FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0405.ptfa, 637 aa vs ./tmplib.26680 library 1768380 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0868+/-0.00605; mu= -0.5062+/- 0.401 mean_var=220.1911+/-53.362, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0864 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 1656 220 7.5e-58 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 405 64 6.7e-11 mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 ( 721) 356 57 5e-09 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 323 53 9.2e-08 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 322 54 1.6e-07 mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 ( 839) 315 52 1.9e-07 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 319 53 2.1e-07 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 306 52 6.1e-07 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 289 49 1.8e-06 mKIAA1916 ( 588 res) mbg08812 ( 588) 271 47 6.8e-06 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 274 48 1.1e-05 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 264 46 1.2e-05 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 253 45 3.8e-05 mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 ( 833) 223 41 0.00055 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 222 41 0.00058 mKIAA0012 ( 727 res) msj04008 ( 727) 221 41 0.00059 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 212 39 0.001 mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 ( 619) 205 39 0.0021 mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 ( 491) 200 38 0.0028 >>mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 (663 aa) initn: 1859 init1: 1379 opt: 1656 Z-score: 1130.9 bits: 219.5 E(): 7.5e-58 Smith-Waterman score: 1989; 46.841% identity (48.796% ungapped) in 649 aa overlap (1-637:29-663) 10 20 mKIAA0 LGLYLQVSKL----LACPSVCRCDRNFVYCNE .::..::. : .:::::::: .:.:::. mKIAA1 QKLPAIIKTSTLLTMISPAWSLFLIGTKIGLFFQVAPLSVVAKSCPSVCRCDAGFIYCND 10 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 RSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNV :::::.:.:::: .:.:::.::::::.:.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: : mKIAA1 RSLTSIPVGIPEDATTLYLQNNQINNVGIPSDLKNLLKVQRIYLYHNSLDEFPTNLPKYV 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 RVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHL . ::::::::.::. .:... ::::::::::.:.:..:.::::.. :.:::::.::: mKIAA1 KELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHL 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 SSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTK :..: ::: ..:::.:.:::..::. ....::::.::..:::::.:.:... .: .:.. mKIAA1 STIPGGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLHGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVN 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 LKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRML : :.:.:::::. : .:::: : .::::::.::..: .::. ::.: :::.:::.: : mKIAA1 LTELSLVRNSLTAAPVNLPGTSLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNL 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 TQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVR ::.:: :.:. :: :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.:::::.. mKIAA1 PQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIK 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSPTLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTI--P .:. .:..: . :. ::.. :: :. . :. .. :::. .: : : : mKIAA1 DLSAELFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTAYPAQGQW---PAPV-TKQPDIKNP 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 DWDGRERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQE .:.: : . : .... :. .:..:: . . : .:.:.:.::: . : . : mKIAA1 KLIKDQRTTGSPSRKTILITVKSVTPDTIHISWRLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITE 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 RIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRTVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTAS ::.::... .. :::.: ::.:.::... : ..: .: :. : . : ..: . mKIAA1 TIVTGERSEYLVTALEPESPYRVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETQTAPLRMYNPTTTLN 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 SHEQTTSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR-K ... .. .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..: :.. :..::: : mKIAA1 REQEKEPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVSIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRK 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 DDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTD--CHIPN ::: ::::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. ::: : . . . mKIAA1 DDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNLSESSS 590 600 610 620 630 640 630 mKIAA0 NMRYCNSSVPDLEHCHT : : .:..:: .: :. mKIAA1 NRSYRDSGIPDSDHSHS 650 660 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 554 init1: 244 opt: 405 Z-score: 288.1 bits: 63.5 E(): 6.7e-11 Smith-Waterman score: 470; 29.944% identity (34.084% ungapped) in 354 aa overlap (13-357:47-366) 10 20 30 40 mKIAA0 LGLYLQVSKLLACPSVCRCDRNF--VYCNERSLTSVPLGIPE ::::: :. .: : : ...: :: :: mKIAA1 RFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICVRKNLREVPDGIST 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 GVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENNIQT .. .: ::.::: .. .:.: . . .....:.:..:.:.: mKIAA1 NTRLLNLHENQI-------QIIKVNSFKHL---------------RHLEILQLSRNHIRT 80 90 100 110 110 120 130 140 150 mKIAA0 ISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVG----LP : .:. : .:. :.: :: ..:. .::: .:: :.: .: . :.: .: mKIAA1 IEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTTI--PNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIP 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 VDLQELRVDE-NRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIV .:..: . : .:.. ::. ::..:..:. : :: . ... : :: :... mKIAA1 -SLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYL----NLAMCNLREIPNLTPLIKLDELDLS 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 RNSLSHP-PPDLPGT-HLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF : :: : .. : :: .:.. ..::. : .:: ::..: ......:.: .: . .: mKIAA1 GNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPHDLF 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 DHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN : .:... ..::: :.:.: :.. :.. . : .. :. : ...: . ::..: mKIAA1 TPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIRDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGELDQN 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 LLSCPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSPTLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRER ..: . ::.. :. .. : mKIAA1 YFTCYA-----PVIVEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSVSWITPNGTVMTHGAYKVR 350 360 370 380 390 400 >>mKIAA1497 ( 721 res) mid15001 (721 aa) initn: 172 init1: 136 opt: 356 Z-score: 254.4 bits: 57.5 E(): 5e-09 Smith-Waterman score: 384; 24.258% identity (28.719% ungapped) in 573 aa overlap (22-528:106-655) 10 20 30 40 50 mKIAA0 LGLYLQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQ .: : .. : :. .:.:.:..:: mKIAA1 SSDTQVLLLQSNNIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQ 80 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 mKIAA0 INNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLP---KNVRVLHLQENNIQTISRAALAQ :.. :....... .:. ::.. . : ::. :::. :....:. . . mKIAA1 ISEMT-DYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDS 140 150 160 170 180 190 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 LLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVP----VGLPVDLQELRV .:: : . .: . .:. : :: .:. : :. .:..:: ::: .:. : mKIAA1 TPNLEILMIGENPV--IGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLD-SLESLSF 200 210 220 230 240 250 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 DENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLS---- .:.. . ..:.:.. .:. : .. : . . : :: :... .:::..: :... mKIAA1 YDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHK--IQEGDFKNMLRLKELGI--NNMGELVS 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 mKIAA0 ---HPPPDLPGTHLIRLYLQDN-QINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHL . .:: .: .: .: ....: :: .. :: : ..:: : . : . . : mKIAA1 VDRYALDNLP--ELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESL 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 mKIAA0 SNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFM------CQGPEQVRGMAVRE- ::.... ..:: ::: :.:.. .. :.: :: : : . ::. :.: mKIAA1 PNLREISIHSNPLRCDCVIHWINS------NKTNIR-FMEPLSMFCAMPPEYRGQQVKEV 370 380 390 400 410 330 340 350 360 mKIAA0 ---------------------LNMNL-----LSC---PTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQS :::.. :.: : . :: . .. : : mKIAA1 LIQDSSEQCLPMISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLS 420 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 mKIAA0 PTLSVPSPSRGSVPPAPTPSK------LPTIPDWDGRE---RVTPPISERIQLSIHFVND .. : . . .. .. : : .:. . . :. .:.. mKIAA1 DKYKLSSEGTLEIANIQIEDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLLDGAQVLKIYVKQ 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 mKIAA0 T---SIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGG-IVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYR : :: ::: .::. .: : . .. . :. : . .. .:..:.: . :. mKIAA1 TESHSILVSWKVNSNVMTSNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYE 540 550 560 570 580 590 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 ICLVPLDAFNYRTVEDTICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQTTSHS--MGSPFLLAGLIG .::. .. .. .: .. . . : : :. :.:: .:. . ::: : . .: . mKIAA1 VCLT-VSNIHQQTQKSCVNVTTKTAAFALD-----ISDHETSTALAAVMGSMFAVISLAS 600 610 620 630 640 650 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 GAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQ :. mKIAA1 IAIYIAKRFKRKNYHHSLKKYMQKTSSIPLNELYPPLINLWEADSDKDKDGSADTKPTQV 660 670 680 690 700 710 >>mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 (785 aa) initn: 284 init1: 180 opt: 323 Z-score: 231.7 bits: 53.4 E(): 9.2e-08 Smith-Waterman score: 323; 27.559% identity (28.807% ungapped) in 254 aa overlap (148-398:82-327) 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 DDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAF : :: :::... : .. :.:.:. :: mKIAA1 ALLGVVRACPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSANKITVLRRGAF 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 QNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPP-PDLPGTHLIRLY- :.:.. : . . . . . :... :..::.... .: .:. : :: . ..: mKIAA1 VNVTQVTSLWLAHSEV--RTVESGALAVLSQLKNLDLSHNLISNFPWSDLRNLSALQLLK 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 LQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSI .. :... .: :.. : :. : :.::.:: : :.:: :: :..: .::. :.:.. mKIAA1 MNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTFDALSALSHLQLYHNPFHCSCGL 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 KWVTEWLKYIPSSL-NVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTV :. : :: . .. : .: ...:. :..: : : . : . : . mKIAA1 VWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPA--LPCAPPSVRLSAEPPPEAPG 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 SPTTQSPTLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSI .: . .. . ..: :.: . :: : ..::. mKIAA1 TPLRAGLAFMLHCVAEGH--PTPRLQWQLQIPG--GTVVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEG 290 300 310 320 330 340 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 QVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLD mKIAA1 DGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGIYTCRAHNELG 350 360 370 380 390 400 >>mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557 aa) initn: 658 init1: 185 opt: 322 Z-score: 227.3 bits: 53.6 E(): 1.6e-07 Smith-Waterman score: 366; 24.798% identity (28.873% ungapped) in 496 aa overlap (32-519:35-468) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 GLYLQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAEL .: :. :: .:. ... .. :: mKIAA0 APDGDGQRLRPSGTRTGHGEGTMALTPQRGSSSGLSRPELWLLLWAAAWRLGATACPALC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 HNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNS . . :: .:. :. .: :.:.:.. :.:. ::: : . .: : .:. :.: .:. mKIAA0 TCTGT--TVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 ISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLT :..: : ::: . .: .:..::...:.. :. .. ::: mKIAA0 IGAV--ERGAFDD---MK------------------ELERLRLNRNQLQVLPELLFQNNQ 130 140 150 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 SLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQI .: :: .. :.: ... . .: : ::. : :. :.: mKIAA0 ALSRLDLSENFL--QAVPRKAFRGATDLKN----------------------LQLDKNRI 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 NHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEW . : :: :: :: : ..::.. . . :.:. .:. . ..: :::: . :...: mKIAA0 SCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQW 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 mKIAA0 LKYIPSSLNVRGF-MCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTT--TPGLPVFTPAPSTVSPTT :. :. . : .:.:: ..::. : :.. . .:: . : :. : . .. mKIAA0 LRQRPT---IGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKGEFSCSGQGEAAGAPACTLSSGSCPAMC 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 QSPTLSVPSPSRG-SVPPAPTPSKLPTIP-DWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQV . . : ..: .. :: : . : . .: . . :: . ... .. .. :. mKIAA0 SCSSGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSI-PPGAFSPYRKLRRIDLSNNQI 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 SWLS--LFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLD . .. : . . : .:.... : : : :.:. :. . :. : : mKIAA0 AEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITD---LPRGVFGGLYTLQLLLLNANKIN--CIRP-D 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 AFNYRTVED-TICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQTTSHSMGSPFLLAGLIGGAVIFVLV :: . ... .. : .. . : .:. :. :: : .::. mKIAA0 AF--QDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTL-HLAQNPFICDCNLKWLADFLRT 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 VLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQ mKIAA0 NPIETTGARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTEDYHLNSECTSDVACPHK 490 500 510 520 530 540 >>mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 (839 aa) initn: 209 init1: 209 opt: 315 Z-score: 225.9 bits: 52.4 E(): 1.9e-07 Smith-Waterman score: 315; 28.226% identity (30.568% ungapped) in 248 aa overlap (139-376:294-532) 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 LLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSV---PVGLPVDLQELRVD : ..:..:... : . :. :.. mKIAA0 LQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYITVVRRTDFLEATGLDLLHLG 270 280 290 300 310 320 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 ENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSH .:::..:.: :: .: .:.:: ..:: . .. : : .:. .....:. . mKIAA0 NNRISMIQDRAFGDLGNLRRLYLNGNRIER--LSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQAG 330 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 PPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRML-TQGVFDHLSNLK .:. .: :.:..::.. .: .:..: : ::.. .:.. : ..::.:.:..: mKIAA0 TFDPVPNLQL--LFLNNNQLQAMPSGVFSGLTLL-RLNLRGNSFTSLPVSGVLDQLTSLI 390 400 410 420 430 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 QLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTT :. ..::: : :.. . :.. . .. : .:..:.. .: .. .:: :: mKIAA0 QIDLHDNPWDCTCDVVGMKLWIEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETYMRSIKSELL-CPDY 440 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 mKIAA0 TPGLPVFTPAPSTVS-PT-TQSPTLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRERVTPPI . . : ::.::... :. :.. : .: : :. :: mKIAA0 SD-VVVSTPTPSSIQVPSRTNAATPAVRLNSTGT--PAGLGAGTGASSVPLSVLILSLLL 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 SERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLV mKIAA0 VFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGGGGGHPHAHV 560 570 580 590 600 610 >>mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593 aa) initn: 602 init1: 205 opt: 319 Z-score: 225.1 bits: 53.2 E(): 2.1e-07 Smith-Waterman score: 334; 26.064% identity (30.721% ungapped) in 376 aa overlap (50-420:89-412) 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 DRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDE :.. . ::. : :: .: : mKIAA4 SFKARSLLGKMSGIGWQTLSLSLGLVLSILNKVAPQACPAQCSCSGS--TVDCHGLALRS 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 FPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLK : :.:.:.. : :. ::: :.. .: : .:. :.: .: :::. : :::.. :: mKIAA4 VPRNIPRNTERLDLNGNNITRITKIDFAGLRHLRVLQLMENRISTI--ERGAFQD---LK 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 LLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIA .:..::...: . .. .. : . ..: :: .. : . ..: mKIAA4 ------------------ELERLRLNRNNLQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQI--QAIP 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 EGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLD . .: . .:. : :. :::. : :: :: :: : mKIAA4 RKAFRGAVDIKN----------------------LQLDYNQISCIEDGAFRALRDLEVLT 220 230 240 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 ISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPS-SLNVRGFMCQG ..::.. :. . :.:. .:. . ..: .::: . :...::. : .: .. :.: mKIAA4 LNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHLAWLSDWLRQRPRVGLYTQ---CMG 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 PEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSPTLS---VPSPSRG-SVP : ..:: : :.. . : : : .: . : : : ..: . mKIAA4 PSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEI 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 PAPTPSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKM :. : . : .. :: :: . ... .. .. :.: :. mKIAA4 PTNLPETITEIRLEQNSIRVIPPGAFSPYKKLRRLDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLV 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 GHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRTVEDTICSEATTHAS mKIAA4 LYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKINCLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTVAKG 430 440 450 460 470 480 >>mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431 aa) initn: 318 init1: 194 opt: 306 Z-score: 217.0 bits: 51.5 E(): 6.1e-07 Smith-Waterman score: 306; 31.250% identity (32.864% ungapped) in 224 aa overlap (155-375:13-228) 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 VGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLE :: :.: . ::: :. ::. : ::. mKIAA0 ARRQKRQCRESSLPRTQQHLDLRFNRIREIQPGAFRRLRSLN 10 20 30 40 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 RLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSL-SHPPPDLPG-THLIRLYLQDNQIN :....: . : : .:.: : .:: . . .: . : . : . : .:::. :::. mKIAA0 TLLLNNNQI--KKIPNGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIE 50 60 70 80 90 100 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 HIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWL . .: .: ::::: . ::.. : :.:..: ..:.: .: ::: : :... : mKIAA0 TLDPESFQHLPKLERLFLHNNRITHLIPGTFSQLESMKRLRLDSNALHCDCEILWLADLL 110 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 KYIPSSLNVRGFM-CQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSP : .: :... :. :....: .: .. . :.: : .: :. .. :. . mKIAA0 KTYAQSGNAQAAATCEYPRRIQGRSVATITPEELNCER-----PRITSEPQDADVTSGN- 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 TLSVPSPSRGSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSL :. ..:. : mKIAA0 TVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQEADEGVYQCMAKN 220 230 240 250 260 270 >>mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 (837 aa) initn: 289 init1: 109 opt: 289 Z-score: 208.4 bits: 49.2 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 396; 28.125% identity (34.426% ungapped) in 448 aa overlap (13-393:86-518) 10 20 30 mKIAA0 LGLYLQVSKLLACPSVCRCDR-NFVYCNERSLTSVP----LG :: : :.. . . :..:.: .:: : mKIAA0 GRAAMEGVGAVRFWLVVCGCLAFPPRAESVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRAVPKTSSLP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 IPEGVTVLYLHNNQINN-AGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEF-PMNLPKNVRV--LHL :. : . : .: :.: ..: ..: . ... . : ::. . : .. : :. :.: mKIAA0 SPQDVLTYSLGGNFITNITAF--DFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVP- .: .:.. ..:: : ::. :. . : :. .. :.:. :: : :. : :...: mKIAA0 GNNLLQALVPGTLAPLRKLRILYANGNEIGRLS--RGSFEGLESLVKLRLDGNVLGALPD 180 190 200 210 220 230 160 170 180 mKIAA0 -VGLPV-DLQELRVDENRIAVISDMAFQ--------NLT------------------SLE : :. .: :... ::: .. ::. ::. :: mKIAA0 AVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFSQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFVPLRSLS 240 250 260 270 280 290 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 RLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPD-LPGTHLIR-LYLQDNQIN ::...: : . : .:.:: .: .:. :.:.: :. . : . .: : :. :..: mKIAA0 TLILSANSLQHLG--PRVFQHLPRLGLLSLSGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLN 300 310 320 330 340 250 260 270 280 mKIAA0 HIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNN-------------P- ..::: . :..:: ::.:.:.: : ..: : . :..:. :.: : mKIAA0 QLPLTLLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHQGRLRELSLRDNALSALSGDIFAASPA 350 360 370 380 390 400 290 300 310 320 330 mKIAA0 ----------WFCDCSIKWVTEWLKYIPSS--LNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLS : ::: .. . .:. :. : . .:. : .:: . :. .::. mKIAA0 LYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGNWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQLLQ 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 CPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSPTLSVPSPSR-GSVPPAPTPSKLPTIPDWDGRERVT . . :.:: .. . : : .:. :. : .::: ..:: :. . ..: mKIAA0 NGSCVD------PSPSPTAGSRQWP---LPTSSEEGMTPPAGLSQELPLQPQPQPQQRGR 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHL mKIAA0 LLPGVAWGGAAKELVGNRSALRLSRRGPGPHQGPSAAAPGSAPQSLDLHEKPGRGRHTRA 530 540 550 560 570 580 >>mKIAA1916 ( 588 res) mbg08812 (588 aa) initn: 304 init1: 209 opt: 271 Z-score: 198.2 bits: 46.8 E(): 6.8e-06 Smith-Waterman score: 271; 30.612% identity (32.609% ungapped) in 196 aa overlap (179-369:105-293) 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 SSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTK ...:: .:.:..: : . :::: . mKIAA1 RLARCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVPGDISSLS--LVNGTFLE---IKDRMFSHLPS 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 LKEFSIVRNSLSHPPPD-LPGT-HLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLR :. . . ::.. : . : :: :... :.:. : .:: .:: : .:...::... mKIAA1 LQLLLLNSNSFTVIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIK 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 MLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMA : . ::. :..: .: :.: . :::. ::. :::. :. : .: :: . . mKIAA1 ALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWLKMTNST--VSDVLCIGPPEYQEKK 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 VRELNMNLLSCPTTTPGLPVFTPAPSTVSPTTQSPT---LSVPSPSRGSVPPAPTPSKLP . :.. : :: . : :. : .: . ... .:: mKIAA1 LNEVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEM 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 TIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIV mKIAA1 NFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRIS 310 320 330 340 350 360 637 residues in 1 query sequences 1768380 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:20:02 2006 done: Mon Mar 27 10:20:03 2006 Scan time: 0.810 Display time: 0.290 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]