FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4070.ptfa, 645 aa vs ./tmplib.26680 library 1768372 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4546+/-0.00502; mu= 13.1105+/- 0.336 mean_var=113.0505+/-26.062, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1206 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0422 ( 391 res) mbh03531 ( 391) 1030 190 3.3e-49 mKIAA1060 ( 1115 res) mbh01281 (1115) 924 172 2.4e-43 mKIAA0520 ( 1334 res) mbg16592 (1334) 673 129 3.7e-30 mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150) 481 95 3.9e-20 mKIAA4084 ( 626 res) mfj00113 ( 626) 239 53 1.2e-07 >>mKIAA0422 ( 391 res) mbh03531 (391 aa) initn: 1012 init1: 548 opt: 1030 Z-score: 975.8 bits: 190.1 E(): 3.3e-49 Smith-Waterman score: 1030; 46.438% identity (48.485% ungapped) in 379 aa overlap (208-582:21-387) 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 TLYLHITRVQCFPGCLTIQIRTALCVFIVVLIYSVAQGCVVGCLPWAWSSQSNSSLVVLA :...:.: :. : : .: : .:: mKIAA0 RWWKGGIVRQGSRALPALHALVFAVTQRCLC-CPPSPQYFVGNVLLSLLA 10 20 30 40 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 AGGRRTVLP----ALPCESAHHALLCCLVGTLPLAIFLRVSSLPKMILLSGLTTSYILVL .. . :. . :. :.: : ::: .. .. . ::..: mKIAA0 SSVFLHISSIGKLAMTFILGFTYLVLLLLGP-PAAIF---DNYDLLLGVHGLASSN---E 50 60 70 80 90 100 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 ELSGYTKVGGGALSGRSYEPIMAILLFSCTLALHARQVDVRLRLDYLWAAQAEEERDDME ..: . : .. . . :.. .:.:. .: :::.::. :::.:: :: :...:: mKIAA0 TFDGLDCPAVGRVALKYMTPVI-LLVFALALYLHAQQVESTARLDFLWKLQATGEKEEME 110 120 130 140 150 160 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 RVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSYSQVGVMFASIPNFNDFYIELDGN ... :.:.: :.:: :: ::: . :: .::::: :.:::::: ::..::.::..: mKIAA0 ELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEFYVELEAN 170 180 190 200 210 220 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 NMGVECLRLLNEIIADFDELMDKDFYKDLEKIKTIGSTYMAAVGLAPTAGTRAKKSISSH : :::::::::::::::::..... ...:::::::::::::: :: .. .. .: : mKIAA0 NEGVECLRLLNEIIADFDEIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGLNASTYDQVGRS---H 230 240 250 260 270 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 LCTLADFAIDMFDVLDEINYQSYNDFVLRVGINVGPVVAGVIGARRPQYDIWGNTVNVAS . .:::.:. ... . .:: .:.:.: ...:.:.:::::::::::.::::::::::::.: mKIAA0 ITALADYAMRLMEQMKHINEHSFNNFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDIWGNTVNVSS 280 290 300 310 320 330 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 RMDSTGVQGRIQVTEEVHRLLKRCSYQFVCRGKVSVKGKGEMLTYFLEGRTDGNSSHGRT ::::::: ::::: .....: .::. ::: :.::::::: ::::.: mKIAA0 RMDSTGVPDRIQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGPSS 340 350 360 370 380 390 600 610 620 630 640 mKIAA4 FRLERRMCPYGRGGGQARRPPLCPAAGPPVRPGLPPAPTSQYLSSTAAGKEA >>mKIAA1060 ( 1115 res) mbh01281 (1115 aa) initn: 999 init1: 491 opt: 924 Z-score: 870.7 bits: 172.1 E(): 2.4e-43 Smith-Waterman score: 1022; 36.707% identity (40.607% ungapped) in 583 aa overlap (38-580:534-1100) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 RKIFPGLILSDIKPAKRMKFKTVCYLLVQLMHCRKMFKAE---IPFSNVMTCEDDDKRRA .: : . .: : ..: . . . :. mKIAA1 RHTLDGAKMRASVRMTRYLESWGAAKPFAHLHHRDSMTTENGKISTTDVPMGQHNFQNRT 510 520 530 540 550 560 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 LRTASEKLRNRSSFSTNVVYTTPGTRVNRYISRLLEARQTELEMADLNFFTLKYKHVERE ::: :.: : . .. .. . : .: . : .. ... .: :.. :..:.: mKIAA1 LRTKSQKKRFEEELNERMIQAIDG--INAQKQWL---KSEDIQRISLFFYN---KNIEKE 570 580 590 600 610 130 140 150 160 170 mKIAA4 QKYHQLQD-EYFTSAVVLALILAALFGLIYLLVIPQSV-------AVLLLLVF--SICF- . : .:... . : :. .: .. .::.:.. :..: :.: .:: mKIAA1 YRATALPAFKYYVTCACL--IFLCIF-IVQILVLPKTSILGFSFGAAFLSLIFILFVCFA 620 630 640 650 660 670 180 190 200 210 mKIAA4 --LVACT-------LYL----HITRVQCFPG-CLTIQIRTALCVFIVVLIYSVAQGCVVG :. :. :.: : . .: ::: . ::. . ..:. . .. mKIAA1 GQLLQCSKKASASLLWLLKSSGIIANRPWPRISLTI-VTTAIILTMAVFNMFFLSNSEET 680 690 700 710 720 730 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 CLPWAWSSQSNSSLVVLAAGGRRTVLPALPCESAHHALLCCLVGTLPLAIFLRVS-SLPK :: : .:..: :. .. ..: : . . :..: . ..::::. : mKIAA1 TLPTANASNANVSV----PDNQTAILHARNLFFLPYFIYSCILGLISCSVFLRVNYELKM 740 750 760 770 780 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 MILLSGLTTSYILVLE-----LSGYTKV---GGGALSGRSYEPIMAILLFSCTLALHARQ .:.. .:. :..:. :..:..: : . . ... .: :: . .:: mKIAA1 LIMMVALVGYNIILLHTHAHVLDAYSQVLFQRPGIWKDLKTMGSVSLSIFFITLLVLGRQ 790 800 810 820 830 840 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 VDVRLRLDYLWAAQAEEERDDMERVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSY . :::.:: . ..::...: .. :. .: :.::::::.::: . .: .::.::: mKIAA1 SEYYCRLDFLWKNKFKKEREEIETMENLNRVLLENVLPAHVAEHFLARSLKNEELYHQSY 850 860 870 880 890 900 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 SQVGVMFASIPNFNDFYIELDGNNMGVECLRLLNEIIADFDELMDKDFYKDLEKIKTIGS . : :::::::.:..:: : : :. :.::::::::::::::.:..: .. .:::::::: mKIAA1 DCVCVMFASIPDFKEFYTESDVNKEGLECLRLLNEIIADFDDLLSKPKFSGVEKIKTIGS 910 920 930 940 950 960 460 470 480 490 500 mKIAA4 TYMAAVGLA--PTA-GTRAKKSISSHLCTLADFAIDMFDVLDEINYQSYNDFVLRVGINV :::::.::. :. .. . :. :...:: . :: :: .:.::: :::::: mKIAA1 TYMAATGLSAVPSQEHAQEPERQYMHIGTMVEFAYALVGKLDAINKHSFNDFKLRVGINH 970 980 990 1000 1010 1020 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 GPVVAGVIGARRPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVQGRIQVTEEVHRLLKRCSYQFVCRGKV :::.::::::..::::::::::::::::::::: .::::::. .:. .: .::: . mKIAA1 GPVIAGVIGAQKPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVLDKIQVTEETSLILQTLGYTCTCRGII 1030 1040 1050 1060 1070 1080 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 SVKGKGEMLTYFLEGRTDGNSSHGRTFRLERRMCPYGRGGGQARRPPLCPAAGPPVRPGL .:::::.. :::.. mKIAA1 NVKGKGDLKTYFVNTEMSRSLSQSNLAS 1090 1100 1110 >>mKIAA0520 ( 1334 res) mbg16592 (1334 aa) initn: 577 init1: 487 opt: 673 Z-score: 633.7 bits: 128.6 E(): 3.7e-30 Smith-Waterman score: 673; 44.203% identity (46.038% ungapped) in 276 aa overlap (312-585:962-1228) 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 LSGLTTSYILVLELSGYTKVGGGALSGRSYEPIMAILLFSCTLALHARQVDVRLRLDYLW : :....:. . . :. .: :: : mKIAA0 DSAQNFSAQRNPCNSSVLQDGRRPASLIGKELILTFFLLLLLVWFLNREFEVSYRLHYHG 940 950 960 970 980 990 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 AAQAEEERDDMERVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSYSQVGVMFASIP ..:. .: .. .. . .: :..: :::... .:. : ..... ::.:::: mKIAA0 DVEADLHRTKIQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQLKVSQT-----YSKNHDSGGVIFASIV 1000 1010 1020 1030 1040 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 NFNDFYIE-LDGNNMGVECLRLLNEIIADFDELMDKDFYKDLEKIKTIGSTYMAAVGLAP ::..:: : .: : :: :.:::.:.:::::..: :...:::::::.::::: :: mKIAA0 NFSEFYEENYEG---GKECYRVLNELIGDFDELLSKPDYNSIEKIKTIGATYMAASGLN- 1050 1060 1070 1080 1090 1100 470 480 490 500 510 mKIAA4 TAGTRAKKSISSHLCTLADFAIDMFDVLDEINYQS-YNDFVLRVGINVGPVVAGVIGARR :: . . :: : .:: .:. :.:..: . . .: ::::.: ::..:::::. . mKIAA0 TAQCQEGGHPQEHLRILFEFAKEMMRVVDDFNNNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTK 1110 1120 1130 1140 1150 1160 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 PQYDIWGNTVNVASRMDSTGVQGRIQVTEEVHRLLKRCSYQFVCRGKVSVKGKGEMLTYF :::::.:::.:::::.:::. ::::.:: .:.:.. .:.: :: :.:::::.: ::. mKIAA0 LLYDIWGDTVNIASRMDTTGVECRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYL 1170 1180 1190 1200 1210 1220 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 LEGRTDGNSSHGRTFRLERRMCPYGRGGGQARRPPLCPAAGPPVRPGLPPAPTSQYLSST ::. mKIAA0 YPKCTDNGVVPQHQLSISPDIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYSDKASLGSDDSTQA 1230 1240 1250 1260 1270 1280 >>mKIAA0511 ( 1150 res) mbg03508 (1150 aa) initn: 972 init1: 479 opt: 481 Z-score: 453.9 bits: 95.1 E(): 3.9e-20 Smith-Waterman score: 948; 34.735% identity (39.256% ungapped) in 547 aa overlap (91-583:591-1128) 70 80 90 100 110 mKIAA4 KRRALRTASEKLRNRSSFSTNVVYTTPGTRVNRYISRLLEARQTELEMADLNFF--TLKY .:. ... : :.. . : : :... mKIAA0 DNPSFPNPRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEALLERESAQVVKKRNTFLLTMRF 570 580 590 600 610 620 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 KHVEREQKYHQLQDEYFTSAVVLALILAALFGLIYLLVIPQ--------SVAVLLLLVFS : : .: ... .: . .. ... .:. : :. .:::... mKIAA0 MDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLFCTAMVEILIDPWLMTNYVTFVVGEVLLLILT 630 640 650 660 670 680 180 190 200 210 220 mKIAA4 ICFLVACTLYLHITRVQCFPGCL--TIQIRTA---LCVFIVVLIYSVAQGCVVGCLPWAW :: ..: .. : . . : :.. : .::.:. : ...:: . mKIAA0 ICSMAAIFPRSFPKKLVAFSSWIDRTRWARNTWAMLAIFILVMANVVD---MLSCLQYYM 690 700 710 720 730 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 SSQSNSSLVVLAAGGRRTVLPALPCESAHHALLCCLVGTLPLAIFLRVSSLPKMILLSGL . . .. . : .: .. : . :.: :..:. :. .. .: :.:..: mKIAA0 GPYNMTAGMELDGGCMEN-----PKYYNYVAVLS-LIATIMLVQVSHMVKLTLMLLVTGA 740 750 760 770 780 790 290 300 310 mKIAA4 TTSYIL---------------------VLELSGYTKVGGGALSGRSYEPI------MAIL .:. : .. : . .. .:.: . :. :... mKIAA0 VTALNLYAWCPVFDEYDHKRFQEKDSPMVALEKMQVLATPGLNGTDRLPLVPSKYSMTVM 800 810 820 830 840 850 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 LFSCTLALH--ARQVDVRLRLDYLWAAQAEEERDDMERVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFL .: :... .:.:. : .:: ....... . ... :. .. :.:: :::.::: mKIAA0 MFVMMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWNEALVTNMLPEHVARHFL 860 870 880 890 900 910 380 390 400 410 420 430 mKIAA4 MSNPRNMDLYYQSYSQVGVMFASIPNFNDFYIELDGNNMGVECLRLLNEIIADFDELMDK :. :. .:: :::...::::::.::: ::: : . :: :.::::.:::::.::: :.:. mKIAA0 GSKKRDEELYSQSYDEIGVMFASLPNFADFYTEESINNGGIECLRFLNEIISDFDSLLDN 920 930 940 950 960 970 440 450 460 470 480 mKIAA4 DFYKDLEKIKTIGSTYMAAVGLAP-------TAGTRAKKSIS---SHLCTLADFAIDMFD .. . :::::::::::: :..: :.... .:: . .:: :::::. : : mKIAA0 PKFRVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFTSSSKEEKSDKERWQHLADLADFALAMKD 980 990 1000 1010 1020 1030 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 VLDEINYQSYNDFVLRVGINVGPVVAGVIGARRPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVQGRIQV .: .:: ::.:.:.::.:.: : :.:::::::.:.::::::::::::::.::::.: ::: mKIAA0 TLTNINNQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTVNVASRMESTGVMGNIQV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 TEEVHRLLKRCSYQFVCRGKVSVKGKGEMLTYFLEGRTDGNSSHGRTFRLERRMCPYGRG .::.. .:.. ...:: :: . ::::::.::.::.:: mKIAA0 VEETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDRPAAFPNGSSVTLPHQVVDNP 1100 1110 1120 1130 1140 1150 610 620 630 640 mKIAA4 GGQARRPPLCPAAGPPVRPGLPPAPTSQYLSSTAAGKEA >>mKIAA4084 ( 626 res) mfj00113 (626 aa) initn: 325 init1: 178 opt: 239 Z-score: 229.4 bits: 52.7 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 362; 32.500% identity (35.616% ungapped) in 240 aa overlap (353-586:392-616) 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 TLALHARQVDVRLRLDYLWAAQAEEERDDMERVKLDNKRILFNLLPAHVAQHFLMSNPRN :. : :. .:...:: ::... . : mKIAA4 GEQFREEYKLTQELEILTDRLQLTLRALEDEKKKTDT--LLYSVLPPSVANELRHKRP-- 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 MDLYYQSYSQVGVMFASIPNFNDFYIELDGNNMGVECLRLLNEIIADFDELMDKDFYKDL . . :..: ..:..: .:: : . ... ... . :::.. . :: : :. . mKIAA4 --VPAKRYDNVTILFSGIVGFNAFCSKHASGEGAMKIVNLLNDLYTRFDTLTDSRKNPFV 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 EKIKTIGSTYMAAVGLAPTAGTRAKKSISSHLCTLADFAIDMFDVLDEINYQSYNDFVLR :..:.:. ::.. :: : . .:: : :: .::... ... .. .. . mKIAA4 YKVETVGDKYMTVSGL-PEPCIHHARSI----CHLA---LDMMEIAGQVQVDG-ESVQIT 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 mKIAA4 VGINVGPVVAGVIGARRPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVQGRIQVTEEVHRLL--KRCS-- .::..: ::.:::: : :.: ..:::::..:: ..:: .:.:.:.: ..: : . : mKIAA4 IGIHTGEVVTGVIGQRMPRYCLFGNTVNLTSRTETTGEKGKINVSEYTYRCLMSPENSDP 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 -YQFVCRGKVSVKGKGE-MLTYFLEGRTDGNSSHGRTFRLERRMCPYGRGGGQARRPPLC ... :: ::.::: : : ..:: .. :. mKIAA4 LFHLEHRGPVSMKGKKEPMQVWFLSRKNTGTEETNEEDEN 590 600 610 620 645 residues in 1 query sequences 1768372 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 11:00:57 2006 done: Mon Mar 27 11:00:58 2006 Scan time: 0.760 Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]