FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0911.ptfa, 1035 aa vs ./tmplib.26680 library 1767982 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8029+/-0.00559; mu= 10.1796+/- 0.371 mean_var=215.1643+/-50.619, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0874 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0726 ( 959 res) mbh00847 ( 959) 3191 416 1.2e-116 mKIAA4134 ( 1021 res) mfj12267 (1021) 2245 297 1e-80 >>mKIAA0726 ( 959 res) mbh00847 (959 aa) initn: 3108 init1: 1667 opt: 3191 Z-score: 2186.6 bits: 416.1 E(): 1.2e-116 Smith-Waterman score: 3416; 52.904% identity (54.457% ungapped) in 947 aa overlap (79-1005:9-948) 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 ATPCCFRVGPAVAPRARAMLRRPAPALAPAVRLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTY : ::::.:: .. . ..::::::.: : mKIAA0 HRTMTLLLVSLLLASLLQISS--GNKANKHKPWIEAEY 10 20 30 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 HGIVTENDNTVLLDPPLIALDKDSPLRFAGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGIIRS .::: ::::::::.:::.:::::.:::.:::::::..::..:::.::..::.::::.::. mKIAA0 QGIVMENDNTVLLNPPLFALDKDAPLRYAGEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRA 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 KEKLDCELQKDYTFTIQAYDCGKGPDGTGVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKAA :: .::: ::..::::::::::.:::::..:::::::::..::::::.:::: :. :.:: mKIAA0 KEPVDCEAQKEHTFTIQAYDCGEGPDGTNTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAA 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 VVEGKQHSSILRVEAVDADCSPQFSQICSYEILTPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQ :.::: .. ::::::.:.:::::.:::: ::::::..:: .:.:: :.:::::.:. :. mKIAA0 VTEGKLYDRILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGEKL 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 YKLTVTAYDCGKKRATEDVLVKISVKPTCSPGWQGWSSRIEYEPGTGALAVFPSIHLETC ::.::::::::::::..:. :.:.:::::.:.::::..:::: ::.:.::.::.:.:::: mKIAA0 YKFTVTAYDCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETC 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 DEPVASVQATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTSELLPSPSSSFNWTVGLP :::. ..:::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: .::: :. . :::.:: mKIAA0 DEPLWNIQATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLS 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 mKIAA0 TDNGHDSDQVFEFNGTQAVRIP-DGVVTL--DPK----EPFTISVWMRHG--PF-GRKKE . ..::. .. :::::::..: : . : :. . ::.: ::.:. : :.:.: mKIAA0 VHYSQDSSLIYWFNGTQAVQVPLGGPAGLGSGPQDGFSDHFTLSFWMKHSVTPSKGKKEE 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 -TILCSSDKTDMNRHHYSLYVHGCRLVFLLRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEDWHHF ::.:.. ... . :::: :::::..:: : :. ::..: :::.::::..:::. mKIAA0 ETIVCNTVQNEDGYSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHY 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 VLNVEVPSVTLYVDGIPHEPFSVTEDYPLHPTKIETQLVVGACWQEYSGVES-GNETEPA .::.: :.::::.::: .: . .. .:: . : :..:::: : .. :. :.:. . mKIAA0 ALNLEFPTVTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKKGGEN--S 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 TMASAGGDLHMTQFFRGNLAGLTVRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVPEDANRGVQIQ : ...: : . ..:.: :::..::::.: ...::.:::.:.:::: . :. ..:.... mKIAA0 TDTASGDPLLIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVH 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 ASSSQAVLTLEGDNVGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTVKCFNEAACIEVPP .. ::..::::::.: ...:.::..:.:. .: :::.: :..:..::::.: .:. .: mKIAA0 VNPSQSLLTLEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPE 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VEGYVMVLQPEEPKISLSGVHHFARAASEFESAEGISLFPELRIISTITREVEPEADGSE :::::.::::. :.: :::. :::: : .::. ::. :::.:.: .:...:: .:: : mKIAA0 VEGYVVVLQPDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGPEGVPLFPDLQITCSISHQVEAKADESW 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 DPTVQESLVSEEIVHDLDTCEVTVEGDELNAEQESLEVDVTRLQQKGIEASHSDLGVVFT . :: .. .:.::::.:: ::... ::.:. :.::: .:.. :::.:.: .... .... mKIAA0 QGTVTDTRMSDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDMASLQQRGLELTNTSAYLTIA 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 GVETMASYEEVLHLLRYRNWHTRSLLDRKFKLICSELNGRYLSNEFKVEVNVIHTANPVE ::::.. :::.:. ::. : .: :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : : mKIAA0 GVETITVYEEILRQARYQLRHGAALYARKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVA 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 HANHMAAQPQFVHPEHRSFVDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVF : .:. .. ::.: :. ...::.::. : ..:::.::..:::::.:::.:.:::. mKIAA0 HPSHVLSSQQFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHRNSMVPSAATLIIVVCVGFLVLMVILGLV 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 mKIAA0 RIRAAHQR-TMRDQDTG-----KENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEE--EEE ::.. :.: . .: :. .. :::::::: :::::.:..:.. ..: mKIAA0 RIHSLHRRVSGTGGPSGASTDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNQQTCVAGVAGGQQE 880 890 900 910 920 930 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 EEESEDGEEEEDITSAESESSEEEEGGPGDGQNATRQLEWDDSTLSY ::.: :.: .. .: : mKIAA0 EEDSSDSEAADSPSSDERRIIESPPHRY 940 950 >>mKIAA4134 ( 1021 res) mfj12267 (1021 aa) initn: 3441 init1: 2053 opt: 2245 Z-score: 1541.4 bits: 296.8 E(): 1e-80 Smith-Waterman score: 3628; 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