0 gi|182668644|sp|Q8NCN5.2|PDPR_HUMAN RecName: Full= ( 879) 5561 1240.1 0 gi|152013038|gb|AAI50252.1| Pyruvate dehydrogenase ( 878) 5560 1239.8 0 gi|158258441|dbj|BAF85191.1| unnamed protein produ ( 878) 5552 1238.1 0 gi|50949595|emb|CAH10555.1| hypothetical protein [ ( 879) 5526 1232.3 0 gi|73957397|ref|XP_536787.2| PREDICTED: similar to ( 903) 5483 1222.8 0 gi|75069155|sp|O46504.1|PDPR_BOVIN RecName: Full=P ( 878) 5464 1218.6 0 gi|224064154|ref|XP_002187977.1| PREDICTED: simila ( 879) 4982 1112.0 0 gi|194381118|dbj|BAG64127.1| unnamed protein produ ( 779) 4978 1111.0 0 gi|50949897|emb|CAH10494.1| hypothetical protein [ ( 696) 4505 1006.3 0 gi|46329638|gb|AAH68953.1| LOC414703 protein [Xeno ( 720) 4174 933.1 0 gi|50370187|gb|AAH76859.1| LOC445844 protein [Xeno ( 605) 3542 793.2 0 gi|210116748|gb|EEA64490.1| hypothetical protein B ( 828) 2948 661.9 3.2e-187 gi|210119825|gb|EEA67548.1| hypothetical protein B ( 822) 2946 661.5 4.3e-187 gi|210116815|gb|EEA64557.1| hypothetical protein B ( 826) 2811 631.6 4.3e-178 gi|210119826|gb|EEA67549.1| hypothetical protein B ( 828) 2766 621.7 4.2e-175 gi|210116747|gb|EEA64489.1| hypothetical protein B ( 828) 2742 616.3 1.7e-173 gi|152941086|gb|ABS44980.1| pyruvate dehydrogenase ( 437) 2648 595.3 1.9e-167 gi|13624030|dbj|BAA91436.2| unnamed protein produc ( 614) 2642 594.1 6.1e-167 gi|157014607|gb|EAA13207.3| AGAP004715-PA [Anophel ( 925) 2611 587.4 9.7e-165 gi|189235793|ref|XP_970207.2| PREDICTED: similar t ( 884) 2585 581.6 5.1e-163 gi|115948294|ref|XP_786380.2| PREDICTED: similar t ( 870) 2575 579.4 2.3e-162 gi|108874356|gb|EAT38581.1| nad dehydrogenase [Aed ( 933) 2561 576.3 2.1e-161 gi|167881176|gb|EDS44559.1| NAD dehydrogenase [Cul ( 928) 2496 562.0 4.4e-157 gi|215491298|gb|EEC00939.1| NAD dehydrogenase, put ( 843) 2163 488.2 6.2e-135 gi|119579558|gb|EAW59154.1| hCG201155, isoform CRA ( 406) 1994 450.6 6.4e-124 gi|119579560|gb|EAW59156.1| hCG201155, isoform CRA ( 301) 1979 447.2 5.1e-123 gi|119579557|gb|EAW59153.1| hCG201155, isoform CRA ( 336) 1979 447.2 5.5e-123 gi|156220736|gb|EDO41600.1| predicted protein [Nem ( 771) 1982 448.2 6.6e-123 gi|193226302|emb|CAQ72251.1| sarcosine deshydrogen ( 826) 1937 438.2 6.9e-120 gi|113530390|emb|CAJ96737.1| glycine cleavage syst ( 831) 1917 433.8 1.5e-118 gi|119956099|gb|ABM13104.1| FAD dependent oxidored ( 823) 1902 430.5 1.5e-117 gi|150031539|gb|ABR63655.1| FAD dependent oxidored ( 825) 1885 426.7 2e-116 gi|212509372|gb|EEB12779.1| Sarcosine dehydrogenas ( 897) 1880 425.7 4.6e-116 gi|15140860|emb|CAC49374.1| dimethylglycine dehydr ( 825) 1861 421.4 8e-115 gi|167044745|gb|ABZ09414.1| putative glycine cleav ( 823) 1838 416.3 2.7e-113 gi|184194365|gb|ACC72329.1| FAD dependent oxidored ( 827) 1801 408.1 7.9e-111 gi|168203385|gb|ACA21521.1| putative dehydrogenase ( 817) 1797 407.3 1.4e-110 gi|170141199|gb|EDT09370.1| FAD dependent oxidored ( 826) 1797 407.3 1.5e-110 gi|32766376|gb|AAH55193.1| Yippee-like 5 [Danio re ( 424) 1789 405.3 3e-110 gi|167072224|gb|EDR76099.1| FAD dependent oxidored ( 816) 1789 405.5 4.9e-110 gi|115254511|emb|CAK05585.1| Pyruvate dehydrogenas ( 816) 1783 404.2 1.2e-109 gi|14025229|dbj|BAB51830.1| sarcosine dehydrogenas ( 869) 1776 402.6 3.8e-109 gi|221724317|gb|ACM27473.1| glycine cleavage syste ( 815) 1773 401.9 5.7e-109 gi|86279851|gb|ABC88914.1| probable glycine cleava ( 816) 1772 401.7 6.7e-109 gi|159177705|gb|EDP62256.1| FAD dependent oxidored ( 823) 1770 401.3 9.2e-109 gi|190695004|gb|ACE89089.1| probable sarcosine deh ( 816) 1762 399.5 3.1e-108 gi|209537348|gb|ACI57283.1| FAD dependent oxidored ( 816) 1762 399.5 3.1e-108 >>gi|81912665|sp|Q7TSQ8.1|PDPR_MOUSE RecName: Full=Pyruv (878 aa) initn: 5938 init1: 5938 opt: 5938 Z-score: 7092.4 bits: 1323.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5938; 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