FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA4026.ptfa, 986 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768031 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8528+/-0.00833; mu= -8.7718+/- 0.549
 mean_var=531.7398+/-125.338, 0's: 0 Z-trim: 50  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0556

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA0204  ( 1307 res)   mbg01039                       (1307 aa)
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                                      10         20        30      
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                                     :.: :. .: . ..:.: :::.:..:.. :
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mKIAA4 KRKSREYEHVRRDLDPNDVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGALAAAKVIETKSEEELE
       :.: ..::::.:::.:.. :::.::::::::::::::.::::..:::::::.::::::::
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       ::.:::.:::.:::: ::::: :.::...:::.:::: ::::::.::::.: ::: ::::
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       ::.: :::::.:: ..::::::::::.:.::.:::.:::::::::: .:.:.::::::::
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       ::::::::.::: :: :::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
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       :  ::::: .:.:::.  :.:: ..: ...::::::::. : ::: .:::.::::::: :
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       :.:::.:. :::.: .:.:  .:.  .:    :.  . .:.                   
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          :::.:... :   :                                        :: 
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       .: :. :                  :  : .:                            
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                   ::.:     : :: .  :..:   .  . . :   :      ...:  
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        .:. :.                :: .:. ...                           
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              ::    :  : :..  :.: :.:.   . ..  ..:.  :    :.:  : ..
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        :    : :   .: .. :: :  : : . :.:. ::  :..::.::. .. ..::::.:
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       :.:.:::::::.:::::......: ::.::::::::::::::::::.: : ::..: . :
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        ::. .:::::. .::. :: :.::::.:::: .:..::.:. : ..:::::. ::... 
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       .:::. ::. :::                               ...:: ::...:. ..
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       .:.  ... :. . ::.::..::.:.: ::::.::.::..:::.:::.:::::::::.::
mKIAA0 KKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRAREAAIWELEERHLQEKHQLLKQQLKDQYFMQR
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       :.::..:::: :::::::::..:.:: :: ::.:::::::::..::::::.::::.::..
mKIAA0 HQLLKRHEKETEQMQRYNQRLIEELKNRQTQERARLPKIQRSEAKTRMAMFKKSLRINST
      1110      1120      1130      1140      1150      1160       

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       .. ...:::::::. ::::::: ::. :.::::.::::.  :::.:. ::.:::::::::
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       :::::::::: ::: :.: :::::.:::::::.:::.. .: .:::.:::.. :.:   :
mKIAA0 LVEHETQKLKELDEEHSQELKEWREKLRPRKKTLEEEFARKLQEQEVFFKMTGESECLNP
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mKIAA4 TTPSKASNFFPYSSGDAS  
       .. :. :.:.:         
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      1290      1300       

>>mKIAA0881  ( 1070 res)   mpm03231                       (1070 aa)
 initn: 629 init1: 154 opt: 807  Z-score: 370.9  bits: 80.2 E(): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 893;  26.157% identity (30.037% ungapped) in 929 aa overlap (51-965:38-860)

               30        40        50        60        70        80
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                                     ::. ..  . :.: :.:: :: :.. ... 
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mKIAA4 LAAAKVIE---TKSEEELEDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGA
       ..: : .     .:.:. .: : :...:    ::  ..  : :  .   :...:.: :.:
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        :  .::. .  : : .: .: .  :..: .::.. .::::.::::.:..  : ..:.::
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       : ..     .   .::.::::::::::.:  .: .. :: :.:.:::::: ::.:. .::
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         ..: : .: .::... :.: . ..::  ::.:.   :.: :. ::..  ::.: :: :
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            .. .:. ..:                    :::  : :         :    .. 
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mKIAA4 LLQDSSTPLPPSQPQEPVNGPCSQPSGDGPLQTTSPADGLSKNDNDLKVPVPLRKSRPLS
       :.:.. .      :.:    :::: .   :   :  :  :.. ... .::        .:
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       ..:  : .  ... : ..:      . .. ..        :  : :.   . ..    ..
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        :::   :    :  :... :    . ...   :.  ..  .  .:. . ..  :.:   
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       .     .: :....:.. .. :.   ::.: :   . ........   : :. . . :. 
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         :...:..:..  . .: :.: :...   ::           ::.  . :.     :::
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       .. : :.:::. .  :..:   . :::..:....:. .  .:   ... .:::.:.  . 
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       .. .   ::.    : .: . :...:  :..   .. ...:..     ::  ::   :. 
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mKIAA4 HDLLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQ-RSDGKTRMAMYKKSLHING
         :::.::  ::   :  : .        :. .:.: ..: ...  ... . :.  .   
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mKIAA4 AGSASEQREKIKQFSQQEE--KRQKAERLQQQQKHENQMRDMVAQCESNMSELQQLQNEK
          :.. :.. :.....:   :.:  :  . : .. . .:  . .   . .. . :.  :
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            :..:.::  : :...::..:  ..     .::. : .:. . : .  .:..: : 
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>>mKIAA4182  ( 225 res)   mfj42218                        (225 aa)
 initn: 552 init1: 297 opt: 603  Z-score: 289.8  bits: 63.0 E(): 5.3e-11
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        .. :    . : :: .:::. :.::.:::....::::.:. :::. .::...:.:::  
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       :.     .::....:::::::::::   : :   :  :.:::::::  :::.. :::. .
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        ::.:.:  :: .  : : .: : :  :::::.  :. . : : :: .::::::.. .  
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        ..:  :.  :: :.:.                                           
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>>mKIAA1142  ( 597 res)   mph00410                        (597 aa)
 initn: 525 init1: 267 opt: 605  Z-score: 286.1  bits: 63.7 E(): 8.6e-11
Smith-Waterman score: 608;  33.119% identity (35.517% ungapped) in 311 aa overlap (6-316:291-580)

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mKIAA1 SPGVLGPHASEPQLAPPARALAAPAVPPAPGPPGPRS-PQREPQRVSHEQFRAALQL---
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mKIAA1 ----------VVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRR
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mKIAA4 EDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAVDAIMLELDRGLTEPQIQ
       :  . :. :.    :  .:.. ..:    .::...::  :::.  :. .    ..: :: 
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       .::  .:.::  ::.. .::::.:. ..:.: .: ..:.:::  :.  : . .: :..::
mKIAA1 AVCLAVLQALAVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGT
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       :::::::..     .  ::  ..::::::. .:::.. :::. .  :....  :  . ::
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        : .  : :  .. ::   : ..:  : .::.::.:::....                  
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mKIAA4 EEIEDGREDGEEEDAVDAVPPLVNHTQDSANVTQPSLDSNKLLQDSSTPLPPSQPQEPVN

>>mKIAA0213  ( 1502 res)   mbg05341                       (1502 aa)
 initn: 269 init1: 157 opt: 489  Z-score: 231.4  bits: 54.9 E(): 9.5e-08
Smith-Waterman score: 489;  33.212% identity (35.271% ungapped) in 274 aa overlap (56-321:1237-1502)

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mKIAA0 RRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMK
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mKIAA4 VIETKSEEE--LEDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAVDAIML
        :. . ...  ...   :..:.    :: .:. .:.  .  ...:..:.:  :...    
mKIAA0 EIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLE----
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mKIAA4 ELDR-GLTEPQIQVVCRQMLEALNFLHGKRIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAK-
       :..: :: :  :..  .:.  :.: :: . :.:::.:..:...:  : :.:.::: :.: 
mKIAA0 EVSRLGLQEHVIRLYTKQITVAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKL
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mKIAA4 --NLKTLQ-KRDSFIGTPYWMAPEVVLCETMKDAPYDYKADIWSLGITLIEMAQIEPPHH
         : .:.  . .: .::  .:::::.     :   .   ::::::: ..:::.  . : :
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mKIAA4 EL-NPMRVLLKIAKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKIALDKNPETRPSAAQLLQHPFVSRV
       :  . .... :.. .  : .  : . : : . ::.  :...:. : .:.:::.: ::.  
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mKIAA4 TSNKALRELVAEAKAEVMEEIEDGREDGEEEDAVDAVPPLVNHTQDSANVTQPSLDSNKL
       :...                                                        
mKIAA0 TDEE                                                        
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                                     :  .. :..:  . ..   .: : .::   
mKIAA1 LRARSVRSTEPGAAAVMSEDSSALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKER--
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mKIAA4 LAAAKVIETKSEEELEDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAV-D
       .:  ..   : .  ... . ::. .. : :: ::.   ..    .::.....  ::.: :
mKIAA1 VAIKRINLEKCQTSMDELLKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKLLSGGSVLD
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mKIAA4 AIMLELDRG------LTEPQIQVVCRQMLEALNFLHGKRIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRL
        :   . .:      : :: : .. :..::.:..:: .  ::::.::::.:. .     :
mKIAA1 IIKHIVAKGEHKSGVLDEPTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGF-----L
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mKIAA4 ADFGVSAKNLKTLQKRDSFIGTPYWMAPEVVLCETMKDAPYDYKADIWSLGITLIEMAQI
       :  :  ..:    . : .:.::: ::::::.  : ..   ::.::::::.::: ::.:  
mKIAA1 ATGGDITRN----KVRKTFVGTPCWMAPEVM--EQVRG--YDFKADIWSFGITAIELATG
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mKIAA4 EPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPTLLTP-------SKWSVEFRDFLKIALDKNPETRPSAA
         :.:.  ::.::.   ..:::.: :        .:..  :: .... :.:.:: ::.::
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mKIAA4 QLLQHPFVSRVTSNKALRE-------LVAEAKAEV---------MEEIEDG-------RE
       .::.: : ... ... :.:        ..: . .:         ... :::       . 
mKIAA1 ELLRHKFFQKAKNKEFLQEKILQRAPTISERSKKVRRVPGSSGRLHKTEDGGWEWSDDEF
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mKIAA4 DGEEEDAVDAVP----PLVNHTQDSANVTQPSLDSNKLLQ---DSSTPLPPSQPQEPVNG
       : : :..  :.     : :. . .:...   .   . :::   . :. ::    : :.. 
mKIAA1 DEESEEGRAAISQLRSPRVKDSLSSSELFAAAEPMGTLLQVPEQISAHLPQPAGQMPTQ-
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mKIAA4 PCSQPSGDGPLQTTSPADGLSKND--NDLKVPVPL----RKSRPLSMDARIQMDEEKQIP
       : .: :   : . ..::.. :...  .. :.:. :    :.:.    : :...       
mKIAA1 P-AQVSLLPPAEPAKPAQAQSSGERSQETKIPISLVLRLRNSKKELNDIRFEFTPGRDTA
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mKIAA4 DQDENPSPAASKSQKANQSRPNSSALETLGGEALTNGGLELPSSVTPSHSKRASDCSNLS
                                                                   
mKIAA1 EGVSQELISAGLVDGRDLVIVAANLQKIVEEPQSNRSVTFKLASGVEGSDIPDDGKLIGF
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>>mKIAA1901  ( 1234 res)   mpg03874                       (1234 aa)
 initn: 386 init1: 183 opt: 480  Z-score: 228.5  bits: 54.1 E(): 1.4e-07
Smith-Waterman score: 507;  22.008% identity (24.534% ungapped) in 777 aa overlap (61-801:12-744)

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mKIAA4 RLSTFEKRKSREYEHVRRDLDPNDVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGALAAAKVIETK
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mKIAA1                    EGTMEKYVRLQKIGEGSFGKAVLVKSTEDGRHYVIKEINIS
                                  10        20        30        40 

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mKIAA4 --SEEELEDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAV-DAIMLELDR
         :..: ..   :. .::.  :: ::.   ..  .:.:.:....: :: .   :  .   
mKIAA1 RMSDKERQESRREVAVLANMKHPNIVQYKESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGA
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mKIAA4 GLTEPQIQVVCRQMLEALNFLHGKRIIHRDLKAGNVLMTLEGDIRLADFGVSAKNLKTLQ
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mKIAA1 LFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVE
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mKIAA4 KRDSFIGTPYWMAPEVVLCETMKDAPYDYKADIWSLGITLIEMAQIEPPHHELNPMRVLL
          . :::::...::.  ::   . ::. :.:::.:: .: :.  ..   .  :   ..:
mKIAA1 LARTCIGTPYYLSPEI--CE---NKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGNMKNLVL
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mKIAA4 KI-AKSDPPTLLTPSKWSVEFRDFLKIALDKNPETRPSAAQLLQHPFVSRVTSNKALREL
       :: . : ::  ..: ..: ..:..:.  . .::. :::. ..:.. :...   .    .:
mKIAA1 KIISGSFPP--VSP-HYSYDLRSLLSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
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mKIAA4 VAE-----AKAEVMEEIEDGREDGEEEDAVDAVPPLVNHTQDSANVTQP----SLDSNKL
       .::     . ..   .   :.. .  . .:..  :  . :. .:.   :    .  ..::
mKIAA1 IAEEFCLKTLSKFGPQPLPGKRPASGQ-GVSSFVPAQKITKPAAKYGVPLTYKKYGDKKL
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mKIAA4 LQDSSTPLPPSQPQEPVNGPCSQPSGDGPLQTTSPADGLSKNDNDLKVPVPLRKSRPLSM
       :. .  :   .  : ::.   .. ::.   . .  :    .    :.     .:..    
mKIAA1 LEKKPPPKHKQAHQIPVK---KMNSGEERKKMSEEAAKKRR----LEFIEKEKKQKD---
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mKIAA4 DARIQMDEEKQIPDQDENPSPAASKSQKANQSRPNS--SALETLGGEALTNGGLELPSSV
         .:.. . .:.  :...      . .. :..: ..  ..:.. :.  .  . . . ..:
mKIAA1 --QIRFLKAEQMKRQEKQ------RLERINRAREQGWRNVLRAGGSGEVKASFFGIGGAV
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mKIAA4 TPSHSKRASDCSNLSTSESMDYGTSLSADLSLNKETGSLSLKGSKLHNKTLKRTRRFVVD
       .::       ::  .  :   : . ..    :  : .    ::. .... : . ..    
mKIAA1 SPS------PCSPRGQYEH--YHAIFDQMQRLRAEDNEARWKGG-IYGRWLPERQK----
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mKIAA4 GVEVSITTSKIISE-DEKKDEEMRFLRRQE-----LRELRLL---QKEEHRNQTQLSSKH
       : ....  .. . :  ..: : :.   : :     :..:  :   .    :.    ....
mKIAA1 G-HLAVERANQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHVGLLQNLASLYGGRPSSSRGGKPRNNEE
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mKIAA4 ELQLEQMHKRFEQEINAKKKFY-DVELENLERQ-QKQQVEKMEQDHSVRRKEEAKRIRLE
       :. : ....   :..: ....   .. :: : .  : :    : :  ... :    .. .
mKIAA1 EVYLARLRQIRLQNFNERQQIKAKLRGENKEADGTKGQEATEETDMRLKKMES---LKAQ
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mKIAA4 QDRDYAKFQEQLKQMKKEVKSEVEKLPRQQRKESMKQK--------MEEHSQKKQRLDRD
        .   : ..:::.. .::.  . .:. ...    .:..        .:  .. ...  . 
mKIAA1 TNARAAVLKEQLERKRKEAYEREKKVWEEHLVARVKSSDVPLPLELLETGGSPSKQQVKP
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mKIAA4 FVAKQKEDLELAMRKLTTENRREICDKERDCLSKKQELLRDREAALWEMEEHQLQERHQL
        ..  .   :...    :....:  .:  . .:.:.:.::  .  :  .:... ...:. 
mKIAA1 VISVTSALKEVGLDGSLTDTQEEEMEKSNSAISSKREILRRLNENLKAQEDEKEKQHHSG
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mKIAA4 VKQQL--KDQYFLQRHDLLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSDGK
         . .  ::.   . .. . . .:. :.                                
mKIAA1 SCETVGHKDEREYETENAISSDRKKWEMGGQLVIPLDAVTLDTSFSATEKHTVGEVIKLD
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>>mKIAA1995  ( 1005 res)   meh01075                       (1005 aa)
 initn: 349 init1: 147 opt: 458  Z-score: 219.9  bits: 52.2 E(): 4.2e-07
Smith-Waterman score: 458;  30.855% identity (32.046% ungapped) in 269 aa overlap (62-327:79-340)

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mKIAA4 LSTFEKRKSREYEHVRRDLDPNDVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGALAAAKVIE-TK
                                     :: ::::..   .  :  .:.. : .. :.
mKIAA1 SGPGPSAVPGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR
       50        60        70        80        90       100        

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mKIAA4 -SEEELEDYIVEIEILATCDHPYIVKLLGAYYYDGKLWIMIEFCPGGAV-DAIMLELDRG
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]