FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0738.ptfa, 952 aa vs ./tmplib.26680 library 1768065 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6680+/-0.00395; mu= 22.8456+/- 0.266 mean_var=70.9755+/-15.920, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 6 in 1/35 Lambda= 0.1522 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00264 ( 994 res) mfj20268 ( 994) 3837 853 0 >>mFLJ00264 ( 994 res) mfj20268 (994 aa) initn: 4045 init1: 3446 opt: 3837 Z-score: 4547.3 bits: 852.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 3837; 60.390% identity (60.784% ungapped) in 924 aa overlap (27-948:72-991) 10 20 30 40 50 mKIAA0 SFFPLGSFLLCCCASESALQGTATQKTNRTMAT-PSAAFEALMNGVTSWDIPEDSV :.::::: :.::::::::::::::.:.. . mFLJ00 VRALRRRWEEILKVPEGYWTPFPTVYLLTATGRTMATTPDAAFEALMNGVTSWDLPKEFT 50 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 PCELLLIGEASFPIMVNDVGQVLVAASSYGRGRMVVASHEDFLLESQLFVFLVNAVGWLR : ::::::::.::.:::: ::::.:.: ::.::.::.:::..:... : ::.:::.:: mFLJ00 PSELLLIGEAAFPVMVNDKGQVLIAVSFYGQGRLVVVSHESYLMHAGLAPFLLNAVSWLC 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 SSPNSAIGVHSSLAPLVKILESCGIESKIEPEVNDSLGVYCIDAYNETMTDKLVQFVKRG ::.. : :::::: ::.::.. ::.. ..:: ...::::::::::.:.: ::::::::: mFLJ00 PSPGTPIEVHSSLASLVNILRGSGINALVQPEPGEALGVYCIDAYNDTLTKKLVQFVKRG 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 GGLLIGGEAWDWDTQGDDDRVLFAFPGNLVTSVAGVYFTDNKADTSFFKVSKKMPKIPIL :::::::.::.: .: .:.:::.:::: ::::::::::: .: . ::::::.::::. mFLJ00 GGLLIGGQAWNWASQHGSDKVLFSFPGNKVTSVAGVYFTDVYGDINRFKVSKKIPKIPLY 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 VRCDDDLSDDRDELLRGIIDLDITNSDCFPSQLLVHGSLAFPLGLD-TYHGCVIAAARYG .:: ..: :.:.:: :: ::. .. ::::::::::::::::: .. .: .:::.:: mFLJ00 IRCWEELRHDQDQLLDGISMLDVRTGGV-PSQLLVHGSLAFPLGLDNSFLSCFLAAAHYG 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 RGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRKGKIVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIE :::::...:.... . :. ::::::.:::. :.. .: :.:.:..:..:: :. :.: mFLJ00 RGRVVLAAHEAMLCAPKMEPFLLNAIRWLSRGQEDNIGVNTRLKNLNSLLLKHGLKCSLE 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 PHLTSDASVYCFEPTSDVGVKELQEFVAEGGGLFVGTQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLL :::.: ::: :: .:..::::::::::..: :.:::: .::: : :. ::::.. mFLJ00 SHLTDDMCVYCCAAYSDQEAKKIQEFVAEGGGLLIGGQSWWWASQNPGSSALGSFPGNVI 410 420 430 440 450 460 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 LNAFGISITSQSLNPGPFRTPKIGTRTYHFRSTLAEFQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDG ::.::.:: ....:: : .: :.::::..:.:::.....:.::.:: . .::: :: mFLJ00 LNTFGLSILPRTVSPGCFPILHIDIRNYHFRGALSEFQAMLNHKEGNLEKRYSGKLGVDG 470 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 ATFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATRENPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGS : ::::::. .:::.::::.:::.: . ::.... ::: . ..:.:.::: :::::: mFLJ00 AGFLQIPAQGVPAYLSVHRILRKILRQAGLPAVSKSNPVSSHSYEAAILQLATELAHSGS 530 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 DLSLLIPEIEDVYSSRYLRPSASPITVNVNCTNPGTRYCWMSTGLYIPGRQVIDVSVPES : : . .. . : : : ::::..: :::: : :::::::. : ..:: : mFLJ00 DCSQIAHNLSSQTCSSNLSSSEHPITVEINGTNPGDRDVWMSTGLYLLEGQSTEISVSEP 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 AASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCLDKPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKL :::: ::.:::::::::: : ::::.:.: .::... .:..::::::::::::.. .: mFLJ00 AASAGLKVQIGCHTDDLTFAIKLFRAPVVTYQCCMNRTQRSVSCLWGGLLYIIVPKGCQL 650 660 670 680 690 700 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 GSVPLTVKGAVRAPFYKLGETSKEEWKRRLLEYPGPWGELATDNIILTVPTANLRTLENP : : .:. .:: ::.::::.:: :::: . . ::::::::::.:::::::.:.::::: mFLJ00 GPVSVTITNAVPAPYYKLGKTSLEEWKSCIQKNLGPWGELATDNVILTVPTASLKTLENP 710 720 730 740 750 760 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 EPLLRLWDEMMQAVAKLGGETFPLRLPQRIVADVQISVGWMHAGYPIMCHLESVQELINE ::::.::::::::::.:... ::.. :.:::::::.:.::::.:::::::.::::::.. mFLJ00 EPLLQLWDEMMQAVARLASQPFPFQRPERIVADVQLSAGWMHSGYPIMCHMESVQELVSL 770 780 790 800 810 820 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 KLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATCNLWCVYVHETVLGIPRSRANIALWP ::.::::::.::::.::: . ::::::::::::::: ::::::::::::..:. : : mFLJ00 ANIRSKGLWGPIHELGHNQQCRGWEFPPHTTEATCNLWSVYVHETVLGIPRAQAHPQLKP 830 840 850 860 870 880 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 PVREKRVRIYLSKGPSVKHWNAWTALETYLQLQEAFGWEPFIRLFTEYRNQTTSSSPPSD ::::.. .:.:: ...::.::::::::::::.::::::: ::.::. : : : mFLJ00 EEREKRIKEHLQKGAPLQNWNVWTALETYLQLQEVFGWEPFITLFAEYQ---TIFYIPED 890 900 910 920 930 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 NVDKMNLWVKMFSQQVQRNLAPFFEAWGWPIQKEVATSLAYLPEWKENIMKLYLLTQM : :::.:.:.::..::.::.::::::::::::.:: .:: : :... ...:. mFLJ00 NECKMNIWLKLFSEKVQKNLVPFFEAWGWPIQKDVAEDLACYPSWEDHPLRMYMGSE 940 950 960 970 980 990 952 residues in 1 query sequences 1768065 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:27:34 2006 done: Mon Mar 27 10:27:36 2006 Scan time: 0.980 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]