FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA3021.ptfa, 756 aa vs ./tmplib.26680 library 1768261 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7473+/-0.00417; mu= 15.8197+/- 0.279 mean_var=81.8595+/-18.749, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1418 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0986 ( 921 res) mbp09156 ( 921) 2445 510 3.4e-145 mKIAA0532 ( 1603 res) mbg05668 (1603) 309 74 1.6e-13 mKIAA0453 ( 1918 res) mbg01969 (1918) 305 73 3.1e-13 >>mKIAA0986 ( 921 res) mbp09156 (921 aa) initn: 2187 init1: 1447 opt: 2445 Z-score: 2699.1 bits: 510.4 E(): 3.4e-145 Smith-Waterman score: 2445; 50.066% identity (51.701% ungapped) in 759 aa overlap (2-749:170-915) 10 20 30 mKIAA3 PVANKSSLDLEVGEIASDGSIPTNKWHYVAS . :::. . :.: .:: :: . mKIAA0 GLKMEYQVGVTINLSSFNITRIVTFIPFYMIKNKSKYHISVAEEGSD------KWLSLDL 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 mKIAA3 SECIPFWPENLSGKLCVGVVGYEGSSKPFFYNRQDNGTLLSLEDLNGGILVDINTAEHST . ::::::: :. : . : : : ...:.::: :: :.. :::....: ::::: mKIAA0 EQSIPFWPENASNILLIQVERSEDPPKRIYFNKQDNCILLRLNNELGGIIAEVNLAEHST 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 mKIAA3 VITFSDYHEGSAPALIMNHTQWDVLTYKQSGSQE-ELVLLPGETRLFAWADPTGIRKLTW ::::::::.:.: :..:::. : . :.::. : : : ::.. ..::::.: ::: : mKIAA0 VITFSDYHDGAATFLLINHTKSDPVQYNQSSLGEIEDSLPPGKAVYYTWADPVGSRKLKW 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 mKIAA3 NYAANFGEHDLLKDECGQFPYDANIQ-IHWVSFLDGRQRVLLFTDDVALVSKALQAEEME . . ..:: ::. . : ... . :. :::..: ::..:::.: . . . ..:. : mKIAA0 SCGQSYGEVTH-KDDM-MTPISVGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPRVFKVTYESEKAE 320 330 340 350 360 370 210 220 230 240 250 260 mKIAA3 QADHEVALSLHSLGLSLVNNENKQEVSYVGITSSGVVWEMKPKQK--WKPFSQKQIMSLE :. ::.:.:...:.::::: .::::.:.::::: :::: :::.: :::.: :. .:: mKIAA0 LAELEVVLALQDVGISLVNNYTKQEVAYIGITSSDVVWEAKPKKKARWKPMSVKHTEKLE 380 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 mKIAA3 QA---YSKRLASQDRGWVKLDSNFEVNFDKVPMEMRL--PIRCPIKRDFLSGIQVEFKQS . :.. .:. :.:: :. : . .:.. : :..:..: ...::.. : mKIAA0 KEFREYTEASPLEDK-VVELD-NIPVRLTPSGNDMKILQPHVIPVRRNYLPALKVEYNTS 440 450 460 470 480 330 340 350 360 370 380 mKIAA3 PHQRSLRARLYWLQVDNQLPGTMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVITRFNEYSK :: :.: ..: .:..::. :..:: ::.:. ::.:...:: :::: :::.. : .:. mKIAA0 AHQSSFRIQIYRIQIQNQIHGAIFPFVFYPIKPPRSVTMDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQ 490 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 440 mKIAA3 VLQFKYFMVLIQEMALKVDQGFLGAVISLFTPTTDPEAERKRTKLIQQDIDALNTELMES . ..::: :::::: :..: ::. :. .: : . .:. ... ...:..:.. : mKIAA0 ISRIKYFKVLIQEMDLSLDLGFVYALADLVTKAE--VTEKTEVEHFHKDVEAFEQEYEVV 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 mKIAA3 SMTDMSILSFFEHFHISPVKLHLSLSLGSGGEESDKEKQE--MIAIHSVNLLLKSIGATL : .:.: ...::.:::::.:::::.::.:: .:. .:. .: .::.::::::::::: mKIAA0 SSVDQSQVNLFEYFHISPIKLHLSVSLSSGRDEAKDSEQHGGLIPVHSLNLLLKSIGATL 610 620 630 640 650 660 510 520 530 540 550 560 mKIAA3 TDVDDLIFKLAYYEIRYQFYKRDQLMWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPFGLIRG :::.:..::::..:. :::. ..:. :.::::.: .::::::.:::::::::::::: mKIAA0 TDVQDVVFKLAFFELNYQFHTTSELQSEVIRHYSKQAIKQMYVLILGLDVLGNPFGLIRE 670 680 690 700 710 720 570 580 590 600 610 620 mKIAA3 LSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLVGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAI .::::::.::::.:::.::::::.::...:...::: .::: ::..:.::....::.::. mKIAA0 FSEGVEAFFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGLKALVGGAVGGLAGAASKITSAMAKGVAAM 730 740 750 760 770 780 630 640 650 660 670 680 mKIAA3 TMDKEYQQKRREEMGRQPKDFGDSLARGGKGFLRGVVGGVTGIITKPVEGAKKEGAAGFF :::..::::::: :..:: . ....:::::.. : :.:.:::.:::..::.:::::::: mKIAA0 TMDEDYQQKRREAMNKQPAGLREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFF 790 800 810 820 830 840 690 700 710 720 730 740 mKIAA3 KGIGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIQRVAESTEEVSSLRPPRLIHEDGIIRPYDRQ ::.::::::::.:::::::::::::::::.:..:..: : ::::::...:::.:::: . mKIAA0 KGVGKGLVGAVTRPTGGIIDMASSTFQGIKRATETSE-VESLRPPRFFNEDGVIRPYRLR 850 860 870 880 890 900 750 mKIAA3 ESEGSDLLEQEMGTQE .. :...:. mKIAA0 DGSGNQMLQASKSLI 910 920 >>mKIAA0532 ( 1603 res) mbg05668 (1603 aa) initn: 330 init1: 165 opt: 309 Z-score: 335.3 bits: 73.8 E(): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 369; 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