FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1756.ptfa, 991 aa vs ./tmplib.26680 library 1768026 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0204+/-0.00678; mu= 12.6456+/- 0.448 mean_var=209.8308+/-50.634, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 142 in 1/35 Lambda= 0.0885 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 280 50 3.6e-06 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 227 43 0.00032 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 226 43 0.00035 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 191 38 0.0073 >>mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916 aa) initn: 155 init1: 87 opt: 280 Z-score: 203.2 bits: 50.0 E(): 3.6e-06 Smith-Waterman score: 318; 20.983% identity (24.072% ungapped) in 834 aa overlap (175-982:37-789) 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 RNLSVEVRSVRSMLEEVISNWDRYGDTVASLQAWLEDAEKMLSQSEHAK--KDFFRNL-P :. ::... .. :: : . . : mKIAA4 LLLQDQINEQGLEIQNLKAASVEAQAHTELLKQELESSQLKVAGLEHLKTLQPELDALHK 10 20 30 40 50 60 210 220 230 240 250 mKIAA1 HWIQQHTAMNDAGNFLIETCDEI--VSRDLKQQLLLLNGRWRELFMEVKQYARADEMDRM : :.. .: . : : . . :. .. .: :... .: :..:.. .:. mKIAA4 HMGQKEEEVNYLYGQLSEKEQTLTTVQTEMVEQERLIKALHTQLEMQAKEHE-----ERL 70 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 KKEYIDVTT-----TLFGFATEAHRKLSEPLEVSFINVKLLIQDLEDLEKRVP-VMDAQY :. ... : . :.:...:.. :....:. : ... ..:.... . :: mKIAA4 KQAQVEICELKKKPTELEEETNAKQQLQRKLQAALISRKEALKENKSLQEQLSSARDAVE 130 140 150 160 170 180 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 KMIAKKAHLFAKESPQ-EEANEMLTTMSKLKEQLSKVKECCSPLLYEAQQLTVPLEELET .. . : . .. : : .: . .: .. :.:. .:. . .: : :.:. : :. mKIAA4 RLTKSLADVESQVSVQNQEKDAVLGKLTILQEERDKLIAEMDRFLLENQSLSGSCESLKL 190 200 210 220 230 240 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 QITSFYDSLGKI-NEILSVLEQEAQSSTLFKQKHQELLASQENCKKSLTLIEKGSQSVQK . .. .. :. .:. :: .. :: ...::.:: : .: . . .. .:. mKIAA4 ALGGLTEDKEKLMEELESVRSSKMAESTEWQEKHKELQKEYEVLLQSYENVSNEAERIQH 250 260 270 280 290 300 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 LVTSSQARKPWDHTKLQKQIADVHHAFQSMIKKTGDWKKHVEANSRLMKKFEESRAELEK .: : . .: ..::.. .: .. :. : ....: .. :.:: .:. . : mKIAA4 VVESVRQEKQELYAKLRSTESDKRERE----KQLQDAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQ--K 310 320 330 340 350 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 VLRVAQEGLEEKGDPEELLRRHTEFFSQLDQRVLNAFLKACDELTDILPEQEQQGLQEAV .:. :::..: :: ... . . ..:.:.. . : . : :. :.. mKIAA4 ILE-----LEEENDR---LRAEAQPVGGTGES-MEALLSSNSSLKE---ELEKITLEH-- 360 370 380 390 400 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 RKLHKQWKDLQGEAPYHLLHLKIAVEKDRFSAAVEECRAELE-QETKLAPQEGSEKIIKE . : :... :..: :: .: ... . ..: : : : :..:: mKIAA4 KTLSKEFEALMAE-------------KDALSEETRNLKLQVEAQVLKQASLEATEK---- 410 420 430 440 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 HRVFFSDKGPHHLCEKRLQLIEELCGKLPVQDPVRDTCGACHTALKELKASIDNTYTMLV ::. :. . :. : . :: .: . :. . . . . mKIAA4 -----SDE-PKDVIEEVTQAV---VGKSQERDALSDSAKLEDSEAILMGDGAKPGVSETF 450 460 470 480 490 680 690 700 710 720 mKIAA1 DDPDKWKDYTSRFSEFSSWVSAKKACLKKIKDEPIDTGNHDEVKHMVDEI---------- .. : :.: ........ .. . ..: ::. .. . ..: . .. .: mKIAA4 SSHDDIKNYLQQLDQLKGRIAELE--MEKQKDRELSQALENEKNALLTQISAKDSELKLL 500 510 520 530 540 550 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 RNDITKKGESLSWLKSRLKYLIDISSENEAQKRGDELAELSSSFKALVALLSEVEKLLSN ....::. . .. .: . .. : .: :.: : :. :.:.. ..: mKIAA4 EEEVTKRTTLNQQIQEELCRVTKLKETAEEEK--DDLEE------RLMNQLAELNGSIGN 560 570 580 590 600 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 FGECVQYKEIVKSSLEGLISGPQESKEEAEMILDSKNLLEAQQLLLHHQQKTKMISAKKR . . : .: . .::. . . :. : : : :::. ..:::. : .. mKIAA4 YYQDVTDAQIKNEQLESEMRNLQRCVSELEE--------EKQQLV---KEKTKVESEIRK 610 620 630 640 650 850 860 870 880 890 mKIAA1 DLQEQMEQAQQGGQAGPGQEELRKLESTLTGLEQSRERQERRIQVS-LRKWERFETNKET . .:.. ::.: ::... : : : . .... ...: . .: ::. . : mKIAA4 EYMEKI----QGAQKGPANKSHAK---ELQELLREKQQEVKQLQKDCIRYLERI-SALEK 660 670 680 690 700 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 VVRYLFQTGSSHERFLSFSSLESLSSELEQTKEFSKRTESIATQAENLVKEAAE-LPLGP .:. : . . .. :. .. .:.. .:. :. . . :. .. .:::. : . mKIAA4 TVKALEFVHTESQKDLDVTK-GNLAQAVEHRKKAQAELSSFKILLDDTQSEAARVLADNL 710 720 730 740 750 760 960 970 980 990 mKIAA1 RNKRVLQRQAKSIKEQVTTLEDTLEEEYVLHHF . :. :: . .::: :. .. : mKIAA4 KLKKELQSNKESIKSQIKQKDEDLLRRLEQAEEKHRKEKKNMQEKLDALHREKAHVEETL 770 780 790 800 810 820 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 123 init1: 70 opt: 227 Z-score: 168.1 bits: 43.0 E(): 0.00032 Smith-Waterman score: 315; 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