FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1509.ptfa, 1178 aa vs ./tmplib.26680 library 1767839 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9385+/-0.00802; mu= -1.0026+/- 0.528 mean_var=484.0154+/-117.465, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0583 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1212 ( 826 res) mpm06082 ( 826) 1578 148 6.3e-36 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 274 38 0.008 >>mKIAA1212 ( 826 res) mpm06082 (826 aa) initn: 1464 init1: 1345 opt: 1578 Z-score: 737.4 bits: 147.9 E(): 6.3e-36 Smith-Waterman score: 1605; 40.986% identity (45.207% ungapped) in 771 aa overlap (128-850:12-758) 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 SELDKLSQELEKVGLSKDLLLQEDDGHGDGKGKTESALKTTLAMKEEKIVFLEAQVEEKE ..: ::.:: .: .:::::. :::..::. mKIAA1 VNPLRNRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEEST 10 20 30 40 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 SLSRQLQIELQMIKKEHEQLRQTQEGGDKAQNALKRPPGKVTSHQEKEAWEPSHKEATME . ..::. ::. .::..: :.: :. .:... : :.....: : .::: : mKIAA1 NYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSI--P---VSGEDDK--WGRESQEATRE 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 LLRVKDRAIELERSNAALQAERQLLKEQLQHLETQNVSFSSQILTLQKQSAFLQEHTTTL ::.:::: ::.::.::.::::.: :: ::..::::: ....:::.::.:.. :::..::: mKIAA1 LLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTL 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 QTQTAKLQVENSTLSSQNAALSAQYTVLQSQQAAKEAEHEGLQQQQEQLAAVYEALLQDH :::.::::::::::.::...: : . : ::.. : :.:......:.: ..:.::..:: mKIAA1 QTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDH 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 KHLGTLYECQSSEYEALIRQHSCLKTLHRNLELEHKELGERHGDLQQRKAELEELEKVLS ..: :.: :.::::.:: .:. ::. :.:::.:::.: .:...: ..:..::.:::... mKIAA1 EKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIK 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 TEREALEREQKTNAIATSENQRLRGELDRISFLHQQLKGEYEELHAHTKELKTSLNNSQL ::.: . :.:.. ...:: ..: :: ::... ..:: : : :. :.::. ::::.: mKIAA1 TEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKETEILQMDHKNLKSVLNNSKL 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ELSRWQVRFDELKEQHQSMDISLTKMDNHCELLSRLKGNLEEENHHLLSQIQLLSQQNQM : .: ...:..::::.:..::. ::..:.:::::.:::::::::.:::.::: : ::. mKIAA1 EQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRT 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 LLEQNMESKEQYHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMDQYKFYDPAP-KKKNHWIGAKA :::::::::. .: ::.::::::: :::.:::::::::::::::::.: .....:: : mKIAA1 LLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLK- 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 LVKLIKPKKEGSRERLKSTTDSPPWQLEPSDPASPSPSQALRSQTENPDNPPSGPNCVEE . :::: ::. .::: :: : .: . . :. : : .. :. : : .:. mKIAA1 MRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPT-RSDSSEGFLQLPHQ------DSQDSSSVGSNSLED 460 470 480 490 500 640 650 660 670 680 mKIAA1 RDTHNGPVGKAFQRKKSPFLRSKSKDKDK------SPLVHPALSKRLRF----WSSS--- .: . .. :. ::::.. ::::: . : . . . :..: mKIAA1 GQTLGTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTEN 510 520 530 540 550 560 690 700 710 720 mKIAA1 -DIP-------------------SSPNESTPIPKHLGRTKG-CNSDDNLCEPSSEPDG-- ..: .. : :: . :.: :. :. . :.: mKIAA1 LEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGIS 570 580 590 600 610 620 730 740 750 760 770 mKIAA1 ----PYHRQQASRPNSLESSRNASSNSSPLSLKGSSDHLHSRCESFS-SADLIPSRDPA- : :::: ::.:.:...:::. ..: ... .:.: :.:.. . :. mKIAA1 DDSSTGSRVYASRPASLDSGRTSTSNSNN---NASLHEVKEVMKSLSVSSDFLGKDKPVS 630 640 650 660 670 680 780 790 800 810 820 mKIAA1 -TLSR--DGNTSGRGLLGRHEYPPP--RNGPVSQETIQKKGAASTHTGVRPHSASPSSEM ::.: .:.: : . :. : :.:: :.: . : . .. .: .. .. mKIAA1 CTLARSVSGKTPG-DFYDRRTTKPEFLRTGP--QKT---EDAYTISSAGKPTPSTQGKIK 690 700 710 720 730 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 VTLEEFLEESNRGGSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKAHDPPALGGQPGPPARKDGAKMPTSF .. : . .... ..: : mKIAA1 LVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTA 740 750 760 770 780 790 >>mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174 aa) initn: 86 init1: 76 opt: 274 Z-score: 143.1 bits: 38.5 E(): 0.008 Smith-Waterman score: 340; 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